RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491958.5

SELENOM-208, Transcript of selenoprotein M, humanhuman

TSL 2

Gene SELENOM, Length 605 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOM-208ENST00000491958 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.02■■■■■ 4.16
SELENOM-208ENST00000491958 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.77■■■■□ 3.48
SELENOM-208ENST00000491958 ABCC9O60706 1549 aa36.49■■■■□ 3.43
SELENOM-208ENST00000491958 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.85■■■■□ 3.17
SELENOM-208ENST00000491958 NACADO15069 1562 aa34.67■■■■□ 3.14
SELENOM-208ENST00000491958 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.32■■■■□ 3.08
SELENOM-208ENST00000491958 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.3■■■■□ 3.08
SELENOM-208ENST00000491958 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.13■■■■□ 3.05
SELENOM-208ENST00000491958 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.04
SELENOM-208ENST00000491958 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.06■■■■□ 3.04
SELENOM-208ENST00000491958 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.94■■■■□ 3.02
SELENOM-208ENST00000491958 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.93■■■■□ 3.02
SELENOM-208ENST00000491958 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.89■■■■□ 3.02
SELENOM-208ENST00000491958 SCRIBQ14160 1630 aa33.47■■■□□ 2.95
SELENOM-208ENST00000491958 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.45■■■□□ 2.95
SELENOM-208ENST00000491958 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.02■■■□□ 2.88
SELENOM-208ENST00000491958 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.01■■■□□ 2.88
SELENOM-208ENST00000491958 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.86■■■□□ 2.85
SELENOM-208ENST00000491958 NCAPD3P42695 1498 aa32■■■□□ 2.71
SELENOM-208ENST00000491958 SMARCA4P51532 1647 aa31.97■■■□□ 2.71
SELENOM-208ENST00000491958 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.93■■■□□ 2.7
SELENOM-208ENST00000491958 SMARCA2P51531 1590 aa31.85■■■□□ 2.69
SELENOM-208ENST00000491958 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.82■■■□□ 2.68
SELENOM-208ENST00000491958 HMGXB3Q12766 1538 aa31.82■■■□□ 2.68
SELENOM-208ENST00000491958 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.7■■■□□ 2.67
SELENOM-208ENST00000491958 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
SELENOM-208ENST00000491958 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.6■■■□□ 2.65
SELENOM-208ENST00000491958 ERCC6Q03468 1493 aa31.46■■■□□ 2.63
SELENOM-208ENST00000491958 NESP48681 1621 aa31.43■■■□□ 2.62
SELENOM-208ENST00000491958 CUX2O14529 1486 aa31.4■■■□□ 2.62
SELENOM-208ENST00000491958 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.26■■■□□ 2.6
SELENOM-208ENST00000491958 WIZO95785 1651 aa31.24■■■□□ 2.59
SELENOM-208ENST00000491958 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.58
SELENOM-208ENST00000491958 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.11■■■□□ 2.57
SELENOM-208ENST00000491958 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.07■■■□□ 2.56
SELENOM-208ENST00000491958 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.01■■■□□ 2.55
SELENOM-208ENST00000491958 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
SELENOM-208ENST00000491958 CADPSQ9ULU8 1353 aa31■■■□□ 2.55
SELENOM-208ENST00000491958 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
SELENOM-208ENST00000491958 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.77■■■□□ 2.52
SELENOM-208ENST00000491958 WDR62O43379 1518 aa30.74■■■□□ 2.51
SELENOM-208ENST00000491958 CFTRP13569 1480 aa30.73■■■□□ 2.51
SELENOM-208ENST00000491958 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.69■■■□□ 2.5
SELENOM-208ENST00000491958 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.66■■■□□ 2.5
SELENOM-208ENST00000491958 PRDM2Q13029 1718 aa30.49■■■□□ 2.47
SELENOM-208ENST00000491958 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.48■■■□□ 2.47
SELENOM-208ENST00000491958 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
SELENOM-208ENST00000491958 TOPBP1Q92547 1522 aa30.12■■■□□ 2.41
SELENOM-208ENST00000491958 IFT140Q96RY7 1462 aa30.06■■■□□ 2.4
SELENOM-208ENST00000491958 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.05■■■□□ 2.4
SELENOM-208ENST00000491958 ABCC8Q09428 1581 aa30.04■■■□□ 2.4
SELENOM-208ENST00000491958 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.4
SELENOM-208ENST00000491958 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
SELENOM-208ENST00000491958 OSCARQ8IYS5 282 aa29.89■■■□□ 2.38
SELENOM-208ENST00000491958 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
SELENOM-208ENST00000491958 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
SELENOM-208ENST00000491958 TRIM41Q8WV44 630 aa29.76■■■□□ 2.35
SELENOM-208ENST00000491958 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.73■■■□□ 2.351e-6■■■■■ 27.1
SELENOM-208ENST00000491958 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.69■■■□□ 2.34
SELENOM-208ENST00000491958 CUX1P39880 1505 aa29.69■■■□□ 2.34
SELENOM-208ENST00000491958 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.67■■■□□ 2.34
SELENOM-208ENST00000491958 SOGA1O94964 1423 aa29.64■■■□□ 2.34
SELENOM-208ENST00000491958 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
SELENOM-208ENST00000491958 CHD1O14646 1710 aa29.62■■■□□ 2.33
SELENOM-208ENST00000491958 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.61■■■□□ 2.33
SELENOM-208ENST00000491958 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.61■■■□□ 2.33
SELENOM-208ENST00000491958 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.61■■■□□ 2.33
SELENOM-208ENST00000491958 WDR97A6NE52 1622 aa29.6■■■□□ 2.33
SELENOM-208ENST00000491958 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
SELENOM-208ENST00000491958 ARHGEF11O15085 1522 aa29.53■■■□□ 2.32
SELENOM-208ENST00000491958 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.46■■■□□ 2.31
SELENOM-208ENST00000491958 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
SELENOM-208ENST00000491958 FBLN2P98095 1184 aa29.39■■■□□ 2.3
SELENOM-208ENST00000491958 GRIN2BQ13224 1484 aa29.39■■■□□ 2.3
SELENOM-208ENST00000491958 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.35■■■□□ 2.29
SELENOM-208ENST00000491958 PBRM1Q86U86 1689 aa29.35■■■□□ 2.29
SELENOM-208ENST00000491958 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.34■■■□□ 2.29
SELENOM-208ENST00000491958 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.31■■■□□ 2.28
SELENOM-208ENST00000491958 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.3■■■□□ 2.28
SELENOM-208ENST00000491958 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.3■■■□□ 2.28
SELENOM-208ENST00000491958 SYNJ2O15056 1496 aa29.29■■■□□ 2.28
SELENOM-208ENST00000491958 TOP2BQ02880 1626 aa29.27■■■□□ 2.28
SELENOM-208ENST00000491958 ARAP1Q96P48 1450 aa29.26■■■□□ 2.27
SELENOM-208ENST00000491958 SYNJ1O43426 1573 aa29.26■■■□□ 2.27
SELENOM-208ENST00000491958 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
SELENOM-208ENST00000491958 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.22■■■□□ 2.27
SELENOM-208ENST00000491958 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.18■■■□□ 2.26
SELENOM-208ENST00000491958 ADAMTS12P58397 1594 aa29.09■■■□□ 2.25
SELENOM-208ENST00000491958 GRIN2AQ12879 1464 aa29.04■■■□□ 2.24
SELENOM-208ENST00000491958 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.99■■■□□ 2.23
SELENOM-208ENST00000491958 CEP170Q5SW79 1584 aa28.96■■■□□ 2.23
SELENOM-208ENST00000491958 NUP160Q12769 1436 aa28.95■■■□□ 2.23
SELENOM-208ENST00000491958 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.94■■■□□ 2.22
SELENOM-208ENST00000491958 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.85■■■□□ 2.21
SELENOM-208ENST00000491958 SHROOM2Q13796 1616 aa28.84■■■□□ 2.21
SELENOM-208ENST00000491958 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
SELENOM-208ENST00000491958 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.69■■■□□ 2.18
SELENOM-208ENST00000491958 KIF27Q86VH2 1401 aa28.63■■■□□ 2.17
SELENOM-208ENST00000491958 CUL7Q14999 1698 aa28.61■■■□□ 2.17
SELENOM-208ENST00000491958 IGF1RP08069 1367 aa28.61■■■□□ 2.17
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