RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492338.2

TNS1-218, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 3

Gene TNS1, Length 957 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-218ENST00000492338 NISCHQ9Y2I1 1504 aa25.07■■□□□ 1.6
TNS1-218ENST00000492338 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.99■■□□□ 1.43
TNS1-218ENST00000492338 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
TNS1-218ENST00000492338 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa22.25■■□□□ 1.15
TNS1-218ENST00000492338 ABCC9O60706 1549 aa22.11■■□□□ 1.13
TNS1-218ENST00000492338 DCAF8L2P0C7V8 631 aa21.28■■□□□ 1
TNS1-218ENST00000492338 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
TNS1-218ENST00000492338 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.14■□□□□ 0.98
TNS1-218ENST00000492338 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.11■□□□□ 0.97
TNS1-218ENST00000492338 NACADO15069 1562 aa21.07■□□□□ 0.96
TNS1-218ENST00000492338 MYO15BQ96JP2 1530 aa20.87■□□□□ 0.93
TNS1-218ENST00000492338 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
TNS1-218ENST00000492338 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP20.73■□□□□ 0.91
TNS1-218ENST00000492338 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa20.7■□□□□ 0.9
TNS1-218ENST00000492338 UNC13AQ9UPW8 1703 aa20.47■□□□□ 0.87
TNS1-218ENST00000492338 BICRAQ9NZM4 1560 aa20.42■□□□□ 0.86
TNS1-218ENST00000492338 SCRIBQ14160 1630 aa20.37■□□□□ 0.85
TNS1-218ENST00000492338 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa20.26■□□□□ 0.83
TNS1-218ENST00000492338 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa20.07■□□□□ 0.8
TNS1-218ENST00000492338 PLPPR3Q6T4P5 718 aa19.96■□□□□ 0.79
TNS1-218ENST00000492338 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
TNS1-218ENST00000492338 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa19.91■□□□□ 0.78
TNS1-218ENST00000492338 CECR2Q9BXF3 1484 aa19.9■□□□□ 0.78
TNS1-218ENST00000492338 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
TNS1-218ENST00000492338 NCAPD3P42695 1498 aa19.48■□□□□ 0.71
TNS1-218ENST00000492338 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa19.46■□□□□ 0.71
TNS1-218ENST00000492338 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
TNS1-218ENST00000492338 SMARCA4P51532 1647 aa19.43■□□□□ 0.7
TNS1-218ENST00000492338 SMARCA2P51531 1590 aa19.41■□□□□ 0.7
TNS1-218ENST00000492338 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
TNS1-218ENST00000492338 MROH2BQ7Z745 1585 aa19.31■□□□□ 0.68
TNS1-218ENST00000492338 HMGXB3Q12766 1538 aa19.3■□□□□ 0.68
TNS1-218ENST00000492338 PEG3Q9GZU2 1588 aa19.23■□□□□ 0.67
TNS1-218ENST00000492338 CUX2O14529 1486 aa19.13■□□□□ 0.65
TNS1-218ENST00000492338 ERCC6Q03468 1493 aa19.13■□□□□ 0.65
TNS1-218ENST00000492338 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
TNS1-218ENST00000492338 NESP48681 1621 aa19.04■□□□□ 0.64
TNS1-218ENST00000492338 WIZO95785 1651 aa19.04■□□□□ 0.64
TNS1-218ENST00000492338 CADPSQ9ULU8 1353 aa18.96■□□□□ 0.63
TNS1-218ENST00000492338 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa18.94■□□□□ 0.62
TNS1-218ENST00000492338 PDS5BQ9NTI5 1447 aa18.94■□□□□ 0.62
TNS1-218ENST00000492338 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
TNS1-218ENST00000492338 TRIM41Q8WV44 630 aa18.82■□□□□ 0.6
TNS1-218ENST00000492338 CFTRP13569 1480 aa18.74■□□□□ 0.59
TNS1-218ENST00000492338 ADRA2BP18089 450 aa18.73■□□□□ 0.59
TNS1-218ENST00000492338 FANCD2Q9BXW9 1451 aa18.71■□□□□ 0.59
TNS1-218ENST00000492338 EHMT2Q96KQ7 1210 aa18.7■□□□□ 0.58
TNS1-218ENST00000492338 CCDC88BA6NC98 1476 aa18.7■□□□□ 0.58
TNS1-218ENST00000492338 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa18.69■□□□□ 0.58
TNS1-218ENST00000492338 MRC2Q9UBG0 1479 aa18.69■□□□□ 0.58
TNS1-218ENST00000492338 CEP164Q9UPV0 1460 aa18.69■□□□□ 0.58
TNS1-218ENST00000492338 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
TNS1-218ENST00000492338 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
TNS1-218ENST00000492338 KCNA4P22459 653 aa18.61■□□□□ 0.57
TNS1-218ENST00000492338 WDR62O43379 1518 aa18.57■□□□□ 0.56
TNS1-218ENST00000492338 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
TNS1-218ENST00000492338 PPP6R1Q9UPN7 881 aa18.41■□□□□ 0.54
TNS1-218ENST00000492338 ABCC8Q09428 1581 aa18.4■□□□□ 0.54
TNS1-218ENST00000492338 PRDM2Q13029 1718 aa18.39■□□□□ 0.53
TNS1-218ENST00000492338 TOPBP1Q92547 1522 aa18.35■□□□□ 0.53
TNS1-218ENST00000492338 IFT140Q96RY7 1462 aa18.32■□□□□ 0.52
TNS1-218ENST00000492338 DNMBPQ6XZF7 1577 aa18.29■□□□□ 0.52
TNS1-218ENST00000492338 OSCARQ8IYS5 282 aa18.26■□□□□ 0.51
TNS1-218ENST00000492338 FOXD1Q16676 465 aa18.21■□□□□ 0.51
TNS1-218ENST00000492338 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
TNS1-218ENST00000492338 SOGA1O94964 1423 aa18.19■□□□□ 0.5
TNS1-218ENST00000492338 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
TNS1-218ENST00000492338 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP18.14■□□□□ 0.53e-10■■□□□ 13.7
TNS1-218ENST00000492338 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa18.14■□□□□ 0.49
TNS1-218ENST00000492338 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
TNS1-218ENST00000492338 FGD5Q6ZNL6 1462 aa18.12■□□□□ 0.49
TNS1-218ENST00000492338 CUX1P39880 1505 aa18.12■□□□□ 0.49
TNS1-218ENST00000492338 FBLN2P98095 1184 aa18.1■□□□□ 0.49
TNS1-218ENST00000492338 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
TNS1-218ENST00000492338 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
TNS1-218ENST00000492338 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP18.01■□□□□ 0.47
TNS1-218ENST00000492338 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
TNS1-218ENST00000492338 GRIN2BQ13224 1484 aa17.96■□□□□ 0.47
TNS1-218ENST00000492338 CSRNP3Q8WYN3 585 aa17.96■□□□□ 0.47
TNS1-218ENST00000492338 WDR97A6NE52 1622 aa17.95■□□□□ 0.46
TNS1-218ENST00000492338 GAPVD1Q14C86 1478 aa17.94■□□□□ 0.46
TNS1-218ENST00000492338 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa17.93■□□□□ 0.46
TNS1-218ENST00000492338 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa17.93■□□□□ 0.46
TNS1-218ENST00000492338 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa17.92■□□□□ 0.46
TNS1-218ENST00000492338 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa17.92■□□□□ 0.46
TNS1-218ENST00000492338 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa17.92■□□□□ 0.46
TNS1-218ENST00000492338 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
TNS1-218ENST00000492338 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
TNS1-218ENST00000492338 TOP2BQ02880 1626 aa17.9■□□□□ 0.46
TNS1-218ENST00000492338 SYNJ1O43426 1573 aa17.86■□□□□ 0.45
TNS1-218ENST00000492338 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa17.84■□□□□ 0.45
TNS1-218ENST00000492338 SYNJ2O15056 1496 aa17.84■□□□□ 0.45
TNS1-218ENST00000492338 CHD1O14646 1710 aa17.83■□□□□ 0.44
TNS1-218ENST00000492338 CYB5RLQ6IPT4 315 aa17.8■□□□□ 0.44
TNS1-218ENST00000492338 ARHGEF11O15085 1522 aa17.79■□□□□ 0.44
TNS1-218ENST00000492338 TRHP20396 242 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
TNS1-218ENST00000492338 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa17.78■□□□□ 0.44
TNS1-218ENST00000492338 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa17.75■□□□□ 0.43
TNS1-218ENST00000492338 PBRM1Q86U86 1689 aa17.74■□□□□ 0.43
TNS1-218ENST00000492338 FHAD1B1AJZ9 1412 aa17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.1 ms