RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493115.1

DUSP15-210, Transcript of dual specificity phosphatase 15, humanhuman

TSL 3

Gene DUSP15, Length 831 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP15-210ENST00000493115 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.29■■■■■ 7.08
DUSP15-210ENST00000493115 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.07■■■■■ 6.09
DUSP15-210ENST00000493115 ABCC9O60706 1549 aa53.04■■■■■ 6.08
DUSP15-210ENST00000493115 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.47■■■■■ 5.67
DUSP15-210ENST00000493115 NACADO15069 1562 aa50.16■■■■■ 5.62
DUSP15-210ENST00000493115 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.93■■■■■ 5.58
DUSP15-210ENST00000493115 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.75■■■■■ 5.55
DUSP15-210ENST00000493115 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.53■■■■■ 5.52
DUSP15-210ENST00000493115 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.43■■■■■ 5.5
DUSP15-210ENST00000493115 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.36■■■■■ 5.49
DUSP15-210ENST00000493115 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.17■■■■■ 5.46
DUSP15-210ENST00000493115 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.11■■■■■ 5.45
DUSP15-210ENST00000493115 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.95■■■■■ 5.43
DUSP15-210ENST00000493115 SCRIBQ14160 1630 aa48.43■■■■■ 5.34
DUSP15-210ENST00000493115 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.34■■■■■ 5.33
DUSP15-210ENST00000493115 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.9■■■■■ 5.26
DUSP15-210ENST00000493115 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.83■■■■■ 5.25
DUSP15-210ENST00000493115 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.75■■■■■ 5.23
DUSP15-210ENST00000493115 NCAPD3P42695 1498 aa46.36■■■■■ 5.01
DUSP15-210ENST00000493115 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.25■■■■■ 4.99
DUSP15-210ENST00000493115 SMARCA4P51532 1647 aa46.2■■■■■ 4.99
DUSP15-210ENST00000493115 SMARCA2P51531 1590 aa46.05■■■■■ 4.96
DUSP15-210ENST00000493115 HMGXB3Q12766 1538 aa45.99■■■■■ 4.95
DUSP15-210ENST00000493115 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.96■■■■■ 4.95
DUSP15-210ENST00000493115 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.76■■■■■ 4.92
DUSP15-210ENST00000493115 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.75■■■■■ 4.91
DUSP15-210ENST00000493115 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.72■■■■■ 4.91
DUSP15-210ENST00000493115 ERCC6Q03468 1493 aa45.71■■■■■ 4.91
DUSP15-210ENST00000493115 NESP48681 1621 aa45.63■■■■■ 4.9
DUSP15-210ENST00000493115 CUX2O14529 1486 aa45.61■■■■■ 4.89
DUSP15-210ENST00000493115 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.49■■■■■ 4.87
DUSP15-210ENST00000493115 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.24■■■■■ 4.83
DUSP15-210ENST00000493115 WIZO95785 1651 aa45.14■■■■■ 4.82
DUSP15-210ENST00000493115 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.11■■■■■ 4.81
DUSP15-210ENST00000493115 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.99■■■■■ 4.79
DUSP15-210ENST00000493115 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.97■■■■■ 4.79
DUSP15-210ENST00000493115 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.94■■■■■ 4.79
DUSP15-210ENST00000493115 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.82■■■■■ 4.77
DUSP15-210ENST00000493115 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.61■■■■■ 4.73
DUSP15-210ENST00000493115 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.56■■■■■ 4.72
DUSP15-210ENST00000493115 WDR62O43379 1518 aa44.51■■■■■ 4.72
DUSP15-210ENST00000493115 CFTRP13569 1480 aa44.47■■■■■ 4.71
DUSP15-210ENST00000493115 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.44■■■■■ 4.7
DUSP15-210ENST00000493115 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.43■■■■■ 4.7
DUSP15-210ENST00000493115 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.1■■■■■ 4.65
DUSP15-210ENST00000493115 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.09■■■■■ 4.65
DUSP15-210ENST00000493115 PRDM2Q13029 1718 aa43.93■■■■■ 4.62
DUSP15-210ENST00000493115 TOPBP1Q92547 1522 aa43.62■■■■■ 4.57
DUSP15-210ENST00000493115 IFT140Q96RY7 1462 aa43.56■■■■■ 4.56
DUSP15-210ENST00000493115 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.55■■■■■ 4.56
DUSP15-210ENST00000493115 OSCARQ8IYS5 282 aa43.54■■■■■ 4.56
DUSP15-210ENST00000493115 TRIM41Q8WV44 630 aa43.53■■■■■ 4.56
DUSP15-210ENST00000493115 ABCC8Q09428 1581 aa43.45■■■■■ 4.55
DUSP15-210ENST00000493115 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.44■■■■■ 4.54
DUSP15-210ENST00000493115 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.26■■■■■ 4.52
DUSP15-210ENST00000493115 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.23■■■■■ 4.51
DUSP15-210ENST00000493115 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.19■■■■■ 4.51
DUSP15-210ENST00000493115 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.15■■■■■ 4.5
DUSP15-210ENST00000493115 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.06■■■■■ 4.48
DUSP15-210ENST00000493115 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43■■■■■ 4.47
DUSP15-210ENST00000493115 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43■■■■■ 4.47
DUSP15-210ENST00000493115 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43■■■■■ 4.47
DUSP15-210ENST00000493115 SOGA1O94964 1423 aa42.97■■■■■ 4.47
DUSP15-210ENST00000493115 CUX1P39880 1505 aa42.94■■■■■ 4.46
DUSP15-210ENST00000493115 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.93■■■■■ 4.46
DUSP15-210ENST00000493115 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.9■■■■■ 4.46
DUSP15-210ENST00000493115 CHD1O14646 1710 aa42.89■■■■■ 4.46
DUSP15-210ENST00000493115 ARHGEF11O15085 1522 aa42.88■■■■■ 4.46
DUSP15-210ENST00000493115 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.87■■■■■ 4.45
DUSP15-210ENST00000493115 FBLN2P98095 1184 aa42.77■■■■■ 4.44
DUSP15-210ENST00000493115 WDR97A6NE52 1622 aa42.71■■■■■ 4.43
DUSP15-210ENST00000493115 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.69■■■■■ 4.42
DUSP15-210ENST00000493115 GRIN2BQ13224 1484 aa42.57■■■■■ 4.41
DUSP15-210ENST00000493115 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.55■■■■■ 4.4
DUSP15-210ENST00000493115 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.55■■■■■ 4.4
DUSP15-210ENST00000493115 ARAP1Q96P48 1450 aa42.5■■■■■ 4.39
DUSP15-210ENST00000493115 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.47■■■■■ 4.39
DUSP15-210ENST00000493115 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.46■■■■■ 4.39
DUSP15-210ENST00000493115 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.44■■■■■ 4.38
DUSP15-210ENST00000493115 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.44■■■■■ 4.38
DUSP15-210ENST00000493115 SYNJ2O15056 1496 aa42.42■■■■■ 4.38
DUSP15-210ENST00000493115 PBRM1Q86U86 1689 aa42.38■■■■■ 4.38
DUSP15-210ENST00000493115 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.37■■■■■ 4.37
DUSP15-210ENST00000493115 SYNJ1O43426 1573 aa42.35■■■■■ 4.37
DUSP15-210ENST00000493115 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.26■■■■■ 4.36
DUSP15-210ENST00000493115 TOP2BQ02880 1626 aa42.23■■■■■ 4.35
DUSP15-210ENST00000493115 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.23■■■■■ 4.35
DUSP15-210ENST00000493115 ADAMTS12P58397 1594 aa42.04■■■■■ 4.32
DUSP15-210ENST00000493115 GRIN2AQ12879 1464 aa42.04■■■■■ 4.32
DUSP15-210ENST00000493115 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.98■■■■■ 4.31
DUSP15-210ENST00000493115 NUP160Q12769 1436 aa41.92■■■■■ 4.3
DUSP15-210ENST00000493115 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.91■■■■■ 4.3
DUSP15-210ENST00000493115 CEP170Q5SW79 1584 aa41.91■■■■■ 4.3
DUSP15-210ENST00000493115 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.88■■■■■ 4.29
DUSP15-210ENST00000493115 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.85■■■■■ 4.29
DUSP15-210ENST00000493115 SHROOM2Q13796 1616 aa41.69■■■■■ 4.27
DUSP15-210ENST00000493115 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.48■■■■■ 4.23
DUSP15-210ENST00000493115 JPH4Q96JJ6 628 aa41.46■■■■■ 4.23
DUSP15-210ENST00000493115 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.44■■■■■ 4.23
DUSP15-210ENST00000493115 IGF1RP08069 1367 aa41.44■■■■■ 4.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms