RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492897.3

HOXB-AS3-214, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXB-AS3, Length 309 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.38■■■■□ 3.57
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HOXB-AS3-214ENST00000492897 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.68■■■□□ 2.66
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NACADO15069 1562 aa31.57■■■□□ 2.64
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HOXB-AS3-214ENST00000492897 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.3■■■□□ 2.6
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HOXB-AS3-214ENST00000492897 SCRIBQ14160 1630 aa30.37■■■□□ 2.45
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HOXB-AS3-214ENST00000492897 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30■■■□□ 2.39
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.93■■■□□ 2.38
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HOXB-AS3-214ENST00000492897 SMARCA4P51532 1647 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SMARCA2P51531 1590 aa28.98■■■□□ 2.23
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HOXB-AS3-214ENST00000492897 CUX2O14529 1486 aa28.59■■■□□ 2.17
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HOXB-AS3-214ENST00000492897 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.42■■■□□ 2.14
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HOXB-AS3-214ENST00000492897 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.14■■■□□ 2.1
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HOXB-AS3-214ENST00000492897 WDR62O43379 1518 aa27.96■■■□□ 2.07
HOXB-AS3-214ENST00000492897 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.93■■■□□ 2.06
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.9■■■□□ 2.06
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.8■■■□□ 2.04
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HOXB-AS3-214ENST00000492897 PRDM2Q13029 1718 aa27.55■■■□□ 2
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HOXB-AS3-214ENST00000492897 OSCARQ8IYS5 282 aa27.33■■□□□ 1.97
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HOXB-AS3-214ENST00000492897 CUX1P39880 1505 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXB-AS3-214ENST00000492897 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27■■□□□ 1.91
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
HOXB-AS3-214ENST00000492897 WDR97A6NE52 1622 aa26.9■■□□□ 1.9
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HOXB-AS3-214ENST00000492897 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ARHGEF11O15085 1522 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CHD1O14646 1710 aa26.81■■□□□ 1.88
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXB-AS3-214ENST00000492897 FBLN2P98095 1184 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB-AS3-214ENST00000492897 GRIN2BQ13224 1484 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
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HOXB-AS3-214ENST00000492897 SYNJ2O15056 1496 aa26.68■■□□□ 1.86
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HOXB-AS3-214ENST00000492897 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ARAP1Q96P48 1450 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TOP2BQ02880 1626 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXB-AS3-214ENST00000492897 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SYNJ1O43426 1573 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PBRM1Q86U86 1689 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB-AS3-214ENST00000492897 GRIN2AQ12879 1464 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ADAMTS12P58397 1594 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXB-AS3-214ENST00000492897 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NUP160Q12769 1436 aa26.4■■□□□ 1.82
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.39■■□□□ 1.82
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CEP170Q5SW79 1584 aa26.31■■□□□ 1.8
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SHROOM2Q13796 1616 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
HOXB-AS3-214ENST00000492897 IGF1RP08069 1367 aa26.18■■□□□ 1.78
HOXB-AS3-214ENST00000492897 KIF27Q86VH2 1401 aa26.12■■□□□ 1.77
HOXB-AS3-214ENST00000492897 JPH4Q96JJ6 628 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
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