RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491846.5

ARTN-210, Transcript of artemin, humanhuman

TSL 3

Gene ARTN, Length 524 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARTN-210ENST00000491846 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.22■■■■■ 5.79
ARTN-210ENST00000491846 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.69■■■■■ 4.9
ARTN-210ENST00000491846 ABCC9O60706 1549 aa44.6■■■■■ 4.73
ARTN-210ENST00000491846 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.05■■■■■ 4.48
ARTN-210ENST00000491846 NACADO15069 1562 aa43.01■■■■■ 4.48
ARTN-210ENST00000491846 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.81■■■■■ 4.44
ARTN-210ENST00000491846 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.71■■■■■ 4.43
ARTN-210ENST00000491846 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.63■■■■■ 4.42
ARTN-210ENST00000491846 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.52■■■■■ 4.4
ARTN-210ENST00000491846 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.89■■■■■ 4.3
ARTN-210ENST00000491846 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.61■■■■■ 4.25
ARTN-210ENST00000491846 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.61■■■■■ 4.25
ARTN-210ENST00000491846 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.48■■■■■ 4.23
ARTN-210ENST00000491846 SCRIBQ14160 1630 aa41.45■■■■■ 4.23
ARTN-210ENST00000491846 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.99■■■■■ 4.15
ARTN-210ENST00000491846 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.57■■■■■ 4.09
ARTN-210ENST00000491846 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.42■■■■■ 4.06
ARTN-210ENST00000491846 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.19■■■■■ 4.03
ARTN-210ENST00000491846 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.76■■■■□ 3.96
ARTN-210ENST00000491846 SMARCA4P51532 1647 aa39.74■■■■□ 3.95
ARTN-210ENST00000491846 NCAPD3P42695 1498 aa39.67■■■■□ 3.94
ARTN-210ENST00000491846 SMARCA2P51531 1590 aa39.63■■■■□ 3.93
ARTN-210ENST00000491846 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.58■■■■□ 3.93
ARTN-210ENST00000491846 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.46■■■■□ 3.91
ARTN-210ENST00000491846 HMGXB3Q12766 1538 aa39.45■■■■□ 3.91
ARTN-210ENST00000491846 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.37■■■■□ 3.89
ARTN-210ENST00000491846 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.26■■■■□ 3.88
ARTN-210ENST00000491846 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.92■■■■□ 3.82
ARTN-210ENST00000491846 WIZO95785 1651 aa38.91■■■■□ 3.82
ARTN-210ENST00000491846 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.65■■■■□ 3.78
ARTN-210ENST00000491846 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.61■■■■□ 3.77
ARTN-210ENST00000491846 ERCC6Q03468 1493 aa38.57■■■■□ 3.76
ARTN-210ENST00000491846 NESP48681 1621 aa38.52■■■■□ 3.76
ARTN-210ENST00000491846 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.47■■■■□ 3.75
ARTN-210ENST00000491846 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.42■■■■□ 3.74
ARTN-210ENST00000491846 CUX2O14529 1486 aa38.33■■■■□ 3.73
ARTN-210ENST00000491846 CFTRP13569 1480 aa38.22■■■■□ 3.71
ARTN-210ENST00000491846 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.11■■■■□ 3.69
ARTN-210ENST00000491846 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.1■■■■□ 3.69
ARTN-210ENST00000491846 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.06■■■■□ 3.68
ARTN-210ENST00000491846 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.97■■■■□ 3.67
ARTN-210ENST00000491846 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.97■■■■□ 3.67
ARTN-210ENST00000491846 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.94■■■■□ 3.66
ARTN-210ENST00000491846 PRDM2Q13029 1718 aa37.9■■■■□ 3.66
ARTN-210ENST00000491846 WDR62O43379 1518 aa37.82■■■■□ 3.65
ARTN-210ENST00000491846 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.72■■■■□ 3.63
ARTN-210ENST00000491846 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.54■■■■□ 3.6
ARTN-210ENST00000491846 ABCC8Q09428 1581 aa37.54■■■■□ 3.6
ARTN-210ENST00000491846 TOPBP1Q92547 1522 aa37.34■■■■□ 3.57
ARTN-210ENST00000491846 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.33■■■■□ 3.57
ARTN-210ENST00000491846 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.24■■■■□ 3.55
ARTN-210ENST00000491846 IFT140Q96RY7 1462 aa37.22■■■■□ 3.55
ARTN-210ENST00000491846 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.01■■■■□ 3.51
ARTN-210ENST00000491846 CUX1P39880 1505 aa36.95■■■■□ 3.51
ARTN-210ENST00000491846 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.93■■■■□ 3.5
ARTN-210ENST00000491846 SOGA1O94964 1423 aa36.9■■■■□ 3.5
ARTN-210ENST00000491846 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.89■■■■□ 3.5
ARTN-210ENST00000491846 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.88■■■■□ 3.49
ARTN-210ENST00000491846 WDR97A6NE52 1622 aa36.85■■■■□ 3.49
ARTN-210ENST00000491846 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.8■■■■□ 3.48
ARTN-210ENST00000491846 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.75■■■■□ 3.47
ARTN-210ENST00000491846 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.75■■■■□ 3.47
ARTN-210ENST00000491846 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.69■■■■□ 3.46
ARTN-210ENST00000491846 OSCARQ8IYS5 282 aa36.69■■■■□ 3.46
ARTN-210ENST00000491846 TOP2BQ02880 1626 aa36.69■■■■□ 3.46
ARTN-210ENST00000491846 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.68■■■■□ 3.46
ARTN-210ENST00000491846 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
ARTN-210ENST00000491846 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.6■■■■□ 3.45
ARTN-210ENST00000491846 SYNJ1O43426 1573 aa36.55■■■■□ 3.44
ARTN-210ENST00000491846 GRIN2BQ13224 1484 aa36.51■■■■□ 3.44
ARTN-210ENST00000491846 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.47■■■■□ 3.43
ARTN-210ENST00000491846 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.47■■■■□ 3.43
ARTN-210ENST00000491846 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.41■■■■□ 3.42
ARTN-210ENST00000491846 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.38■■■■□ 3.41
ARTN-210ENST00000491846 PBRM1Q86U86 1689 aa36.33■■■■□ 3.41
ARTN-210ENST00000491846 CHD1O14646 1710 aa36.32■■■■□ 3.4
ARTN-210ENST00000491846 FBLN2P98095 1184 aa36.29■■■■□ 3.4
ARTN-210ENST00000491846 SYNJ2O15056 1496 aa36.29■■■■□ 3.4
ARTN-210ENST00000491846 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
ARTN-210ENST00000491846 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.2■■■■□ 3.39
ARTN-210ENST00000491846 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.08■■■■□ 3.37
ARTN-210ENST00000491846 ADAMTS12P58397 1594 aa36.06■■■■□ 3.36
ARTN-210ENST00000491846 KIF27Q86VH2 1401 aa36.05■■■■□ 3.36
ARTN-210ENST00000491846 GRIN2AQ12879 1464 aa36■■■■□ 3.35
ARTN-210ENST00000491846 CLASP1Q7Z460 1538 aa36■■■■□ 3.35
ARTN-210ENST00000491846 ARHGEF11O15085 1522 aa35.98■■■■□ 3.35
ARTN-210ENST00000491846 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.97■■■■□ 3.35
ARTN-210ENST00000491846 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.97■■■■□ 3.35
ARTN-210ENST00000491846 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.97■■■■□ 3.35
ARTN-210ENST00000491846 NUP160Q12769 1436 aa35.88■■■■□ 3.33
ARTN-210ENST00000491846 IGF1RP08069 1367 aa35.86■■■■□ 3.33
ARTN-210ENST00000491846 CUL7Q14999 1698 aa35.84■■■■□ 3.33
ARTN-210ENST00000491846 TRIM41Q8WV44 630 aa35.79■■■■□ 3.32
ARTN-210ENST00000491846 CEP170Q5SW79 1584 aa35.75■■■■□ 3.31
ARTN-210ENST00000491846 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.66■■■■□ 3.3
ARTN-210ENST00000491846 ARAP1Q96P48 1450 aa35.65■■■■□ 3.3
ARTN-210ENST00000491846 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.64■■■■□ 3.3
ARTN-210ENST00000491846 SHROOM2Q13796 1616 aa35.61■■■■□ 3.29
ARTN-210ENST00000491846 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.53■■■■□ 3.28
ARTN-210ENST00000491846 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.53■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms