RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492560.6

TBXAS1-218, Transcript of thromboxane A synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene TBXAS1, Length 633 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBXAS1-218ENST00000492560 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.81■■■□□ 2.04
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TBXAS1-218ENST00000492560 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.36■■□□□ 1.65
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TBXAS1-218ENST00000492560 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.89■■□□□ 1.41
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TBXAS1-218ENST00000492560 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.69■■□□□ 1.38
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TBXAS1-218ENST00000492560 SMARCA2P51531 1590 aa22.11■■□□□ 1.13
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TBXAS1-218ENST00000492560 HMGXB3Q12766 1538 aa22.06■■□□□ 1.12
TBXAS1-218ENST00000492560 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.95■■□□□ 1.1
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TBXAS1-218ENST00000492560 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.65■■□□□ 1.06
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TBXAS1-218ENST00000492560 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.65■■□□□ 1.06
TBXAS1-218ENST00000492560 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.55■■□□□ 1.04
TBXAS1-218ENST00000492560 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.47■■□□□ 1.03
TBXAS1-218ENST00000492560 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.46■■□□□ 1.03
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TBXAS1-218ENST00000492560 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
TBXAS1-218ENST00000492560 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.59■□□□□ 0.89
TBXAS1-218ENST00000492560 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.58■□□□□ 0.89
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TBXAS1-218ENST00000492560 DIP2BQ9P265 1576 aa20.09■□□□□ 0.81
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