RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491649.1

NOTCH1-202, Transcript of notch 1, humanhuman

TSL 3

Gene NOTCH1, Length 743 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH1-202ENST00000491649 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.99■■■■■ 7.03
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NOTCH1-202ENST00000491649 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.7■■■■■ 5.55
NOTCH1-202ENST00000491649 NACADO15069 1562 aa49.58■■■■■ 5.53
NOTCH1-202ENST00000491649 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.29■■■■■ 5.48
NOTCH1-202ENST00000491649 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.22■■■■■ 5.47
NOTCH1-202ENST00000491649 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.07■■■■■ 5.45
NOTCH1-202ENST00000491649 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.87■■■■■ 5.41
NOTCH1-202ENST00000491649 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.6■■■■■ 5.37
NOTCH1-202ENST00000491649 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.23■■■■■ 5.31
NOTCH1-202ENST00000491649 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.18■■■■■ 5.3
NOTCH1-202ENST00000491649 SCRIBQ14160 1630 aa47.92■■■■■ 5.26
NOTCH1-202ENST00000491649 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.75■■■■■ 5.23
NOTCH1-202ENST00000491649 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.75■■■■■ 5.23
NOTCH1-202ENST00000491649 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.94■■■■■ 5.11
NOTCH1-202ENST00000491649 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.83■■■■■ 5.09
NOTCH1-202ENST00000491649 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.55■■■■■ 5.04
NOTCH1-202ENST00000491649 SMARCA4P51532 1647 aa45.86■■■■■ 4.93
NOTCH1-202ENST00000491649 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.77■■■■■ 4.92
NOTCH1-202ENST00000491649 NCAPD3P42695 1498 aa45.73■■■■■ 4.91
NOTCH1-202ENST00000491649 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.67■■■■■ 4.9
NOTCH1-202ENST00000491649 SMARCA2P51531 1590 aa45.65■■■■■ 4.9
NOTCH1-202ENST00000491649 HMGXB3Q12766 1538 aa45.5■■■■■ 4.87
NOTCH1-202ENST00000491649 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.46■■■■■ 4.87
NOTCH1-202ENST00000491649 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.42■■■■■ 4.86
NOTCH1-202ENST00000491649 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.28■■■■■ 4.84
NOTCH1-202ENST00000491649 WIZO95785 1651 aa44.93■■■■■ 4.78
NOTCH1-202ENST00000491649 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.78■■■■■ 4.76
NOTCH1-202ENST00000491649 NESP48681 1621 aa44.66■■■■■ 4.74
NOTCH1-202ENST00000491649 ERCC6Q03468 1493 aa44.64■■■■■ 4.74
NOTCH1-202ENST00000491649 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.6■■■■■ 4.73
NOTCH1-202ENST00000491649 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.46■■■■■ 4.71
NOTCH1-202ENST00000491649 CUX2O14529 1486 aa44.35■■■■■ 4.69
NOTCH1-202ENST00000491649 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.35■■■■■ 4.69
NOTCH1-202ENST00000491649 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.28■■■■■ 4.68
NOTCH1-202ENST00000491649 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.19■■■■■ 4.66
NOTCH1-202ENST00000491649 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.13■■■■■ 4.65
NOTCH1-202ENST00000491649 CFTRP13569 1480 aa44.04■■■■■ 4.64
NOTCH1-202ENST00000491649 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.9■■■■■ 4.62
NOTCH1-202ENST00000491649 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.83■■■■■ 4.61
NOTCH1-202ENST00000491649 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.83■■■■■ 4.61
NOTCH1-202ENST00000491649 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.83■■■■■ 4.61
NOTCH1-202ENST00000491649 PRDM2Q13029 1718 aa43.76■■■■■ 4.6
NOTCH1-202ENST00000491649 WDR62O43379 1518 aa43.73■■■■■ 4.59
NOTCH1-202ENST00000491649 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.41■■■■■ 4.54
NOTCH1-202ENST00000491649 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.33■■■■■ 4.53
NOTCH1-202ENST00000491649 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.31■■■■■ 4.52
NOTCH1-202ENST00000491649 ABCC8Q09428 1581 aa43.14■■■■■ 4.5
NOTCH1-202ENST00000491649 TOPBP1Q92547 1522 aa43.11■■■■■ 4.49
NOTCH1-202ENST00000491649 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.05■■■■■ 4.48
NOTCH1-202ENST00000491649 IFT140Q96RY7 1462 aa42.94■■■■■ 4.46
NOTCH1-202ENST00000491649 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.71■■■■■ 4.43
NOTCH1-202ENST00000491649 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.71■■■■■ 4.43
NOTCH1-202ENST00000491649 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.69■■■■■ 4.42
NOTCH1-202ENST00000491649 CUX1P39880 1505 aa42.64■■■■■ 4.42
NOTCH1-202ENST00000491649 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.58■■■■■ 4.41
NOTCH1-202ENST00000491649 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.55■■■■■ 4.4
NOTCH1-202ENST00000491649 SOGA1O94964 1423 aa42.52■■■■■ 4.4
NOTCH1-202ENST00000491649 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.49■■■■■ 4.39
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NOTCH1-202ENST00000491649 WDR97A6NE52 1622 aa42.41■■■■■ 4.38
NOTCH1-202ENST00000491649 OSCARQ8IYS5 282 aa42.4■■■■■ 4.38
NOTCH1-202ENST00000491649 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.28■■■■■ 4.36
NOTCH1-202ENST00000491649 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.25■■■■■ 4.35
NOTCH1-202ENST00000491649 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.24■■■■■ 4.35
NOTCH1-202ENST00000491649 TOP2BQ02880 1626 aa42.24■■■■■ 4.35
NOTCH1-202ENST00000491649 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.16■■■■■ 4.34
NOTCH1-202ENST00000491649 SYNJ1O43426 1573 aa42.16■■■■■ 4.34
NOTCH1-202ENST00000491649 CHD1O14646 1710 aa42.12■■■■■ 4.33
NOTCH1-202ENST00000491649 GRIN2BQ13224 1484 aa42.09■■■■■ 4.33
NOTCH1-202ENST00000491649 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.04■■■■■ 4.32
NOTCH1-202ENST00000491649 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.04■■■■■ 4.32
NOTCH1-202ENST00000491649 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.04■■■■■ 4.32
NOTCH1-202ENST00000491649 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.03■■■■■ 4.32
NOTCH1-202ENST00000491649 PBRM1Q86U86 1689 aa42.01■■■■■ 4.32
NOTCH1-202ENST00000491649 FBLN2P98095 1184 aa41.95■■■■■ 4.31
NOTCH1-202ENST00000491649 SYNJ2O15056 1496 aa41.86■■■■■ 4.29
NOTCH1-202ENST00000491649 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.83■■■■■ 4.29
NOTCH1-202ENST00000491649 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.78■■■■■ 4.28
NOTCH1-202ENST00000491649 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.78■■■■■ 4.28
NOTCH1-202ENST00000491649 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.78■■■■■ 4.28
NOTCH1-202ENST00000491649 ARHGEF11O15085 1522 aa41.73■■■■■ 4.27
NOTCH1-202ENST00000491649 TRIM41Q8WV44 630 aa41.67■■■■■ 4.26
NOTCH1-202ENST00000491649 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.67■■■■■ 4.26
NOTCH1-202ENST00000491649 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.66■■■■■ 4.26
NOTCH1-202ENST00000491649 ADAMTS12P58397 1594 aa41.64■■■■■ 4.26
NOTCH1-202ENST00000491649 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.55■■■■■ 4.24
NOTCH1-202ENST00000491649 GRIN2AQ12879 1464 aa41.54■■■■■ 4.24
NOTCH1-202ENST00000491649 KIF27Q86VH2 1401 aa41.4■■■■■ 4.22
NOTCH1-202ENST00000491649 NUP160Q12769 1436 aa41.38■■■■■ 4.22
NOTCH1-202ENST00000491649 ARAP1Q96P48 1450 aa41.35■■■■■ 4.21
NOTCH1-202ENST00000491649 CEP170Q5SW79 1584 aa41.35■■■■■ 4.21
NOTCH1-202ENST00000491649 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.3■■■■■ 4.2
NOTCH1-202ENST00000491649 IGF1RP08069 1367 aa41.25■■■■■ 4.19
NOTCH1-202ENST00000491649 CUL7Q14999 1698 aa41.24■■■■■ 4.19
NOTCH1-202ENST00000491649 SHROOM2Q13796 1616 aa41.15■■■■■ 4.18
NOTCH1-202ENST00000491649 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.04■■■■■ 4.16
NOTCH1-202ENST00000491649 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41■■■■■ 4.15
NOTCH1-202ENST00000491649 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.99■■■■■ 4.15
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