RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493256.1

LYSMD4-208, Transcript of LysM domain containing 4, humanhuman

TSL 3

Gene LYSMD4, Length 880 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD4-208ENST00000493256 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.27■■■■■ 6.44
LYSMD4-208ENST00000493256 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.49■■■■■ 5.51
LYSMD4-208ENST00000493256 ABCC9O60706 1549 aa49.25■■■■■ 5.48
LYSMD4-208ENST00000493256 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.98■■■■■ 5.11
LYSMD4-208ENST00000493256 NACADO15069 1562 aa46.72■■■■■ 5.07
LYSMD4-208ENST00000493256 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.5■■■■■ 5.03
LYSMD4-208ENST00000493256 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.17■■■■■ 4.98
LYSMD4-208ENST00000493256 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.98■■■■■ 4.95
LYSMD4-208ENST00000493256 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.94■■■■■ 4.95
LYSMD4-208ENST00000493256 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.89■■■■■ 4.94
LYSMD4-208ENST00000493256 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.87■■■■■ 4.93
LYSMD4-208ENST00000493256 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.67■■■■■ 4.9
LYSMD4-208ENST00000493256 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.63■■■■■ 4.9
LYSMD4-208ENST00000493256 SCRIBQ14160 1630 aa45.13■■■■■ 4.82
LYSMD4-208ENST00000493256 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.02■■■■■ 4.8
LYSMD4-208ENST00000493256 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.5■■■■■ 4.71
LYSMD4-208ENST00000493256 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.48■■■■■ 4.71
LYSMD4-208ENST00000493256 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.34■■■■■ 4.69
LYSMD4-208ENST00000493256 NCAPD3P42695 1498 aa43.13■■■■■ 4.49
LYSMD4-208ENST00000493256 SMARCA4P51532 1647 aa43.08■■■■■ 4.49
LYSMD4-208ENST00000493256 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.04■■■■■ 4.48
LYSMD4-208ENST00000493256 SMARCA2P51531 1590 aa42.93■■■■■ 4.46
LYSMD4-208ENST00000493256 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.88■■■■■ 4.45
LYSMD4-208ENST00000493256 HMGXB3Q12766 1538 aa42.84■■■■■ 4.45
LYSMD4-208ENST00000493256 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.65■■■■■ 4.42
LYSMD4-208ENST00000493256 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.63■■■■■ 4.42
LYSMD4-208ENST00000493256 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.61■■■■■ 4.41
LYSMD4-208ENST00000493256 ERCC6Q03468 1493 aa42.49■■■■■ 4.39
LYSMD4-208ENST00000493256 NESP48681 1621 aa42.39■■■■■ 4.38
LYSMD4-208ENST00000493256 CUX2O14529 1486 aa42.33■■■■■ 4.37
LYSMD4-208ENST00000493256 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.12■■■■■ 4.33
LYSMD4-208ENST00000493256 WIZO95785 1651 aa42.11■■■■■ 4.33
LYSMD4-208ENST00000493256 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.01■■■■■ 4.32
LYSMD4-208ENST00000493256 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.92■■■■■ 4.3
LYSMD4-208ENST00000493256 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.86■■■■■ 4.29
LYSMD4-208ENST00000493256 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.85■■■■■ 4.29
LYSMD4-208ENST00000493256 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.83■■■■■ 4.29
LYSMD4-208ENST00000493256 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.81■■■■■ 4.28
LYSMD4-208ENST00000493256 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
LYSMD4-208ENST00000493256 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.5■■■■■ 4.23
LYSMD4-208ENST00000493256 CFTRP13569 1480 aa41.41■■■■■ 4.22
LYSMD4-208ENST00000493256 WDR62O43379 1518 aa41.39■■■■■ 4.22
LYSMD4-208ENST00000493256 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.38■■■■■ 4.21
LYSMD4-208ENST00000493256 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.36■■■■■ 4.21
LYSMD4-208ENST00000493256 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.11■■■■■ 4.17
LYSMD4-208ENST00000493256 PRDM2Q13029 1718 aa41.03■■■■■ 4.16
LYSMD4-208ENST00000493256 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
LYSMD4-208ENST00000493256 TOPBP1Q92547 1522 aa40.62■■■■■ 4.09
LYSMD4-208ENST00000493256 IFT140Q96RY7 1462 aa40.54■■■■■ 4.08
LYSMD4-208ENST00000493256 ABCC8Q09428 1581 aa40.51■■■■■ 4.08
LYSMD4-208ENST00000493256 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.48■■■■■ 4.07
LYSMD4-208ENST00000493256 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.47■■■■■ 4.07
LYSMD4-208ENST00000493256 OSCARQ8IYS5 282 aa40.42■■■■■ 4.06
LYSMD4-208ENST00000493256 TRIM41Q8WV44 630 aa40.27■■■■■ 4.04
LYSMD4-208ENST00000493256 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
LYSMD4-208ENST00000493256 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
LYSMD4-208ENST00000493256 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.22■■■■■ 4.03
LYSMD4-208ENST00000493256 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.13■■■■■ 4.01
LYSMD4-208ENST00000493256 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.13■■■■■ 4.01
LYSMD4-208ENST00000493256 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.07■■■■■ 4
LYSMD4-208ENST00000493256 CUX1P39880 1505 aa40.02■■■■■ 4
LYSMD4-208ENST00000493256 SOGA1O94964 1423 aa40.02■■■■■ 4
LYSMD4-208ENST00000493256 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40■■■■□ 3.99
LYSMD4-208ENST00000493256 CHD1O14646 1710 aa39.92■■■■□ 3.98
LYSMD4-208ENST00000493256 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.92■■■■□ 3.98
LYSMD4-208ENST00000493256 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.91■■■■□ 3.98
LYSMD4-208ENST00000493256 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.91■■■■□ 3.98
LYSMD4-208ENST00000493256 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.91■■■■□ 3.98
LYSMD4-208ENST00000493256 WDR97A6NE52 1622 aa39.83■■■■□ 3.97
LYSMD4-208ENST00000493256 ARHGEF11O15085 1522 aa39.81■■■■□ 3.96
LYSMD4-208ENST00000493256 FBLN2P98095 1184 aa39.79■■■■□ 3.96
LYSMD4-208ENST00000493256 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.74■■■■□ 3.95
LYSMD4-208ENST00000493256 GRIN2BQ13224 1484 aa39.66■■■■□ 3.94
LYSMD4-208ENST00000493256 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.63■■■■□ 3.94
LYSMD4-208ENST00000493256 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.56■■■■□ 3.92
LYSMD4-208ENST00000493256 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.55■■■■□ 3.92
LYSMD4-208ENST00000493256 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.54■■■■□ 3.92
LYSMD4-208ENST00000493256 PBRM1Q86U86 1689 aa39.53■■■■□ 3.92
LYSMD4-208ENST00000493256 SYNJ2O15056 1496 aa39.49■■■■□ 3.91
LYSMD4-208ENST00000493256 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.49■■■■□ 3.91
LYSMD4-208ENST00000493256 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.47■■■■□ 3.91
LYSMD4-208ENST00000493256 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.47■■■■□ 3.91
LYSMD4-208ENST00000493256 SYNJ1O43426 1573 aa39.45■■■■□ 3.91
LYSMD4-208ENST00000493256 ARAP1Q96P48 1450 aa39.44■■■■□ 3.9
LYSMD4-208ENST00000493256 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.44■■■■□ 3.9
LYSMD4-208ENST00000493256 TOP2BQ02880 1626 aa39.43■■■■□ 3.9
LYSMD4-208ENST00000493256 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.43■■■■□ 3.9
LYSMD4-208ENST00000493256 ADAMTS12P58397 1594 aa39.18■■■■□ 3.86
LYSMD4-208ENST00000493256 GRIN2AQ12879 1464 aa39.15■■■■□ 3.86
LYSMD4-208ENST00000493256 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.06■■■■□ 3.84
LYSMD4-208ENST00000493256 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.06■■■■□ 3.84
LYSMD4-208ENST00000493256 CEP170Q5SW79 1584 aa39.02■■■■□ 3.84
LYSMD4-208ENST00000493256 NUP160Q12769 1436 aa39.01■■■■□ 3.84
LYSMD4-208ENST00000493256 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.94■■■■□ 3.82
LYSMD4-208ENST00000493256 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.89■■■■□ 3.82
LYSMD4-208ENST00000493256 SHROOM2Q13796 1616 aa38.82■■■■□ 3.81
LYSMD4-208ENST00000493256 KIF27Q86VH2 1401 aa38.65■■■■□ 3.78
LYSMD4-208ENST00000493256 IGF1RP08069 1367 aa38.62■■■■□ 3.77
LYSMD4-208ENST00000493256 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.62■■■■□ 3.77
LYSMD4-208ENST00000493256 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.61■■■■□ 3.77
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