RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492434.6

SLC6A9-209, Transcript of solute carrier family 6 member 9, humanhuman

TSL 3

Gene SLC6A9, Length 592 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9-209ENST00000492434 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.99■■■■■ 6.71
SLC6A9-209ENST00000492434 ABCC9O60706 1549 aa51.21■■■■■ 5.79
SLC6A9-209ENST00000492434 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.12■■■■■ 5.77
SLC6A9-209ENST00000492434 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.65■■■■■ 5.38
SLC6A9-209ENST00000492434 NACADO15069 1562 aa48.31■■■■■ 5.32
SLC6A9-209ENST00000492434 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.18■■■■■ 5.3
SLC6A9-209ENST00000492434 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.01■■■■■ 5.28
SLC6A9-209ENST00000492434 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.69■■■■■ 5.22
SLC6A9-209ENST00000492434 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.68■■■■■ 5.22
SLC6A9-209ENST00000492434 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.64■■■■■ 5.22
SLC6A9-209ENST00000492434 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.39■■■■■ 5.18
SLC6A9-209ENST00000492434 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.24■■■■■ 5.15
SLC6A9-209ENST00000492434 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.04■■■■■ 5.12
SLC6A9-209ENST00000492434 SCRIBQ14160 1630 aa46.63■■■■■ 5.06
SLC6A9-209ENST00000492434 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.57■■■■■ 5.04
SLC6A9-209ENST00000492434 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.26■■■■■ 5
SLC6A9-209ENST00000492434 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.15■■■■■ 4.98
SLC6A9-209ENST00000492434 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.1■■■■■ 4.97
SLC6A9-209ENST00000492434 NCAPD3P42695 1498 aa44.65■■■■■ 4.74
SLC6A9-209ENST00000492434 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.53■■■■■ 4.72
SLC6A9-209ENST00000492434 SMARCA4P51532 1647 aa44.47■■■■■ 4.71
SLC6A9-209ENST00000492434 SMARCA2P51531 1590 aa44.32■■■■■ 4.69
SLC6A9-209ENST00000492434 HMGXB3Q12766 1538 aa44.29■■■■■ 4.68
SLC6A9-209ENST00000492434 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.18■■■■■ 4.66
SLC6A9-209ENST00000492434 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.14■■■■■ 4.66
SLC6A9-209ENST00000492434 ERCC6Q03468 1493 aa44.12■■■■■ 4.65
SLC6A9-209ENST00000492434 CUX2O14529 1486 aa44.08■■■■■ 4.65
SLC6A9-209ENST00000492434 NESP48681 1621 aa44.04■■■■■ 4.64
SLC6A9-209ENST00000492434 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.04■■■■■ 4.64
SLC6A9-209ENST00000492434 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.03■■■■■ 4.64
SLC6A9-209ENST00000492434 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.97■■■■■ 4.63
SLC6A9-209ENST00000492434 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.61■■■■■ 4.57
SLC6A9-209ENST00000492434 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.58■■■■■ 4.57
SLC6A9-209ENST00000492434 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.44■■■■■ 4.54
SLC6A9-209ENST00000492434 WIZO95785 1651 aa43.43■■■■■ 4.54
SLC6A9-209ENST00000492434 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.31■■■■■ 4.52
SLC6A9-209ENST00000492434 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.26■■■■■ 4.52
SLC6A9-209ENST00000492434 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.01■■■■■ 4.48
SLC6A9-209ENST00000492434 MRC2Q9UBG0 1479 aa43■■■■■ 4.47
SLC6A9-209ENST00000492434 WDR62O43379 1518 aa42.94■■■■■ 4.46
SLC6A9-209ENST00000492434 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.82■■■■■ 4.45
SLC6A9-209ENST00000492434 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.81■■■■■ 4.44
SLC6A9-209ENST00000492434 CFTRP13569 1480 aa42.79■■■■■ 4.44
SLC6A9-209ENST00000492434 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.79■■■■■ 4.44
SLC6A9-209ENST00000492434 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.51■■■■■ 4.39
SLC6A9-209ENST00000492434 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.36■■■■■ 4.37
SLC6A9-209ENST00000492434 PRDM2Q13029 1718 aa42.34■■■■■ 4.37
SLC6A9-209ENST00000492434 TRIM41Q8WV44 630 aa42.16■■■■■ 4.34
SLC6A9-209ENST00000492434 OSCARQ8IYS5 282 aa42.02■■■■■ 4.32
SLC6A9-209ENST00000492434 TOPBP1Q92547 1522 aa42■■■■■ 4.31
SLC6A9-209ENST00000492434 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42■■■■■ 4.31
SLC6A9-209ENST00000492434 IFT140Q96RY7 1462 aa41.95■■■■■ 4.31
SLC6A9-209ENST00000492434 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.81■■■■■ 4.28
SLC6A9-209ENST00000492434 ABCC8Q09428 1581 aa41.78■■■■■ 4.28
SLC6A9-209ENST00000492434 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.72■■■■■ 4.27
SLC6A9-209ENST00000492434 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.66■■■■■ 4.26
SLC6A9-209ENST00000492434 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.6■■■■■ 4.25
SLC6A9-209ENST00000492434 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.6■■■■■ 4.25
SLC6A9-209ENST00000492434 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.6■■■■■ 4.25
SLC6A9-209ENST00000492434 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.58■■■■■ 4.25
SLC6A9-209ENST00000492434 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.57■■■■■ 4.25
SLC6A9-209ENST00000492434 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.45■■■■■ 4.23
SLC6A9-209ENST00000492434 ARHGEF11O15085 1522 aa41.44■■■■■ 4.23
SLC6A9-209ENST00000492434 CHD1O14646 1710 aa41.43■■■■■ 4.22
SLC6A9-209ENST00000492434 SOGA1O94964 1423 aa41.33■■■■■ 4.21
SLC6A9-209ENST00000492434 CUX1P39880 1505 aa41.3■■■■■ 4.2
SLC6A9-209ENST00000492434 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.3■■■■■ 4.2
SLC6A9-209ENST00000492434 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.29■■■■■ 4.2
SLC6A9-209ENST00000492434 FBLN2P98095 1184 aa41.2■■■■■ 4.19
SLC6A9-209ENST00000492434 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.14■■■■■ 4.18
SLC6A9-209ENST00000492434 WDR97A6NE52 1622 aa41.11■■■■■ 4.17
SLC6A9-209ENST00000492434 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.09■■■■■ 4.17
SLC6A9-209ENST00000492434 ARAP1Q96P48 1450 aa41.07■■■■■ 4.16
SLC6A9-209ENST00000492434 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
SLC6A9-209ENST00000492434 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.97■■■■■ 4.15
SLC6A9-209ENST00000492434 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.97■■■■■ 4.15
SLC6A9-209ENST00000492434 GRIN2BQ13224 1484 aa40.96■■■■■ 4.15
SLC6A9-209ENST00000492434 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.88■■■■■ 4.13
SLC6A9-209ENST00000492434 PBRM1Q86U86 1689 aa40.86■■■■■ 4.13
SLC6A9-209ENST00000492434 SYNJ2O15056 1496 aa40.85■■■■■ 4.13
SLC6A9-209ENST00000492434 SYNJ1O43426 1573 aa40.84■■■■■ 4.13
SLC6A9-209ENST00000492434 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.83■■■■■ 4.13
SLC6A9-209ENST00000492434 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.81■■■■■ 4.12
SLC6A9-209ENST00000492434 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.8■■■■■ 4.12
SLC6A9-209ENST00000492434 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.6■■■■■ 4.09
SLC6A9-209ENST00000492434 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.59■■■■■ 4.09
SLC6A9-209ENST00000492434 TOP2BQ02880 1626 aa40.58■■■■■ 4.09
SLC6A9-209ENST00000492434 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.58■■■■■ 4.09
SLC6A9-209ENST00000492434 ADAMTS12P58397 1594 aa40.48■■■■■ 4.07
SLC6A9-209ENST00000492434 GRIN2AQ12879 1464 aa40.48■■■■■ 4.07
SLC6A9-209ENST00000492434 CEP170Q5SW79 1584 aa40.4■■■■■ 4.06
SLC6A9-209ENST00000492434 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.4■■■■■ 4.06
SLC6A9-209ENST00000492434 NUP160Q12769 1436 aa40.36■■■■■ 4.05
SLC6A9-209ENST00000492434 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.3■■■■■ 4.04
SLC6A9-209ENST00000492434 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.26■■■■■ 4.04
SLC6A9-209ENST00000492434 SHROOM2Q13796 1616 aa40.21■■■■■ 4.03
SLC6A9-209ENST00000492434 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.94■■■■□ 3.98
SLC6A9-209ENST00000492434 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.92■■■■□ 3.98
SLC6A9-209ENST00000492434 JPH4Q96JJ6 628 aa39.88■■■■□ 3.97
SLC6A9-209ENST00000492434 IGF1RP08069 1367 aa39.78■■■■□ 3.96
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