RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493234.1

TNNT3-214, Transcript of troponin T3, fast skeletal type, humanhuman

TSL 2

Gene TNNT3, Length 1,113 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3-214ENST00000493234 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.08■■■■■ 4.49
TNNT3-214ENST00000493234 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.21■■■■□ 3.71
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TNNT3-214ENST00000493234 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.04■■■■□ 3.36
TNNT3-214ENST00000493234 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.93■■■■□ 3.34
TNNT3-214ENST00000493234 NACADO15069 1562 aa35.91■■■■□ 3.34
TNNT3-214ENST00000493234 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
TNNT3-214ENST00000493234 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.7■■■■□ 3.31
TNNT3-214ENST00000493234 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.61■■■■□ 3.29
TNNT3-214ENST00000493234 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.18■■■■□ 3.22
TNNT3-214ENST00000493234 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.97■■■■□ 3.19
TNNT3-214ENST00000493234 SCRIBQ14160 1630 aa34.94■■■■□ 3.18
TNNT3-214ENST00000493234 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.88■■■■□ 3.17
TNNT3-214ENST00000493234 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.41■■■■□ 3.1
TNNT3-214ENST00000493234 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.25■■■■□ 3.07
TNNT3-214ENST00000493234 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.93■■■■□ 3.02
TNNT3-214ENST00000493234 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.79■■■■□ 3
TNNT3-214ENST00000493234 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.61■■■□□ 2.97
TNNT3-214ENST00000493234 SMARCA4P51532 1647 aa33.41■■■□□ 2.94
TNNT3-214ENST00000493234 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.36■■■□□ 2.93
TNNT3-214ENST00000493234 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.24■■■□□ 2.91
TNNT3-214ENST00000493234 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.21■■■□□ 2.91
TNNT3-214ENST00000493234 NCAPD3P42695 1498 aa33.15■■■□□ 2.9
TNNT3-214ENST00000493234 SMARCA2P51531 1590 aa33.13■■■□□ 2.89
TNNT3-214ENST00000493234 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.04■■■□□ 2.88
TNNT3-214ENST00000493234 HMGXB3Q12766 1538 aa32.97■■■□□ 2.87
TNNT3-214ENST00000493234 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.93■■■□□ 2.86
TNNT3-214ENST00000493234 WIZO95785 1651 aa32.9■■■□□ 2.86
TNNT3-214ENST00000493234 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.89■■■□□ 2.86
TNNT3-214ENST00000493234 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.79
TNNT3-214ENST00000493234 NESP48681 1621 aa32.38■■■□□ 2.77
TNNT3-214ENST00000493234 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.24■■■□□ 2.75
TNNT3-214ENST00000493234 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.2■■■□□ 2.75
TNNT3-214ENST00000493234 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.75
TNNT3-214ENST00000493234 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.16■■■□□ 2.74
TNNT3-214ENST00000493234 ERCC6Q03468 1493 aa32.16■■■□□ 2.74
TNNT3-214ENST00000493234 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.03■■■□□ 2.72
TNNT3-214ENST00000493234 CFTRP13569 1480 aa32.03■■■□□ 2.72
TNNT3-214ENST00000493234 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.98■■■□□ 2.71
TNNT3-214ENST00000493234 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.84■■■□□ 2.69
TNNT3-214ENST00000493234 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.81■■■□□ 2.68
TNNT3-214ENST00000493234 PRDM2Q13029 1718 aa31.79■■■□□ 2.68
TNNT3-214ENST00000493234 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.77■■■□□ 2.68
TNNT3-214ENST00000493234 CUX2O14529 1486 aa31.75■■■□□ 2.67
TNNT3-214ENST00000493234 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.71■■■□□ 2.67
TNNT3-214ENST00000493234 WDR62O43379 1518 aa31.59■■■□□ 2.65
TNNT3-214ENST00000493234 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
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TNNT3-214ENST00000493234 ABCC8Q09428 1581 aa31.3■■■□□ 2.6
TNNT3-214ENST00000493234 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.3■■■□□ 2.6
TNNT3-214ENST00000493234 CUX1P39880 1505 aa31.17■■■□□ 2.58
TNNT3-214ENST00000493234 IFT140Q96RY7 1462 aa31.09■■■□□ 2.57
TNNT3-214ENST00000493234 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
TNNT3-214ENST00000493234 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.03■■■□□ 2.56
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TNNT3-214ENST00000493234 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.9■■■□□ 2.54
TNNT3-214ENST00000493234 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.85■■■□□ 2.53
TNNT3-214ENST00000493234 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
TNNT3-214ENST00000493234 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
TNNT3-214ENST00000493234 WDR97A6NE52 1622 aa30.76■■■□□ 2.51
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TNNT3-214ENST00000493234 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.61■■■□□ 2.49
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TNNT3-214ENST00000493234 GRIN2BQ13224 1484 aa30.57■■■□□ 2.48
TNNT3-214ENST00000493234 PBRM1Q86U86 1689 aa30.53■■■□□ 2.48
TNNT3-214ENST00000493234 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.53■■■□□ 2.48
TNNT3-214ENST00000493234 OSCARQ8IYS5 282 aa30.51■■■□□ 2.47
TNNT3-214ENST00000493234 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
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TNNT3-214ENST00000493234 CHD1O14646 1710 aa30.46■■■□□ 2.47
TNNT3-214ENST00000493234 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
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TNNT3-214ENST00000493234 SYNJ2O15056 1496 aa30.35■■■□□ 2.45
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TNNT3-214ENST00000493234 ADAMTS12P58397 1594 aa30.28■■■□□ 2.44
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TNNT3-214ENST00000493234 CEP170Q5SW79 1584 aa30.05■■■□□ 2.4
TNNT3-214ENST00000493234 NUP160Q12769 1436 aa30.05■■■□□ 2.4
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TNNT3-214ENST00000493234 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30■■■□□ 2.39
TNNT3-214ENST00000493234 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30■■■□□ 2.39
TNNT3-214ENST00000493234 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30■■■□□ 2.39
TNNT3-214ENST00000493234 ARHGEF11O15085 1522 aa30■■■□□ 2.39
TNNT3-214ENST00000493234 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.86■■■□□ 2.37
TNNT3-214ENST00000493234 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.81■■■□□ 2.36
TNNT3-214ENST00000493234 SHROOM2Q13796 1616 aa29.8■■■□□ 2.36
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