RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492861.1

PKDCC-209, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 2

Gene PKDCC, Length 693 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-209ENST00000492861 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.69■■■□□ 2.18
PKDCC-209ENST00000492861 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.29■■□□□ 1.64
PKDCC-209ENST00000492861 ABCC9O60706 1549 aa25.08■■□□□ 1.61
PKDCC-209ENST00000492861 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
PKDCC-209ENST00000492861 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.85■■□□□ 1.41
PKDCC-209ENST00000492861 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.83■■□□□ 1.41
PKDCC-209ENST00000492861 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.73■■□□□ 1.39
PKDCC-209ENST00000492861 NACADO15069 1562 aa23.65■■□□□ 1.38
PKDCC-209ENST00000492861 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.59■■□□□ 1.37
PKDCC-209ENST00000492861 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.55■■□□□ 1.36
PKDCC-209ENST00000492861 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.35■■□□□ 1.33
PKDCC-209ENST00000492861 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.25■■□□□ 1.31
PKDCC-209ENST00000492861 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.1■■□□□ 1.29
PKDCC-209ENST00000492861 SCRIBQ14160 1630 aa23.02■■□□□ 1.28
PKDCC-209ENST00000492861 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.92■■□□□ 1.26
PKDCC-209ENST00000492861 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.64■■□□□ 1.21
PKDCC-209ENST00000492861 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.61■■□□□ 1.21
PKDCC-209ENST00000492861 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PKDCC-209ENST00000492861 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PKDCC-209ENST00000492861 SMARCA4P51532 1647 aa22.13■■□□□ 1.13
PKDCC-209ENST00000492861 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.1■■□□□ 1.13
PKDCC-209ENST00000492861 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PKDCC-209ENST00000492861 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.97■■□□□ 1.11
PKDCC-209ENST00000492861 WIZO95785 1651 aa21.88■■□□□ 1.09
PKDCC-209ENST00000492861 SMARCA2P51531 1590 aa21.87■■□□□ 1.09
PKDCC-209ENST00000492861 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PKDCC-209ENST00000492861 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.83■■□□□ 1.09
PKDCC-209ENST00000492861 NCAPD3P42695 1498 aa21.83■■□□□ 1.08
PKDCC-209ENST00000492861 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
PKDCC-209ENST00000492861 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.75■■□□□ 1.07
PKDCC-209ENST00000492861 HMGXB3Q12766 1538 aa21.74■■□□□ 1.07
PKDCC-209ENST00000492861 ERCC6Q03468 1493 aa21.69■■□□□ 1.06
PKDCC-209ENST00000492861 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PKDCC-209ENST00000492861 CUX2O14529 1486 aa21.66■■□□□ 1.06
PKDCC-209ENST00000492861 NESP48681 1621 aa21.51■■□□□ 1.03
PKDCC-209ENST00000492861 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.43■■□□□ 1.02
PKDCC-209ENST00000492861 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.35■■□□□ 1.01
PKDCC-209ENST00000492861 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
PKDCC-209ENST00000492861 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.25■□□□□ 0.99
PKDCC-209ENST00000492861 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.21■□□□□ 0.99
PKDCC-209ENST00000492861 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.18■□□□□ 0.98
PKDCC-209ENST00000492861 CFTRP13569 1480 aa21.16■□□□□ 0.98
PKDCC-209ENST00000492861 PRDM2Q13029 1718 aa21.09■□□□□ 0.97
PKDCC-209ENST00000492861 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.07■□□□□ 0.96
PKDCC-209ENST00000492861 WDR62O43379 1518 aa21■□□□□ 0.95
PKDCC-209ENST00000492861 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.96■□□□□ 0.95
PKDCC-209ENST00000492861 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.93■□□□□ 0.94
PKDCC-209ENST00000492861 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.85■□□□□ 0.93
PKDCC-209ENST00000492861 ABCC8Q09428 1581 aa20.82■□□□□ 0.92
PKDCC-209ENST00000492861 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.8■□□□□ 0.92
PKDCC-209ENST00000492861 TRIM41Q8WV44 630 aa20.79■□□□□ 0.92
PKDCC-209ENST00000492861 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
PKDCC-209ENST00000492861 TOP2BQ02880 1626 aa20.73■□□□□ 0.91
PKDCC-209ENST00000492861 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.73■□□□□ 0.91
PKDCC-209ENST00000492861 SYNJ1O43426 1573 aa20.72■□□□□ 0.91
PKDCC-209ENST00000492861 CUX1P39880 1505 aa20.71■□□□□ 0.91
PKDCC-209ENST00000492861 OSCARQ8IYS5 282 aa20.68■□□□□ 0.9
PKDCC-209ENST00000492861 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.68■□□□□ 0.9
PKDCC-209ENST00000492861 TOPBP1Q92547 1522 aa20.63■□□□□ 0.89
PKDCC-209ENST00000492861 IFT140Q96RY7 1462 aa20.56■□□□□ 0.88
PKDCC-209ENST00000492861 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.52■□□□□ 0.88
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PKDCC-209ENST00000492861 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PKDCC-209ENST00000492861 EEA1Q15075 1411 aa20.41■□□□□ 0.86
PKDCC-209ENST00000492861 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.4■□□□□ 0.86
PKDCC-209ENST00000492861 WDR97A6NE52 1622 aa20.38■□□□□ 0.85
PKDCC-209ENST00000492861 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.38■□□□□ 0.85
PKDCC-209ENST00000492861 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.38■□□□□ 0.85
PKDCC-209ENST00000492861 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.38■□□□□ 0.85
PKDCC-209ENST00000492861 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PKDCC-209ENST00000492861 SOGA1O94964 1423 aa20.37■□□□□ 0.85
PKDCC-209ENST00000492861 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PKDCC-209ENST00000492861 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.34■□□□□ 0.85
PKDCC-209ENST00000492861 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.851e-7■■■■■ 29.7
PKDCC-209ENST00000492861 KIF27Q86VH2 1401 aa20.32■□□□□ 0.84
PKDCC-209ENST00000492861 ARHGEF11O15085 1522 aa20.32■□□□□ 0.84
PKDCC-209ENST00000492861 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.27■□□□□ 0.84
PKDCC-209ENST00000492861 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.27■□□□□ 0.84
PKDCC-209ENST00000492861 CHD1O14646 1710 aa20.24■□□□□ 0.83
PKDCC-209ENST00000492861 FBLN2P98095 1184 aa20.24■□□□□ 0.83
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PKDCC-209ENST00000492861 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PKDCC-209ENST00000492861 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.18■□□□□ 0.82
PKDCC-209ENST00000492861 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.17■□□□□ 0.82
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PKDCC-209ENST00000492861 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PKDCC-209ENST00000492861 KIF21BO75037 1637 aa20.15■□□□□ 0.82
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PKDCC-209ENST00000492861 PRXQ9BXM0 1461 aa20.13■□□□□ 0.81
PKDCC-209ENST00000492861 PBRM1Q86U86 1689 aa20.12■□□□□ 0.81
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PKDCC-209ENST00000492861 CUL7Q14999 1698 aa20.11■□□□□ 0.81
PKDCC-209ENST00000492861 GRIN2BQ13224 1484 aa20.11■□□□□ 0.81
PKDCC-209ENST00000492861 ARAP1Q96P48 1450 aa20.11■□□□□ 0.81
PKDCC-209ENST00000492861 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PKDCC-209ENST00000492861 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PKDCC-209ENST00000492861 GOLGA3Q08378 1498 aa20.05■□□□□ 0.8
PKDCC-209ENST00000492861 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
PKDCC-209ENST00000492861 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.02■□□□□ 0.8
PKDCC-209ENST00000492861 ADAMTS12P58397 1594 aa20.02■□□□□ 0.8
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