RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491780.5

ARPC2-218, Transcript of actin related protein 2/3 complex subunit 2, humanhuman

TSL 4

Gene ARPC2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytosol, Lamellipodium, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC2-218ENST00000491780 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.66■■■■■ 7.3
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ARPC2-218ENST00000491780 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.54■■■■■ 5.84
ARPC2-218ENST00000491780 NACADO15069 1562 aa51.28■■■■■ 5.8
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ARPC2-218ENST00000491780 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.66■■■■■ 5.7
ARPC2-218ENST00000491780 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.58■■■■■ 5.69
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ARPC2-218ENST00000491780 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.32■■■■■ 5.65
ARPC2-218ENST00000491780 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.3■■■■■ 5.64
ARPC2-218ENST00000491780 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.1■■■■■ 5.61
ARPC2-218ENST00000491780 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.01■■■■■ 5.6
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ARPC2-218ENST00000491780 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.4■■■■■ 5.5
ARPC2-218ENST00000491780 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.81■■■■■ 5.4
ARPC2-218ENST00000491780 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.78■■■■■ 5.4
ARPC2-218ENST00000491780 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.7■■■■■ 5.39
ARPC2-218ENST00000491780 NCAPD3P42695 1498 aa47.39■■■■■ 5.18
ARPC2-218ENST00000491780 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.27■■■■■ 5.16
ARPC2-218ENST00000491780 SMARCA4P51532 1647 aa47.21■■■■■ 5.15
ARPC2-218ENST00000491780 SMARCA2P51531 1590 aa47.11■■■■■ 5.13
ARPC2-218ENST00000491780 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.05■■■■■ 5.12
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ARPC2-218ENST00000491780 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.76■■■■■ 5.08
ARPC2-218ENST00000491780 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.73■■■■■ 5.07
ARPC2-218ENST00000491780 ERCC6Q03468 1493 aa46.69■■■■■ 5.06
ARPC2-218ENST00000491780 NESP48681 1621 aa46.52■■■■■ 5.04
ARPC2-218ENST00000491780 CUX2O14529 1486 aa46.49■■■■■ 5.03
ARPC2-218ENST00000491780 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.27■■■■■ 5
ARPC2-218ENST00000491780 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.2■■■■■ 4.99
ARPC2-218ENST00000491780 WIZO95785 1651 aa46.14■■■■■ 4.98
ARPC2-218ENST00000491780 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.02■■■■■ 4.96
ARPC2-218ENST00000491780 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.98■■■■■ 4.95
ARPC2-218ENST00000491780 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.92■■■■■ 4.94
ARPC2-218ENST00000491780 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.91■■■■■ 4.94
ARPC2-218ENST00000491780 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.83■■■■■ 4.93
ARPC2-218ENST00000491780 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.6■■■■■ 4.89
ARPC2-218ENST00000491780 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.55■■■■■ 4.88
ARPC2-218ENST00000491780 CFTRP13569 1480 aa45.48■■■■■ 4.87
ARPC2-218ENST00000491780 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.42■■■■■ 4.86
ARPC2-218ENST00000491780 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.42■■■■■ 4.86
ARPC2-218ENST00000491780 WDR62O43379 1518 aa45.4■■■■■ 4.86
ARPC2-218ENST00000491780 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.14■■■■■ 4.82
ARPC2-218ENST00000491780 PRDM2Q13029 1718 aa45.02■■■■■ 4.8
ARPC2-218ENST00000491780 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.01■■■■■ 4.8
ARPC2-218ENST00000491780 TOPBP1Q92547 1522 aa44.57■■■■■ 4.73
ARPC2-218ENST00000491780 OSCARQ8IYS5 282 aa44.53■■■■■ 4.72
ARPC2-218ENST00000491780 IFT140Q96RY7 1462 aa44.53■■■■■ 4.72
ARPC2-218ENST00000491780 ABCC8Q09428 1581 aa44.52■■■■■ 4.72
ARPC2-218ENST00000491780 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.42■■■■■ 4.7
ARPC2-218ENST00000491780 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.39■■■■■ 4.7
ARPC2-218ENST00000491780 TRIM41Q8WV44 630 aa44.35■■■■■ 4.69
ARPC2-218ENST00000491780 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.16■■■■■ 4.66
ARPC2-218ENST00000491780 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.14■■■■■ 4.66
ARPC2-218ENST00000491780 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.11■■■■■ 4.65
ARPC2-218ENST00000491780 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.1■■■■■ 4.65
ARPC2-218ENST00000491780 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.09■■■■■ 4.652e-9■■■□□ 15.7
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ARPC2-218ENST00000491780 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44■■■■■ 4.63
ARPC2-218ENST00000491780 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.89■■■■■ 4.62
ARPC2-218ENST00000491780 CUX1P39880 1505 aa43.89■■■■■ 4.62
ARPC2-218ENST00000491780 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.89■■■■■ 4.62
ARPC2-218ENST00000491780 FBLN2P98095 1184 aa43.82■■■■■ 4.61
ARPC2-218ENST00000491780 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.75■■■■■ 4.59
ARPC2-218ENST00000491780 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.75■■■■■ 4.59
ARPC2-218ENST00000491780 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.75■■■■■ 4.59
ARPC2-218ENST00000491780 CHD1O14646 1710 aa43.72■■■■■ 4.59
ARPC2-218ENST00000491780 WDR97A6NE52 1622 aa43.72■■■■■ 4.59
ARPC2-218ENST00000491780 ARHGEF11O15085 1522 aa43.68■■■■■ 4.58
ARPC2-218ENST00000491780 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.61■■■■■ 4.57
ARPC2-218ENST00000491780 GRIN2BQ13224 1484 aa43.55■■■■■ 4.56
ARPC2-218ENST00000491780 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.54■■■■■ 4.56
ARPC2-218ENST00000491780 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.51■■■■■ 4.56
ARPC2-218ENST00000491780 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.47■■■■■ 4.55
ARPC2-218ENST00000491780 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.44■■■■■ 4.54
ARPC2-218ENST00000491780 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.42■■■■■ 4.54
ARPC2-218ENST00000491780 SYNJ2O15056 1496 aa43.37■■■■■ 4.53
ARPC2-218ENST00000491780 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.35■■■■■ 4.53
ARPC2-218ENST00000491780 PBRM1Q86U86 1689 aa43.32■■■■■ 4.53
ARPC2-218ENST00000491780 SYNJ1O43426 1573 aa43.29■■■■■ 4.52
ARPC2-218ENST00000491780 ARAP1Q96P48 1450 aa43.28■■■■■ 4.52
ARPC2-218ENST00000491780 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.27■■■■■ 4.52
ARPC2-218ENST00000491780 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.26■■■■■ 4.52
ARPC2-218ENST00000491780 TOP2BQ02880 1626 aa43.23■■■■■ 4.51
ARPC2-218ENST00000491780 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.22■■■■■ 4.51
ARPC2-218ENST00000491780 GRIN2AQ12879 1464 aa42.97■■■■■ 4.47
ARPC2-218ENST00000491780 ADAMTS12P58397 1594 aa42.92■■■■■ 4.46
ARPC2-218ENST00000491780 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.91■■■■■ 4.46
ARPC2-218ENST00000491780 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.91■■■■■ 4.46
ARPC2-218ENST00000491780 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.87■■■■■ 4.45
ARPC2-218ENST00000491780 NUP160Q12769 1436 aa42.83■■■■■ 4.45
ARPC2-218ENST00000491780 CEP170Q5SW79 1584 aa42.77■■■■■ 4.44
ARPC2-218ENST00000491780 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.63■■■■■ 4.41
ARPC2-218ENST00000491780 SHROOM2Q13796 1616 aa42.53■■■■■ 4.4
ARPC2-218ENST00000491780 KIF27Q86VH2 1401 aa42.49■■■■■ 4.39
ARPC2-218ENST00000491780 JPH4Q96JJ6 628 aa42.49■■■■■ 4.39
ARPC2-218ENST00000491780 IGF1RP08069 1367 aa42.47■■■■■ 4.39
ARPC2-218ENST00000491780 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.44■■■■■ 4.38
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