RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492979.2

SSC4D-202, Transcript of scavenger receptor cysteine rich family member with 4 domains, humanhuman

TSL 5

Gene SSC4D, Length 1,224 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC4D-202ENST00000492979 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.63■■■■■ 5.05
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SSC4D-202ENST00000492979 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.32■■■■□ 3.88
SSC4D-202ENST00000492979 NACADO15069 1562 aa39.26■■■■□ 3.88
SSC4D-202ENST00000492979 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.07■■■■□ 3.84
SSC4D-202ENST00000492979 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.85■■■■□ 3.81
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SSC4D-202ENST00000492979 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.72■■■■□ 3.79
SSC4D-202ENST00000492979 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.29■■■■□ 3.72
SSC4D-202ENST00000492979 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.14■■■■□ 3.7
SSC4D-202ENST00000492979 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.14■■■■□ 3.7
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SSC4D-202ENST00000492979 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.91■■■■□ 3.66
SSC4D-202ENST00000492979 SCRIBQ14160 1630 aa37.71■■■■□ 3.63
SSC4D-202ENST00000492979 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.14■■■■□ 3.54
SSC4D-202ENST00000492979 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.03■■■■□ 3.52
SSC4D-202ENST00000492979 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.87■■■■□ 3.49
SSC4D-202ENST00000492979 NCAPD3P42695 1498 aa36.29■■■■□ 3.4
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SSC4D-202ENST00000492979 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.16■■■■□ 3.38
SSC4D-202ENST00000492979 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
SSC4D-202ENST00000492979 SMARCA2P51531 1590 aa36.1■■■■□ 3.37
SSC4D-202ENST00000492979 HMGXB3Q12766 1538 aa36■■■■□ 3.35
SSC4D-202ENST00000492979 PEG3Q9GZU2 1588 aa36■■■■□ 3.35
SSC4D-202ENST00000492979 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.85■■■■□ 3.33
SSC4D-202ENST00000492979 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.75■■■■□ 3.31
SSC4D-202ENST00000492979 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.37■■■■□ 3.25
SSC4D-202ENST00000492979 WIZO95785 1651 aa35.37■■■■□ 3.25
SSC4D-202ENST00000492979 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.3■■■■□ 3.24
SSC4D-202ENST00000492979 NESP48681 1621 aa35.28■■■■□ 3.24
SSC4D-202ENST00000492979 ERCC6Q03468 1493 aa35.28■■■■□ 3.24
SSC4D-202ENST00000492979 CUX2O14529 1486 aa35.22■■■■□ 3.23
SSC4D-202ENST00000492979 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.15■■■■□ 3.22
SSC4D-202ENST00000492979 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.09■■■■□ 3.21
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SSC4D-202ENST00000492979 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.89■■■■□ 3.18
SSC4D-202ENST00000492979 CFTRP13569 1480 aa34.88■■■■□ 3.17
SSC4D-202ENST00000492979 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.82■■■■□ 3.17
SSC4D-202ENST00000492979 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.68■■■■□ 3.14
SSC4D-202ENST00000492979 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.66■■■■□ 3.14
SSC4D-202ENST00000492979 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.65■■■■□ 3.14
SSC4D-202ENST00000492979 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.64■■■■□ 3.14
SSC4D-202ENST00000492979 WDR62O43379 1518 aa34.6■■■■□ 3.13
SSC4D-202ENST00000492979 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.6■■■■□ 3.13
SSC4D-202ENST00000492979 PRDM2Q13029 1718 aa34.44■■■■□ 3.1
SSC4D-202ENST00000492979 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.08
SSC4D-202ENST00000492979 ABCC8Q09428 1581 aa34.18■■■■□ 3.06
SSC4D-202ENST00000492979 TOPBP1Q92547 1522 aa34.06■■■■□ 3.04
SSC4D-202ENST00000492979 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.99■■■■□ 3.03
SSC4D-202ENST00000492979 IFT140Q96RY7 1462 aa33.99■■■■□ 3.03
SSC4D-202ENST00000492979 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
SSC4D-202ENST00000492979 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.76■■■■□ 3
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SSC4D-202ENST00000492979 CUX1P39880 1505 aa33.64■■■□□ 2.98
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SSC4D-202ENST00000492979 WDR97A6NE52 1622 aa33.57■■■□□ 2.97
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SSC4D-202ENST00000492979 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.34■■■□□ 2.93
SSC4D-202ENST00000492979 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.32■■■□□ 2.92
SSC4D-202ENST00000492979 TOP2BQ02880 1626 aa33.3■■■□□ 2.92
SSC4D-202ENST00000492979 GRIN2BQ13224 1484 aa33.3■■■□□ 2.92
SSC4D-202ENST00000492979 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.28■■■□□ 2.92
SSC4D-202ENST00000492979 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.27■■■□□ 2.92
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SSC4D-202ENST00000492979 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.19■■■□□ 2.9
SSC4D-202ENST00000492979 CHD1O14646 1710 aa33.18■■■□□ 2.9
SSC4D-202ENST00000492979 SYNJ1O43426 1573 aa33.17■■■□□ 2.9
SSC4D-202ENST00000492979 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.17■■■□□ 2.9
SSC4D-202ENST00000492979 SYNJ2O15056 1496 aa33.12■■■□□ 2.89
SSC4D-202ENST00000492979 FBLN2P98095 1184 aa33.11■■■□□ 2.89
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SSC4D-202ENST00000492979 PBRM1Q86U86 1689 aa33.05■■■□□ 2.88
SSC4D-202ENST00000492979 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.04■■■□□ 2.88
SSC4D-202ENST00000492979 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.04■■■□□ 2.88
SSC4D-202ENST00000492979 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.04■■■□□ 2.88
SSC4D-202ENST00000492979 TRIM41Q8WV44 630 aa33■■■□□ 2.87
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SSC4D-202ENST00000492979 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.94■■■□□ 2.86
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SSC4D-202ENST00000492979 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.73■■■□□ 2.83
SSC4D-202ENST00000492979 KIF27Q86VH2 1401 aa32.68■■■□□ 2.82
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SSC4D-202ENST00000492979 CEP170Q5SW79 1584 aa32.62■■■□□ 2.81
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SSC4D-202ENST00000492979 CUL7Q14999 1698 aa32.5■■■□□ 2.79
SSC4D-202ENST00000492979 JPH4Q96JJ6 628 aa32.42■■■□□ 2.78
SSC4D-202ENST00000492979 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.4■■■□□ 2.78
SSC4D-202ENST00000492979 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.37■■■□□ 2.77
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