RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492068.2

PTGDS-209, Transcript of prostaglandin D2 synthase, humanhuman

TSL 2

Gene PTGDS, Length 754 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDS-209ENST00000492068 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.12■■■■■ 7.21
PTGDS-209ENST00000492068 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.45■■■■■ 6.15
PTGDS-209ENST00000492068 ABCC9O60706 1549 aa52.44■■■■■ 5.98
PTGDS-209ENST00000492068 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.35■■■■■ 5.65
PTGDS-209ENST00000492068 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.29■■■■■ 5.64
PTGDS-209ENST00000492068 NACADO15069 1562 aa50.27■■■■■ 5.64
PTGDS-209ENST00000492068 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.05■■■■■ 5.6
PTGDS-209ENST00000492068 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.92■■■■■ 5.58
PTGDS-209ENST00000492068 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.7■■■■■ 5.55
PTGDS-209ENST00000492068 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.29■■■■■ 5.48
PTGDS-209ENST00000492068 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.01■■■■■ 5.44
PTGDS-209ENST00000492068 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.9■■■■■ 5.42
PTGDS-209ENST00000492068 SCRIBQ14160 1630 aa48.82■■■■■ 5.41
PTGDS-209ENST00000492068 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.27■■■■■ 5.32
PTGDS-209ENST00000492068 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.25■■■■■ 5.31
PTGDS-209ENST00000492068 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.58■■■■■ 5.21
PTGDS-209ENST00000492068 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.42■■■■■ 5.18
PTGDS-209ENST00000492068 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.09■■■■■ 5.13
PTGDS-209ENST00000492068 SMARCA4P51532 1647 aa46.67■■■■■ 5.06
PTGDS-209ENST00000492068 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.57■■■■■ 5.05
PTGDS-209ENST00000492068 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.44■■■■■ 5.02
PTGDS-209ENST00000492068 NCAPD3P42695 1498 aa46.4■■■■■ 5.02
PTGDS-209ENST00000492068 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.37■■■■■ 5.01
PTGDS-209ENST00000492068 SMARCA2P51531 1590 aa46.34■■■■■ 5.01
PTGDS-209ENST00000492068 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.19■■■■■ 4.99
PTGDS-209ENST00000492068 HMGXB3Q12766 1538 aa46.15■■■■■ 4.98
PTGDS-209ENST00000492068 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.03■■■■■ 4.96
PTGDS-209ENST00000492068 WIZO95785 1651 aa45.88■■■■■ 4.93
PTGDS-209ENST00000492068 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.79■■■■■ 4.92
PTGDS-209ENST00000492068 NESP48681 1621 aa45.38■■■■■ 4.86
PTGDS-209ENST00000492068 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.32■■■■■ 4.85
PTGDS-209ENST00000492068 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.18■■■■■ 4.82
PTGDS-209ENST00000492068 ERCC6Q03468 1493 aa45.16■■■■■ 4.82
PTGDS-209ENST00000492068 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.05■■■■■ 4.8
PTGDS-209ENST00000492068 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.86■■■■■ 4.77
PTGDS-209ENST00000492068 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.83■■■■■ 4.77
PTGDS-209ENST00000492068 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.83■■■■■ 4.77
PTGDS-209ENST00000492068 CFTRP13569 1480 aa44.77■■■■■ 4.76
PTGDS-209ENST00000492068 CUX2O14529 1486 aa44.69■■■■■ 4.74
PTGDS-209ENST00000492068 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.68■■■■■ 4.74
PTGDS-209ENST00000492068 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.59■■■■■ 4.73
PTGDS-209ENST00000492068 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.54■■■■■ 4.72
PTGDS-209ENST00000492068 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.47■■■■■ 4.71
PTGDS-209ENST00000492068 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.43■■■■■ 4.7
PTGDS-209ENST00000492068 PRDM2Q13029 1718 aa44.42■■■■■ 4.7
PTGDS-209ENST00000492068 WDR62O43379 1518 aa44.29■■■■■ 4.68
PTGDS-209ENST00000492068 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.14■■■■■ 4.66
PTGDS-209ENST00000492068 TOPBP1Q92547 1522 aa43.83■■■■■ 4.61
PTGDS-209ENST00000492068 ABCC8Q09428 1581 aa43.75■■■■■ 4.59
PTGDS-209ENST00000492068 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.75■■■■■ 4.59
PTGDS-209ENST00000492068 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.69■■■■■ 4.58
PTGDS-209ENST00000492068 IFT140Q96RY7 1462 aa43.54■■■■■ 4.56
PTGDS-209ENST00000492068 CUX1P39880 1505 aa43.49■■■■■ 4.55
PTGDS-209ENST00000492068 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.45■■■■■ 4.55
PTGDS-209ENST00000492068 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.42■■■■■ 4.54
PTGDS-209ENST00000492068 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.38■■■■■ 4.54
PTGDS-209ENST00000492068 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.34■■■■■ 4.53
PTGDS-209ENST00000492068 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.3■■■■■ 4.52
PTGDS-209ENST00000492068 SOGA1O94964 1423 aa43.27■■■■■ 4.52
PTGDS-209ENST00000492068 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.21■■■■■ 4.51
PTGDS-209ENST00000492068 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.16■■■■■ 4.5
PTGDS-209ENST00000492068 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.14■■■■■ 4.5
PTGDS-209ENST00000492068 SYNJ1O43426 1573 aa43.09■■■■■ 4.49
PTGDS-209ENST00000492068 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.08■■■■■ 4.49
PTGDS-209ENST00000492068 TOP2BQ02880 1626 aa43.07■■■■■ 4.48
PTGDS-209ENST00000492068 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.06■■■■■ 4.48
PTGDS-209ENST00000492068 WDR97A6NE52 1622 aa43■■■■■ 4.47
PTGDS-209ENST00000492068 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.9■■■■■ 4.46
PTGDS-209ENST00000492068 OSCARQ8IYS5 282 aa42.85■■■■■ 4.45
PTGDS-209ENST00000492068 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.76■■■■■ 4.44
PTGDS-209ENST00000492068 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.75■■■■■ 4.43
PTGDS-209ENST00000492068 GRIN2BQ13224 1484 aa42.75■■■■■ 4.43
PTGDS-209ENST00000492068 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.74■■■■■ 4.43
PTGDS-209ENST00000492068 CHD1O14646 1710 aa42.71■■■■■ 4.43
PTGDS-209ENST00000492068 PBRM1Q86U86 1689 aa42.7■■■■■ 4.43
PTGDS-209ENST00000492068 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.63■■■■■ 4.42
PTGDS-209ENST00000492068 FBLN2P98095 1184 aa42.63■■■■■ 4.41
PTGDS-209ENST00000492068 SYNJ2O15056 1496 aa42.49■■■■■ 4.39
PTGDS-209ENST00000492068 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.48■■■■■ 4.39
PTGDS-209ENST00000492068 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.36■■■■■ 4.37
PTGDS-209ENST00000492068 ADAMTS12P58397 1594 aa42.34■■■■■ 4.37
PTGDS-209ENST00000492068 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.25■■■■■ 4.35
PTGDS-209ENST00000492068 KIF27Q86VH2 1401 aa42.23■■■■■ 4.35
PTGDS-209ENST00000492068 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.22■■■■■ 4.35
PTGDS-209ENST00000492068 GRIN2AQ12879 1464 aa42.22■■■■■ 4.35
PTGDS-209ENST00000492068 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.21■■■■■ 4.35
PTGDS-209ENST00000492068 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.21■■■■■ 4.35
PTGDS-209ENST00000492068 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.21■■■■■ 4.35
PTGDS-209ENST00000492068 ARHGEF11O15085 1522 aa42.17■■■■■ 4.34
PTGDS-209ENST00000492068 TRIM41Q8WV44 630 aa42.13■■■■■ 4.33
PTGDS-209ENST00000492068 IGF1RP08069 1367 aa42.12■■■■■ 4.33
PTGDS-209ENST00000492068 CEP170Q5SW79 1584 aa42.05■■■■■ 4.32
PTGDS-209ENST00000492068 NUP160Q12769 1436 aa42.03■■■■■ 4.32
PTGDS-209ENST00000492068 CUL7Q14999 1698 aa41.96■■■■■ 4.31
PTGDS-209ENST00000492068 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.93■■■■■ 4.3
PTGDS-209ENST00000492068 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.85■■■■■ 4.29
PTGDS-209ENST00000492068 ARAP1Q96P48 1450 aa41.85■■■■■ 4.29
PTGDS-209ENST00000492068 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.81■■■■■ 4.28
PTGDS-209ENST00000492068 SHROOM2Q13796 1616 aa41.73■■■■■ 4.27
PTGDS-209ENST00000492068 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.7■■■■■ 4.27
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