RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492814.1

SNAP25-204, Transcript of synaptosome associated protein 25, humanhuman

TSL 2

Gene SNAP25, Length 430 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25-204ENST00000492814 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.15■■■□□ 2.42
SNAP25-204ENST00000492814 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.98■■□□□ 1.91
SNAP25-204ENST00000492814 ABCC9O60706 1549 aa26.7■■□□□ 1.86
SNAP25-204ENST00000492814 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.52■■□□□ 1.68
SNAP25-204ENST00000492814 NACADO15069 1562 aa25.41■■□□□ 1.66
SNAP25-204ENST00000492814 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.29■■□□□ 1.64
SNAP25-204ENST00000492814 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.13■■□□□ 1.61
SNAP25-204ENST00000492814 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
SNAP25-204ENST00000492814 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25■■□□□ 1.59
SNAP25-204ENST00000492814 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.91■■□□□ 1.58
SNAP25-204ENST00000492814 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.87■■□□□ 1.57
SNAP25-204ENST00000492814 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.79■■□□□ 1.56
SNAP25-204ENST00000492814 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.77■■□□□ 1.56
SNAP25-204ENST00000492814 SCRIBQ14160 1630 aa24.61■■□□□ 1.53
SNAP25-204ENST00000492814 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.46■■□□□ 1.51
SNAP25-204ENST00000492814 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SNAP25-204ENST00000492814 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.14■■□□□ 1.46
SNAP25-204ENST00000492814 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.01■■□□□ 1.43
SNAP25-204ENST00000492814 SMARCA4P51532 1647 aa23.48■■□□□ 1.35
SNAP25-204ENST00000492814 NCAPD3P42695 1498 aa23.43■■□□□ 1.34
SNAP25-204ENST00000492814 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.42■■□□□ 1.34
SNAP25-204ENST00000492814 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SNAP25-204ENST00000492814 SMARCA2P51531 1590 aa23.37■■□□□ 1.33
SNAP25-204ENST00000492814 HMGXB3Q12766 1538 aa23.31■■□□□ 1.32
SNAP25-204ENST00000492814 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.24■■□□□ 1.31
SNAP25-204ENST00000492814 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.24■■□□□ 1.31
SNAP25-204ENST00000492814 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
SNAP25-204ENST00000492814 ERCC6Q03468 1493 aa23.03■■□□□ 1.28
SNAP25-204ENST00000492814 NESP48681 1621 aa23.01■■□□□ 1.27
SNAP25-204ENST00000492814 WIZO95785 1651 aa23■■□□□ 1.27
SNAP25-204ENST00000492814 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.89■■□□□ 1.25
SNAP25-204ENST00000492814 CUX2O14529 1486 aa22.88■■□□□ 1.25
SNAP25-204ENST00000492814 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
SNAP25-204ENST00000492814 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.76■■□□□ 1.23
SNAP25-204ENST00000492814 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
SNAP25-204ENST00000492814 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.73■■□□□ 1.23
SNAP25-204ENST00000492814 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.72■■□□□ 1.23
SNAP25-204ENST00000492814 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SNAP25-204ENST00000492814 CFTRP13569 1480 aa22.54■■□□□ 1.2
SNAP25-204ENST00000492814 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.54■■□□□ 1.2
SNAP25-204ENST00000492814 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.54■■□□□ 1.2
SNAP25-204ENST00000492814 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.5■■□□□ 1.19
SNAP25-204ENST00000492814 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.49■■□□□ 1.19
SNAP25-204ENST00000492814 WDR62O43379 1518 aa22.49■■□□□ 1.19
SNAP25-204ENST00000492814 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.43■■□□□ 1.18
SNAP25-204ENST00000492814 PRDM2Q13029 1718 aa22.4■■□□□ 1.18
SNAP25-204ENST00000492814 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SNAP25-204ENST00000492814 TOPBP1Q92547 1522 aa22.11■■□□□ 1.13
SNAP25-204ENST00000492814 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.06■■□□□ 1.12
SNAP25-204ENST00000492814 ABCC8Q09428 1581 aa22.04■■□□□ 1.12
SNAP25-204ENST00000492814 IFT140Q96RY7 1462 aa22.03■■□□□ 1.12
SNAP25-204ENST00000492814 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SNAP25-204ENST00000492814 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SNAP25-204ENST00000492814 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
SNAP25-204ENST00000492814 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
SNAP25-204ENST00000492814 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
SNAP25-204ENST00000492814 OSCARQ8IYS5 282 aa21.84■■□□□ 1.09
SNAP25-204ENST00000492814 CUX1P39880 1505 aa21.83■■□□□ 1.09
SNAP25-204ENST00000492814 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.81■■□□□ 1.08
SNAP25-204ENST00000492814 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.8■■□□□ 1.08
SNAP25-204ENST00000492814 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.8■■□□□ 1.08
SNAP25-204ENST00000492814 SOGA1O94964 1423 aa21.77■■□□□ 1.08
SNAP25-204ENST00000492814 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
SNAP25-204ENST00000492814 CHD1O14646 1710 aa21.7■■□□□ 1.06
SNAP25-204ENST00000492814 WDR97A6NE52 1622 aa21.69■■□□□ 1.06
SNAP25-204ENST00000492814 TRIM41Q8WV44 630 aa21.68■■□□□ 1.06
SNAP25-204ENST00000492814 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.61■■□□□ 1.05
SNAP25-204ENST00000492814 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.6■■□□□ 1.05
SNAP25-204ENST00000492814 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.6■■□□□ 1.05
SNAP25-204ENST00000492814 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.6■■□□□ 1.05
SNAP25-204ENST00000492814 FBLN2P98095 1184 aa21.59■■□□□ 1.05
SNAP25-204ENST00000492814 GRIN2BQ13224 1484 aa21.57■■□□□ 1.04
SNAP25-204ENST00000492814 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.56■■□□□ 1.04
SNAP25-204ENST00000492814 SYNJ1O43426 1573 aa21.56■■□□□ 1.04
SNAP25-204ENST00000492814 ARHGEF11O15085 1522 aa21.55■■□□□ 1.04
SNAP25-204ENST00000492814 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.55■■□□□ 1.04
SNAP25-204ENST00000492814 TOP2BQ02880 1626 aa21.55■■□□□ 1.04
SNAP25-204ENST00000492814 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SNAP25-204ENST00000492814 PBRM1Q86U86 1689 aa21.55■■□□□ 1.04
SNAP25-204ENST00000492814 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
SNAP25-204ENST00000492814 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.54■■□□□ 1.04
SNAP25-204ENST00000492814 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.53■■□□□ 1.04
SNAP25-204ENST00000492814 SYNJ2O15056 1496 aa21.48■■□□□ 1.03
SNAP25-204ENST00000492814 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SNAP25-204ENST00000492814 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.44■■□□□ 1.02
SNAP25-204ENST00000492814 ARAP1Q96P48 1450 aa21.36■■□□□ 1.01
SNAP25-204ENST00000492814 ADAMTS12P58397 1594 aa21.36■■□□□ 1.01
SNAP25-204ENST00000492814 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.33■■□□□ 1.01
SNAP25-204ENST00000492814 GRIN2AQ12879 1464 aa21.31■■□□□ 1
SNAP25-204ENST00000492814 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.29■■□□□ 1
SNAP25-204ENST00000492814 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.26■□□□□ 0.99
SNAP25-204ENST00000492814 CEP170Q5SW79 1584 aa21.23■□□□□ 0.99
SNAP25-204ENST00000492814 NUP160Q12769 1436 aa21.21■□□□□ 0.99
SNAP25-204ENST00000492814 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.13■□□□□ 0.97
SNAP25-204ENST00000492814 SHROOM2Q13796 1616 aa21.12■□□□□ 0.97
SNAP25-204ENST00000492814 KIF27Q86VH2 1401 aa21.12■□□□□ 0.97
SNAP25-204ENST00000492814 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.06■□□□□ 0.96
SNAP25-204ENST00000492814 CUL7Q14999 1698 aa21.05■□□□□ 0.96
SNAP25-204ENST00000492814 IGF1RP08069 1367 aa21.05■□□□□ 0.96
SNAP25-204ENST00000492814 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
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