RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493566.1

UBXN7-206, Transcript of UBX domain protein 7, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UBXN7, Length 921 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7-206ENST00000493566 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.47■■■■■ 5.19
UBXN7-206ENST00000493566 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.49■■■■■ 4.39
UBXN7-206ENST00000493566 ABCC9O60706 1549 aa42.15■■■■■ 4.34
UBXN7-206ENST00000493566 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.26■■■■■ 4.04
UBXN7-206ENST00000493566 NACADO15069 1562 aa40.06■■■■■ 4
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UBXN7-206ENST00000493566 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.63■■■■□ 3.93
UBXN7-206ENST00000493566 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.48■■■■□ 3.91
UBXN7-206ENST00000493566 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.42■■■■□ 3.9
UBXN7-206ENST00000493566 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.32■■■■□ 3.89
UBXN7-206ENST00000493566 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.27■■■■□ 3.88
UBXN7-206ENST00000493566 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.24■■■■□ 3.87
UBXN7-206ENST00000493566 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.16■■■■□ 3.86
UBXN7-206ENST00000493566 SCRIBQ14160 1630 aa38.71■■■■□ 3.79
UBXN7-206ENST00000493566 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.58■■■■□ 3.77
UBXN7-206ENST00000493566 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.13■■■■□ 3.69
UBXN7-206ENST00000493566 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.12■■■■□ 3.69
UBXN7-206ENST00000493566 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.93■■■■□ 3.66
UBXN7-206ENST00000493566 NCAPD3P42695 1498 aa36.99■■■■□ 3.51
UBXN7-206ENST00000493566 SMARCA4P51532 1647 aa36.98■■■■□ 3.51
UBXN7-206ENST00000493566 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.92■■■■□ 3.5
UBXN7-206ENST00000493566 SMARCA2P51531 1590 aa36.81■■■■□ 3.48
UBXN7-206ENST00000493566 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.81■■■■□ 3.48
UBXN7-206ENST00000493566 HMGXB3Q12766 1538 aa36.75■■■■□ 3.47
UBXN7-206ENST00000493566 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.64■■■■□ 3.46
UBXN7-206ENST00000493566 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.6■■■■□ 3.45
UBXN7-206ENST00000493566 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.55■■■■□ 3.44
UBXN7-206ENST00000493566 NESP48681 1621 aa36.34■■■■□ 3.41
UBXN7-206ENST00000493566 ERCC6Q03468 1493 aa36.31■■■■□ 3.4
UBXN7-206ENST00000493566 CUX2O14529 1486 aa36.19■■■■□ 3.38
UBXN7-206ENST00000493566 WIZO95785 1651 aa36.19■■■■□ 3.38
UBXN7-206ENST00000493566 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.1■■■■□ 3.37
UBXN7-206ENST00000493566 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.93■■■■□ 3.34
UBXN7-206ENST00000493566 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
UBXN7-206ENST00000493566 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.91■■■■□ 3.34
UBXN7-206ENST00000493566 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.85■■■■□ 3.33
UBXN7-206ENST00000493566 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.83■■■■□ 3.33
UBXN7-206ENST00000493566 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.83■■■■□ 3.33
UBXN7-206ENST00000493566 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
UBXN7-206ENST00000493566 CFTRP13569 1480 aa35.54■■■■□ 3.28
UBXN7-206ENST00000493566 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.54■■■■□ 3.28
UBXN7-206ENST00000493566 WDR62O43379 1518 aa35.48■■■■□ 3.27
UBXN7-206ENST00000493566 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.45■■■■□ 3.27
UBXN7-206ENST00000493566 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.45■■■■□ 3.27
UBXN7-206ENST00000493566 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.31■■■■□ 3.24
UBXN7-206ENST00000493566 PRDM2Q13029 1718 aa35.27■■■■□ 3.24
UBXN7-206ENST00000493566 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
UBXN7-206ENST00000493566 TOPBP1Q92547 1522 aa34.84■■■■□ 3.17
UBXN7-206ENST00000493566 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.74■■■■□ 3.15
UBXN7-206ENST00000493566 IFT140Q96RY7 1462 aa34.73■■■■□ 3.15
UBXN7-206ENST00000493566 ABCC8Q09428 1581 aa34.73■■■■□ 3.15
UBXN7-206ENST00000493566 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.7■■■■□ 3.14
UBXN7-206ENST00000493566 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.55■■■■□ 3.12
UBXN7-206ENST00000493566 OSCARQ8IYS5 282 aa34.54■■■■□ 3.12
UBXN7-206ENST00000493566 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
UBXN7-206ENST00000493566 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
UBXN7-206ENST00000493566 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
UBXN7-206ENST00000493566 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.39■■■■□ 3.11e-6■■□□□ 11.4
UBXN7-206ENST00000493566 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.37■■■■□ 3.09
UBXN7-206ENST00000493566 CUX1P39880 1505 aa34.36■■■■□ 3.09
UBXN7-206ENST00000493566 TRIM41Q8WV44 630 aa34.32■■■■□ 3.08
UBXN7-206ENST00000493566 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.32■■■■□ 3.08
UBXN7-206ENST00000493566 SOGA1O94964 1423 aa34.3■■■■□ 3.08
UBXN7-206ENST00000493566 CHD1O14646 1710 aa34.24■■■■□ 3.07
UBXN7-206ENST00000493566 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
UBXN7-206ENST00000493566 WDR97A6NE52 1622 aa34.17■■■■□ 3.06
UBXN7-206ENST00000493566 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.15■■■■□ 3.06
UBXN7-206ENST00000493566 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.15■■■■□ 3.06
UBXN7-206ENST00000493566 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.15■■■■□ 3.06
UBXN7-206ENST00000493566 ARHGEF11O15085 1522 aa34.06■■■■□ 3.04
UBXN7-206ENST00000493566 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.04■■■■□ 3.04
UBXN7-206ENST00000493566 FBLN2P98095 1184 aa34.02■■■■□ 3.04
UBXN7-206ENST00000493566 GRIN2BQ13224 1484 aa33.98■■■■□ 3.03
UBXN7-206ENST00000493566 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.96■■■■□ 3.03
UBXN7-206ENST00000493566 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.95■■■■□ 3.03
UBXN7-206ENST00000493566 PBRM1Q86U86 1689 aa33.94■■■■□ 3.02
UBXN7-206ENST00000493566 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.92■■■■□ 3.02
UBXN7-206ENST00000493566 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.91■■■■□ 3.02
UBXN7-206ENST00000493566 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.9■■■■□ 3.02
UBXN7-206ENST00000493566 TOP2BQ02880 1626 aa33.89■■■■□ 3.02
UBXN7-206ENST00000493566 SYNJ1O43426 1573 aa33.88■■■■□ 3.01
UBXN7-206ENST00000493566 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.86■■■■□ 3.01
UBXN7-206ENST00000493566 SYNJ2O15056 1496 aa33.84■■■■□ 3.01
UBXN7-206ENST00000493566 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.84■■■■□ 3.01
UBXN7-206ENST00000493566 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.82■■■■□ 3
UBXN7-206ENST00000493566 ARAP1Q96P48 1450 aa33.76■■■□□ 2.99
UBXN7-206ENST00000493566 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.72■■■□□ 2.99
UBXN7-206ENST00000493566 ADAMTS12P58397 1594 aa33.61■■■□□ 2.97
UBXN7-206ENST00000493566 GRIN2AQ12879 1464 aa33.56■■■□□ 2.96
UBXN7-206ENST00000493566 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.53■■■□□ 2.96
UBXN7-206ENST00000493566 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.48■■■□□ 2.95
UBXN7-206ENST00000493566 CEP170Q5SW79 1584 aa33.47■■■□□ 2.95
UBXN7-206ENST00000493566 NUP160Q12769 1436 aa33.45■■■□□ 2.95
UBXN7-206ENST00000493566 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.35■■■□□ 2.93
UBXN7-206ENST00000493566 SHROOM2Q13796 1616 aa33.31■■■□□ 2.92
UBXN7-206ENST00000493566 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.2■■■□□ 2.91
UBXN7-206ENST00000493566 IGF1RP08069 1367 aa33.17■■■□□ 2.9
UBXN7-206ENST00000493566 KIF27Q86VH2 1401 aa33.17■■■□□ 2.9
UBXN7-206ENST00000493566 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.14■■■□□ 2.9
UBXN7-206ENST00000493566 CUL7Q14999 1698 aa33.1■■■□□ 2.89
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