RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494045.5

REXO4-206, Transcript of REX4 homolog, 3'-5' exonuclease, humanhuman

TSL 3

Gene REXO4, Length 743 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4-206ENST00000494045 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.72■■■■■ 7.63
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REXO4-206ENST00000494045 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.01■■■■■ 6.08
REXO4-206ENST00000494045 NACADO15069 1562 aa52.74■■■■■ 6.03
REXO4-206ENST00000494045 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.74■■■■■ 6.03
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REXO4-206ENST00000494045 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.12■■■■■ 5.93
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REXO4-206ENST00000494045 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.84■■■■■ 5.89
REXO4-206ENST00000494045 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.56■■■■■ 5.84
REXO4-206ENST00000494045 SCRIBQ14160 1630 aa51.11■■■■■ 5.77
REXO4-206ENST00000494045 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.71■■■■■ 5.71
REXO4-206ENST00000494045 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.22■■■■■ 5.63
REXO4-206ENST00000494045 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.21■■■■■ 5.63
REXO4-206ENST00000494045 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.02■■■■■ 5.6
REXO4-206ENST00000494045 NCAPD3P42695 1498 aa48.74■■■■■ 5.39
REXO4-206ENST00000494045 SMARCA4P51532 1647 aa48.73■■■■■ 5.39
REXO4-206ENST00000494045 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.69■■■■■ 5.39
REXO4-206ENST00000494045 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.6■■■■■ 5.37
REXO4-206ENST00000494045 SMARCA2P51531 1590 aa48.5■■■■■ 5.35
REXO4-206ENST00000494045 HMGXB3Q12766 1538 aa48.38■■■■■ 5.34
REXO4-206ENST00000494045 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.38■■■■■ 5.33
REXO4-206ENST00000494045 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.23■■■■■ 5.31
REXO4-206ENST00000494045 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.21■■■■■ 5.31
REXO4-206ENST00000494045 NESP48681 1621 aa47.96■■■■■ 5.27
REXO4-206ENST00000494045 ERCC6Q03468 1493 aa47.93■■■■■ 5.26
REXO4-206ENST00000494045 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.85■■■■■ 5.25
REXO4-206ENST00000494045 WIZO95785 1651 aa47.85■■■■■ 5.25
REXO4-206ENST00000494045 CUX2O14529 1486 aa47.64■■■■■ 5.22
REXO4-206ENST00000494045 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.52■■■■■ 5.2
REXO4-206ENST00000494045 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.32■■■■■ 5.17
REXO4-206ENST00000494045 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.29■■■■■ 5.16
REXO4-206ENST00000494045 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.28■■■■■ 5.16
REXO4-206ENST00000494045 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.26■■■■■ 5.16
REXO4-206ENST00000494045 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.25■■■■■ 5.15
REXO4-206ENST00000494045 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.18■■■■■ 5.14
REXO4-206ENST00000494045 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.87■■■■■ 5.09
REXO4-206ENST00000494045 CFTRP13569 1480 aa46.85■■■■■ 5.09
REXO4-206ENST00000494045 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.8■■■■■ 5.08
REXO4-206ENST00000494045 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.78■■■■■ 5.08
REXO4-206ENST00000494045 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.78■■■■■ 5.08
REXO4-206ENST00000494045 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.76■■■■■ 5.08
REXO4-206ENST00000494045 WDR62O43379 1518 aa46.72■■■■■ 5.07
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REXO4-206ENST00000494045 PRDM2Q13029 1718 aa46.31■■■■■ 5
REXO4-206ENST00000494045 TOPBP1Q92547 1522 aa45.95■■■■■ 4.95
REXO4-206ENST00000494045 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.8■■■■■ 4.92
REXO4-206ENST00000494045 IFT140Q96RY7 1462 aa45.8■■■■■ 4.92
REXO4-206ENST00000494045 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.78■■■■■ 4.92
REXO4-206ENST00000494045 ABCC8Q09428 1581 aa45.75■■■■■ 4.91
REXO4-206ENST00000494045 OSCARQ8IYS5 282 aa45.58■■■■■ 4.89
REXO4-206ENST00000494045 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.52■■■■■ 4.88
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REXO4-206ENST00000494045 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.49■■■■■ 4.87
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REXO4-206ENST00000494045 CUX1P39880 1505 aa45.37■■■■■ 4.85
REXO4-206ENST00000494045 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.3■■■■■ 4.84
REXO4-206ENST00000494045 SOGA1O94964 1423 aa45.3■■■■■ 4.84
REXO4-206ENST00000494045 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.22■■■■■ 4.83
REXO4-206ENST00000494045 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.11■■■■■ 4.81
REXO4-206ENST00000494045 CHD1O14646 1710 aa45.06■■■■■ 4.8
REXO4-206ENST00000494045 FBLN2P98095 1184 aa45.02■■■■■ 4.8
REXO4-206ENST00000494045 SYNJ1O43426 1573 aa44.99■■■■■ 4.79
REXO4-206ENST00000494045 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.97■■■■■ 4.79
REXO4-206ENST00000494045 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.97■■■■■ 4.79
REXO4-206ENST00000494045 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.97■■■■■ 4.79
REXO4-206ENST00000494045 TOP2BQ02880 1626 aa44.97■■■■■ 4.79
REXO4-206ENST00000494045 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.95■■■■■ 4.79
REXO4-206ENST00000494045 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.94■■■■■ 4.79
REXO4-206ENST00000494045 WDR97A6NE52 1622 aa44.91■■■■■ 4.78
REXO4-206ENST00000494045 ARHGEF11O15085 1522 aa44.88■■■■■ 4.78
REXO4-206ENST00000494045 GRIN2BQ13224 1484 aa44.83■■■■■ 4.77
REXO4-206ENST00000494045 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.77■■■■■ 4.76
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REXO4-206ENST00000494045 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.71■■■■■ 4.75
REXO4-206ENST00000494045 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.67■■■■■ 4.74
REXO4-206ENST00000494045 PBRM1Q86U86 1689 aa44.67■■■■■ 4.74
REXO4-206ENST00000494045 SYNJ2O15056 1496 aa44.63■■■■■ 4.73
REXO4-206ENST00000494045 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.56■■■■■ 4.72
REXO4-206ENST00000494045 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.56■■■■■ 4.72
REXO4-206ENST00000494045 ARAP1Q96P48 1450 aa44.52■■■■■ 4.72
REXO4-206ENST00000494045 ADAMTS12P58397 1594 aa44.31■■■■■ 4.68
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REXO4-206ENST00000494045 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.2■■■■■ 4.67
REXO4-206ENST00000494045 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.19■■■■■ 4.66
REXO4-206ENST00000494045 KIF27Q86VH2 1401 aa44.16■■■■■ 4.66
REXO4-206ENST00000494045 CEP170Q5SW79 1584 aa44.14■■■■■ 4.66
REXO4-206ENST00000494045 NUP160Q12769 1436 aa44.11■■■■■ 4.65
REXO4-206ENST00000494045 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.01■■■■■ 4.64
REXO4-206ENST00000494045 IGF1RP08069 1367 aa43.98■■■■■ 4.63
REXO4-206ENST00000494045 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.9■■■■■ 4.62
REXO4-206ENST00000494045 SHROOM2Q13796 1616 aa43.84■■■■■ 4.61
REXO4-206ENST00000494045 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.83■■■■■ 4.61
REXO4-206ENST00000494045 CUL7Q14999 1698 aa43.8■■■■■ 4.6
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