RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493365.5

ABTB1-214, Transcript of ankyrin repeat and BTB domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene ABTB1, Length 715 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABTB1-214ENST00000493365 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.17■■■■■ 5.46
ABTB1-214ENST00000493365 ABCC9O60706 1549 aa44.45■■■■■ 4.71
ABTB1-214ENST00000493365 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.14■■■■■ 4.66
ABTB1-214ENST00000493365 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.14■■■■■ 4.34
ABTB1-214ENST00000493365 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.03■■■■■ 4.32
ABTB1-214ENST00000493365 NACADO15069 1562 aa41.8■■■■■ 4.28
ABTB1-214ENST00000493365 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.57■■■■■ 4.25
ABTB1-214ENST00000493365 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.39■■■■■ 4.22
ABTB1-214ENST00000493365 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.26■■■■■ 4.2
ABTB1-214ENST00000493365 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.17■■■■■ 4.18
ABTB1-214ENST00000493365 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.03■■■■■ 4.16
ABTB1-214ENST00000493365 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.7■■■■■ 4.11
ABTB1-214ENST00000493365 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.57■■■■■ 4.09
ABTB1-214ENST00000493365 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.31■■■■■ 4.04
ABTB1-214ENST00000493365 SCRIBQ14160 1630 aa40.26■■■■■ 4.04
ABTB1-214ENST00000493365 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.13■■■■■ 4.02
ABTB1-214ENST00000493365 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.04■■■■■ 4
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ABTB1-214ENST00000493365 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.65■■■■□ 3.78
ABTB1-214ENST00000493365 NCAPD3P42695 1498 aa38.65■■■■□ 3.78
ABTB1-214ENST00000493365 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.52■■■■□ 3.76
ABTB1-214ENST00000493365 SMARCA4P51532 1647 aa38.39■■■■□ 3.74
ABTB1-214ENST00000493365 CUX2O14529 1486 aa38.34■■■■□ 3.73
ABTB1-214ENST00000493365 SMARCA2P51531 1590 aa38.31■■■■□ 3.72
ABTB1-214ENST00000493365 ERCC6Q03468 1493 aa38.3■■■■□ 3.72
ABTB1-214ENST00000493365 HMGXB3Q12766 1538 aa38.29■■■■□ 3.72
ABTB1-214ENST00000493365 NESP48681 1621 aa38.16■■■■□ 3.7
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ABTB1-214ENST00000493365 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.02■■■■□ 3.68
ABTB1-214ENST00000493365 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.93■■■■□ 3.66
ABTB1-214ENST00000493365 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.77■■■■□ 3.64
ABTB1-214ENST00000493365 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.76■■■■□ 3.63
ABTB1-214ENST00000493365 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.6■■■■□ 3.61
ABTB1-214ENST00000493365 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.53■■■■□ 3.6
ABTB1-214ENST00000493365 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.45■■■■□ 3.59
ABTB1-214ENST00000493365 WIZO95785 1651 aa37.44■■■■□ 3.58
ABTB1-214ENST00000493365 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.26■■■■□ 3.55
ABTB1-214ENST00000493365 WDR62O43379 1518 aa37.19■■■■□ 3.54
ABTB1-214ENST00000493365 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.05■■■■□ 3.52
ABTB1-214ENST00000493365 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.04■■■■□ 3.52
ABTB1-214ENST00000493365 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.02■■■■□ 3.52
ABTB1-214ENST00000493365 CFTRP13569 1480 aa36.99■■■■□ 3.51
ABTB1-214ENST00000493365 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.9■■■■□ 3.5
ABTB1-214ENST00000493365 TRIM41Q8WV44 630 aa36.82■■■■□ 3.48
ABTB1-214ENST00000493365 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
ABTB1-214ENST00000493365 OSCARQ8IYS5 282 aa36.57■■■■□ 3.44
ABTB1-214ENST00000493365 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.55■■■■□ 3.44
ABTB1-214ENST00000493365 PRDM2Q13029 1718 aa36.52■■■■□ 3.44
ABTB1-214ENST00000493365 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
ABTB1-214ENST00000493365 IFT140Q96RY7 1462 aa36.32■■■■□ 3.41
ABTB1-214ENST00000493365 TOPBP1Q92547 1522 aa36.31■■■■□ 3.4
ABTB1-214ENST00000493365 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.15■■■■□ 3.38
ABTB1-214ENST00000493365 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.15■■■■□ 3.38
ABTB1-214ENST00000493365 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.15■■■■□ 3.38
ABTB1-214ENST00000493365 ABCC8Q09428 1581 aa36.14■■■■□ 3.38
ABTB1-214ENST00000493365 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.12■■■■□ 3.37
ABTB1-214ENST00000493365 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
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ABTB1-214ENST00000493365 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
ABTB1-214ENST00000493365 CHD1O14646 1710 aa35.87■■■■□ 3.33
ABTB1-214ENST00000493365 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.84■■■■□ 3.33
ABTB1-214ENST00000493365 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.76■■■■□ 3.32
ABTB1-214ENST00000493365 SOGA1O94964 1423 aa35.74■■■■□ 3.31
ABTB1-214ENST00000493365 FBLN2P98095 1184 aa35.74■■■■□ 3.31
ABTB1-214ENST00000493365 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
ABTB1-214ENST00000493365 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.67■■■■□ 3.3
ABTB1-214ENST00000493365 ARAP1Q96P48 1450 aa35.67■■■■□ 3.3
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ABTB1-214ENST00000493365 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.59■■■■□ 3.29
ABTB1-214ENST00000493365 WDR97A6NE52 1622 aa35.54■■■■□ 3.28
ABTB1-214ENST00000493365 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.48■■■■□ 3.27
ABTB1-214ENST00000493365 GRIN2BQ13224 1484 aa35.44■■■■□ 3.26
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ABTB1-214ENST00000493365 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.43■■■■□ 3.26
ABTB1-214ENST00000493365 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.38■■■■□ 3.25
ABTB1-214ENST00000493365 SYNJ1O43426 1573 aa35.36■■■■□ 3.25
ABTB1-214ENST00000493365 SYNJ2O15056 1496 aa35.35■■■■□ 3.25
ABTB1-214ENST00000493365 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.29■■■■□ 3.24
ABTB1-214ENST00000493365 PBRM1Q86U86 1689 aa35.27■■■■□ 3.24
ABTB1-214ENST00000493365 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.24■■■■□ 3.23
ABTB1-214ENST00000493365 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.21■■■■□ 3.23
ABTB1-214ENST00000493365 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.21■■■■□ 3.23
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ABTB1-214ENST00000493365 GRIN2AQ12879 1464 aa35■■■■□ 3.19
ABTB1-214ENST00000493365 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.98■■■■□ 3.19
ABTB1-214ENST00000493365 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.95■■■■□ 3.19
ABTB1-214ENST00000493365 ADAMTS12P58397 1594 aa34.95■■■■□ 3.18
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ABTB1-214ENST00000493365 CEP170Q5SW79 1584 aa34.91■■■■□ 3.18
ABTB1-214ENST00000493365 NUP160Q12769 1436 aa34.91■■■■□ 3.18
ABTB1-214ENST00000493365 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.83■■■■□ 3.17
ABTB1-214ENST00000493365 SHROOM2Q13796 1616 aa34.77■■■■□ 3.16
ABTB1-214ENST00000493365 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.76■■■■□ 3.16
ABTB1-214ENST00000493365 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
ABTB1-214ENST00000493365 JPH4Q96JJ6 628 aa34.55■■■■□ 3.12
ABTB1-214ENST00000493365 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.46■■■■□ 3.11
ABTB1-214ENST00000493365 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP34.45■■■■□ 3.11
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