RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492161.1

FAM198A-205, Transcript of family with sequence similarity 198 member A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAM198A, Length 1,073 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM198A-205ENST00000492161 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.88■■■■■ 6.54
FAM198A-205ENST00000492161 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.98■■■■■ 5.59
FAM198A-205ENST00000492161 ABCC9O60706 1549 aa49.65■■■■■ 5.54
FAM198A-205ENST00000492161 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.45■■■■■ 5.19
FAM198A-205ENST00000492161 NACADO15069 1562 aa47.2■■■■■ 5.15
FAM198A-205ENST00000492161 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.12■■■■■ 5.13
FAM198A-205ENST00000492161 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.66■■■■■ 5.06
FAM198A-205ENST00000492161 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.4■■■■■ 5.02
FAM198A-205ENST00000492161 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.3■■■■■ 5
FAM198A-205ENST00000492161 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.2■■■■■ 4.99
FAM198A-205ENST00000492161 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.19■■■■■ 4.99
FAM198A-205ENST00000492161 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.14■■■■■ 4.98
FAM198A-205ENST00000492161 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.93■■■■■ 4.94
FAM198A-205ENST00000492161 SCRIBQ14160 1630 aa45.59■■■■■ 4.89
FAM198A-205ENST00000492161 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.5■■■■■ 4.87
FAM198A-205ENST00000492161 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.86■■■■■ 4.77
FAM198A-205ENST00000492161 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.84■■■■■ 4.77
FAM198A-205ENST00000492161 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.72■■■■■ 4.75
FAM198A-205ENST00000492161 NCAPD3P42695 1498 aa43.55■■■■■ 4.56
FAM198A-205ENST00000492161 SMARCA4P51532 1647 aa43.51■■■■■ 4.56
FAM198A-205ENST00000492161 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.47■■■■■ 4.55
FAM198A-205ENST00000492161 SMARCA2P51531 1590 aa43.41■■■■■ 4.54
FAM198A-205ENST00000492161 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.4■■■■■ 4.54
FAM198A-205ENST00000492161 HMGXB3Q12766 1538 aa43.27■■■■■ 4.52
FAM198A-205ENST00000492161 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.13■■■■■ 4.5
FAM198A-205ENST00000492161 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.07■■■■■ 4.48
FAM198A-205ENST00000492161 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.04■■■■■ 4.48
FAM198A-205ENST00000492161 ERCC6Q03468 1493 aa42.94■■■■■ 4.46
FAM198A-205ENST00000492161 NESP48681 1621 aa42.71■■■■■ 4.43
FAM198A-205ENST00000492161 CUX2O14529 1486 aa42.67■■■■■ 4.42
FAM198A-205ENST00000492161 WIZO95785 1651 aa42.53■■■■■ 4.4
FAM198A-205ENST00000492161 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.52■■■■■ 4.4
FAM198A-205ENST00000492161 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.33■■■■■ 4.37
FAM198A-205ENST00000492161 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.31■■■■■ 4.36
FAM198A-205ENST00000492161 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.27■■■■■ 4.36
FAM198A-205ENST00000492161 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.2■■■■■ 4.35
FAM198A-205ENST00000492161 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.18■■■■■ 4.34
FAM198A-205ENST00000492161 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.15■■■■■ 4.34
FAM198A-205ENST00000492161 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.09■■■■■ 4.33
FAM198A-205ENST00000492161 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.91■■■■■ 4.3
FAM198A-205ENST00000492161 CFTRP13569 1480 aa41.85■■■■■ 4.29
FAM198A-205ENST00000492161 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.84■■■■■ 4.29
FAM198A-205ENST00000492161 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.8■■■■■ 4.28
FAM198A-205ENST00000492161 WDR62O43379 1518 aa41.76■■■■■ 4.28
FAM198A-205ENST00000492161 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.58■■■■■ 4.25
FAM198A-205ENST00000492161 PRDM2Q13029 1718 aa41.39■■■■■ 4.22
FAM198A-205ENST00000492161 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.39■■■■■ 4.22
FAM198A-205ENST00000492161 ABCC8Q09428 1581 aa41.03■■■■■ 4.16
FAM198A-205ENST00000492161 TOPBP1Q92547 1522 aa41.03■■■■■ 4.16
FAM198A-205ENST00000492161 IFT140Q96RY7 1462 aa40.98■■■■■ 4.15
FAM198A-205ENST00000492161 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.92■■■■■ 4.14
FAM198A-205ENST00000492161 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.82■■■■■ 4.12
FAM198A-205ENST00000492161 OSCARQ8IYS5 282 aa40.81■■■■■ 4.12
FAM198A-205ENST00000492161 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.8■■■■■ 4.12
FAM198A-205ENST00000492161 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
FAM198A-205ENST00000492161 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.63■■■■■ 4.09
FAM198A-205ENST00000492161 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.58■■■■■ 4.09
FAM198A-205ENST00000492161 TRIM41Q8WV44 630 aa40.57■■■■■ 4.09
FAM198A-205ENST00000492161 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.51■■■■■ 4.08
FAM198A-205ENST00000492161 SOGA1O94964 1423 aa40.49■■■■■ 4.07
FAM198A-205ENST00000492161 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.46■■■■■ 4.07
FAM198A-205ENST00000492161 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.45■■■■■ 4.07
FAM198A-205ENST00000492161 CUX1P39880 1505 aa40.43■■■■■ 4.06
FAM198A-205ENST00000492161 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.35■■■■■ 4.05
FAM198A-205ENST00000492161 WDR97A6NE52 1622 aa40.27■■■■■ 4.04
FAM198A-205ENST00000492161 FBLN2P98095 1184 aa40.27■■■■■ 4.04
FAM198A-205ENST00000492161 CHD1O14646 1710 aa40.2■■■■■ 4.03
FAM198A-205ENST00000492161 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.15■■■■■ 4.02
FAM198A-205ENST00000492161 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.15■■■■■ 4.02
FAM198A-205ENST00000492161 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.15■■■■■ 4.02
FAM198A-205ENST00000492161 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.14■■■■■ 4.02
FAM198A-205ENST00000492161 ARHGEF11O15085 1522 aa40.11■■■■■ 4.01
FAM198A-205ENST00000492161 GRIN2BQ13224 1484 aa40.1■■■■■ 4.01
FAM198A-205ENST00000492161 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.07■■■■■ 4
FAM198A-205ENST00000492161 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.03■■■■■ 4
FAM198A-205ENST00000492161 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40■■■■□ 3.99
FAM198A-205ENST00000492161 GAPVD1Q14C86 1478 aa40■■■■□ 3.99
FAM198A-205ENST00000492161 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.97■■■■□ 3.99
FAM198A-205ENST00000492161 SYNJ2O15056 1496 aa39.93■■■■□ 3.98
FAM198A-205ENST00000492161 TOP2BQ02880 1626 aa39.9■■■■□ 3.98
FAM198A-205ENST00000492161 PBRM1Q86U86 1689 aa39.89■■■■□ 3.98
FAM198A-205ENST00000492161 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.88■■■■□ 3.97
FAM198A-205ENST00000492161 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.87■■■■□ 3.97
FAM198A-205ENST00000492161 SYNJ1O43426 1573 aa39.87■■■■□ 3.97
FAM198A-205ENST00000492161 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.82■■■■□ 3.97
FAM198A-205ENST00000492161 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.78■■■■□ 3.96
FAM198A-205ENST00000492161 ARAP1Q96P48 1450 aa39.71■■■■□ 3.95
FAM198A-205ENST00000492161 ADAMTS12P58397 1594 aa39.58■■■■□ 3.93
FAM198A-205ENST00000492161 GRIN2AQ12879 1464 aa39.56■■■■□ 3.92
FAM198A-205ENST00000492161 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.52■■■■□ 3.92
FAM198A-205ENST00000492161 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.52■■■■□ 3.92
FAM198A-205ENST00000492161 NUP160Q12769 1436 aa39.4■■■■□ 3.9
FAM198A-205ENST00000492161 CEP170Q5SW79 1584 aa39.36■■■■□ 3.89
FAM198A-205ENST00000492161 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.32■■■■□ 3.89
FAM198A-205ENST00000492161 KIF27Q86VH2 1401 aa39.22■■■■□ 3.87
FAM198A-205ENST00000492161 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.15■■■■□ 3.86
FAM198A-205ENST00000492161 SHROOM2Q13796 1616 aa39.14■■■■□ 3.86
FAM198A-205ENST00000492161 IGF1RP08069 1367 aa39.08■■■■□ 3.85
FAM198A-205ENST00000492161 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.03■■■■□ 3.84
FAM198A-205ENST00000492161 CUL7Q14999 1698 aa39.03■■■■□ 3.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.3 ms