RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492950.5

USP21-209, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

TSL 5

Gene USP21, Length 1,150 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-209ENST00000492950 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.48■■■■■ 6.63
USP21-209ENST00000492950 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.41■■■■■ 5.66
USP21-209ENST00000492950 ABCC9O60706 1549 aa50.12■■■■■ 5.61
USP21-209ENST00000492950 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.82■■■■■ 5.25
USP21-209ENST00000492950 NACADO15069 1562 aa47.61■■■■■ 5.21
USP21-209ENST00000492950 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.6■■■■■ 5.21
USP21-209ENST00000492950 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.07■■■■■ 5.13
USP21-209ENST00000492950 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.84■■■■■ 5.09
USP21-209ENST00000492950 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.82■■■■■ 5.09
USP21-209ENST00000492950 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.81■■■■■ 5.08
USP21-209ENST00000492950 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.8■■■■■ 5.08
USP21-209ENST00000492950 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.63■■■■■ 5.05
USP21-209ENST00000492950 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.49■■■■■ 5.03
USP21-209ENST00000492950 SCRIBQ14160 1630 aa45.99■■■■■ 4.95
USP21-209ENST00000492950 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.74■■■■■ 4.91
USP21-209ENST00000492950 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.28■■■■■ 4.84
USP21-209ENST00000492950 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.26■■■■■ 4.84
USP21-209ENST00000492950 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.08■■■■■ 4.81
USP21-209ENST00000492950 NCAPD3P42695 1498 aa44■■■■■ 4.63
USP21-209ENST00000492950 SMARCA4P51532 1647 aa43.93■■■■■ 4.62
USP21-209ENST00000492950 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.92■■■■■ 4.62
USP21-209ENST00000492950 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.75■■■■■ 4.59
USP21-209ENST00000492950 SMARCA2P51531 1590 aa43.75■■■■■ 4.59
USP21-209ENST00000492950 HMGXB3Q12766 1538 aa43.62■■■■■ 4.57
USP21-209ENST00000492950 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.54■■■■■ 4.56
USP21-209ENST00000492950 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.5■■■■■ 4.55
USP21-209ENST00000492950 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.46■■■■■ 4.55
USP21-209ENST00000492950 NESP48681 1621 aa43.19■■■■■ 4.51
USP21-209ENST00000492950 ERCC6Q03468 1493 aa43.17■■■■■ 4.5
USP21-209ENST00000492950 WIZO95785 1651 aa43.04■■■■■ 4.48
USP21-209ENST00000492950 CUX2O14529 1486 aa42.95■■■■■ 4.47
USP21-209ENST00000492950 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.88■■■■■ 4.45
USP21-209ENST00000492950 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.8■■■■■ 4.44
USP21-209ENST00000492950 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.69■■■■■ 4.42
USP21-209ENST00000492950 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.64■■■■■ 4.42
USP21-209ENST00000492950 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.62■■■■■ 4.41
USP21-209ENST00000492950 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.6■■■■■ 4.41
USP21-209ENST00000492950 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.59■■■■■ 4.41
USP21-209ENST00000492950 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.45■■■■■ 4.39
USP21-209ENST00000492950 CFTRP13569 1480 aa42.26■■■■■ 4.36
USP21-209ENST00000492950 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.23■■■■■ 4.35
USP21-209ENST00000492950 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.16■■■■■ 4.34
USP21-209ENST00000492950 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.13■■■■■ 4.34
USP21-209ENST00000492950 WDR62O43379 1518 aa42.1■■■■■ 4.33
USP21-209ENST00000492950 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.06■■■■■ 4.32
USP21-209ENST00000492950 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.81■■■■■ 4.28
USP21-209ENST00000492950 PRDM2Q13029 1718 aa41.81■■■■■ 4.28
USP21-209ENST00000492950 TOPBP1Q92547 1522 aa41.42■■■■■ 4.22
USP21-209ENST00000492950 ABCC8Q09428 1581 aa41.33■■■■■ 4.21
USP21-209ENST00000492950 IFT140Q96RY7 1462 aa41.29■■■■■ 4.2
USP21-209ENST00000492950 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.27■■■■■ 4.2
USP21-209ENST00000492950 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.26■■■■■ 4.2
USP21-209ENST00000492950 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.25■■■■■ 4.19
USP21-209ENST00000492950 OSCARQ8IYS5 282 aa41.18■■■■■ 4.18
USP21-209ENST00000492950 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
USP21-209ENST00000492950 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.02■■■■■ 4.16
USP21-209ENST00000492950 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.96■■■■■ 4.152e-6■■■■■ 34.1
USP21-209ENST00000492950 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
USP21-209ENST00000492950 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.91■■■■■ 4.14
USP21-209ENST00000492950 TRIM41Q8WV44 630 aa40.89■■■■■ 4.14
USP21-209ENST00000492950 SOGA1O94964 1423 aa40.89■■■■■ 4.14
USP21-209ENST00000492950 CUX1P39880 1505 aa40.87■■■■■ 4.13
USP21-209ENST00000492950 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.82■■■■■ 4.12
USP21-209ENST00000492950 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.77■■■■■ 4.12
USP21-209ENST00000492950 CHD1O14646 1710 aa40.61■■■■■ 4.09
USP21-209ENST00000492950 FBLN2P98095 1184 aa40.6■■■■■ 4.09
USP21-209ENST00000492950 WDR97A6NE52 1622 aa40.54■■■■■ 4.08
USP21-209ENST00000492950 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.53■■■■■ 4.08
USP21-209ENST00000492950 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.53■■■■■ 4.08
USP21-209ENST00000492950 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.53■■■■■ 4.08
USP21-209ENST00000492950 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.46■■■■■ 4.07
USP21-209ENST00000492950 ARHGEF11O15085 1522 aa40.43■■■■■ 4.06
USP21-209ENST00000492950 GRIN2BQ13224 1484 aa40.42■■■■■ 4.06
USP21-209ENST00000492950 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.37■■■■■ 4.05
USP21-209ENST00000492950 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.36■■■■■ 4.05
USP21-209ENST00000492950 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.36■■■■■ 4.05
USP21-209ENST00000492950 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.36■■■■■ 4.05
USP21-209ENST00000492950 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.33■■■■■ 4.05
USP21-209ENST00000492950 TOP2BQ02880 1626 aa40.29■■■■■ 4.04
USP21-209ENST00000492950 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.28■■■■■ 4.04
USP21-209ENST00000492950 SYNJ1O43426 1573 aa40.27■■■■■ 4.04
USP21-209ENST00000492950 PBRM1Q86U86 1689 aa40.27■■■■■ 4.04
USP21-209ENST00000492950 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.25■■■■■ 4.03
USP21-209ENST00000492950 SYNJ2O15056 1496 aa40.24■■■■■ 4.03
USP21-209ENST00000492950 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.22■■■■■ 4.03
USP21-209ENST00000492950 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.15■■■■■ 4.02
USP21-209ENST00000492950 ARAP1Q96P48 1450 aa40.07■■■■■ 4.01
USP21-209ENST00000492950 GRIN2AQ12879 1464 aa39.9■■■■□ 3.98
USP21-209ENST00000492950 ADAMTS12P58397 1594 aa39.89■■■■□ 3.98
USP21-209ENST00000492950 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.86■■■■□ 3.97
USP21-209ENST00000492950 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.85■■■■□ 3.97
USP21-209ENST00000492950 NUP160Q12769 1436 aa39.77■■■■□ 3.96
USP21-209ENST00000492950 CEP170Q5SW79 1584 aa39.76■■■■□ 3.95
USP21-209ENST00000492950 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.63■■■■□ 3.93
USP21-209ENST00000492950 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.6■■■■□ 3.93
USP21-209ENST00000492950 IGF1RP08069 1367 aa39.56■■■■□ 3.92
USP21-209ENST00000492950 SHROOM2Q13796 1616 aa39.53■■■■□ 3.92
USP21-209ENST00000492950 KIF27Q86VH2 1401 aa39.52■■■■□ 3.92
USP21-209ENST00000492950 JPH4Q96JJ6 628 aa39.47■■■■□ 3.91
USP21-209ENST00000492950 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.38■■■■□ 3.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms