RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491164.1

PXK-212, Transcript of PX domain containing serine/threonine kinase like, humanhuman

TSL 4

Gene PXK, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXK-212ENST00000491164 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.11■■■■■ 6.89
PXK-212ENST00000491164 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.97■■■■■ 5.91
PXK-212ENST00000491164 ABCC9O60706 1549 aa51.24■■■■■ 5.79
PXK-212ENST00000491164 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.19■■■■■ 5.46
PXK-212ENST00000491164 NACADO15069 1562 aa49.03■■■■■ 5.44
PXK-212ENST00000491164 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.71■■■■■ 5.39
PXK-212ENST00000491164 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.64■■■■■ 5.38
PXK-212ENST00000491164 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.27■■■■■ 5.32
PXK-212ENST00000491164 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.17■■■■■ 5.3
PXK-212ENST00000491164 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.93■■■■■ 5.26
PXK-212ENST00000491164 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.79■■■■■ 5.24
PXK-212ENST00000491164 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.62■■■■■ 5.21
PXK-212ENST00000491164 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.57■■■■■ 5.21
PXK-212ENST00000491164 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.3■■■■■ 5.16
PXK-212ENST00000491164 SCRIBQ14160 1630 aa47.19■■■■■ 5.14
PXK-212ENST00000491164 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.45■■■■■ 5.03
PXK-212ENST00000491164 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.38■■■■■ 5.01
PXK-212ENST00000491164 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.19■■■■■ 4.98
PXK-212ENST00000491164 NCAPD3P42695 1498 aa45.25■■■■■ 4.83
PXK-212ENST00000491164 SMARCA4P51532 1647 aa45.18■■■■■ 4.82
PXK-212ENST00000491164 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.11■■■■■ 4.81
PXK-212ENST00000491164 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.11■■■■■ 4.81
PXK-212ENST00000491164 SMARCA2P51531 1590 aa45.09■■■■■ 4.81
PXK-212ENST00000491164 HMGXB3Q12766 1538 aa44.94■■■■■ 4.78
PXK-212ENST00000491164 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.84■■■■■ 4.77
PXK-212ENST00000491164 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.71■■■■■ 4.75
PXK-212ENST00000491164 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.7■■■■■ 4.75
PXK-212ENST00000491164 ERCC6Q03468 1493 aa44.28■■■■■ 4.68
PXK-212ENST00000491164 WIZO95785 1651 aa44.16■■■■■ 4.66
PXK-212ENST00000491164 NESP48681 1621 aa44.15■■■■■ 4.66
PXK-212ENST00000491164 CUX2O14529 1486 aa44.13■■■■■ 4.65
PXK-212ENST00000491164 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.13■■■■■ 4.65
PXK-212ENST00000491164 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.04■■■■■ 4.64
PXK-212ENST00000491164 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.89■■■■■ 4.62
PXK-212ENST00000491164 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.88■■■■■ 4.61
PXK-212ENST00000491164 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.74■■■■■ 4.59
PXK-212ENST00000491164 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.67■■■■■ 4.58
PXK-212ENST00000491164 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.63■■■■■ 4.58
PXK-212ENST00000491164 CFTRP13569 1480 aa43.49■■■■■ 4.55
PXK-212ENST00000491164 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.45■■■■■ 4.55
PXK-212ENST00000491164 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.38■■■■■ 4.54
PXK-212ENST00000491164 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.32■■■■■ 4.53
PXK-212ENST00000491164 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.32■■■■■ 4.52
PXK-212ENST00000491164 WDR62O43379 1518 aa43.27■■■■■ 4.52
PXK-212ENST00000491164 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.22■■■■■ 4.51
PXK-212ENST00000491164 PRDM2Q13029 1718 aa43.06■■■■■ 4.48
PXK-212ENST00000491164 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.87■■■■■ 4.45
PXK-212ENST00000491164 ABCC8Q09428 1581 aa42.68■■■■■ 4.42
PXK-212ENST00000491164 TOPBP1Q92547 1522 aa42.55■■■■■ 4.4
PXK-212ENST00000491164 IFT140Q96RY7 1462 aa42.49■■■■■ 4.39
PXK-212ENST00000491164 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.47■■■■■ 4.39
PXK-212ENST00000491164 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.4■■■■■ 4.38
PXK-212ENST00000491164 OSCARQ8IYS5 282 aa42.22■■■■■ 4.35
PXK-212ENST00000491164 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.21■■■■■ 4.35
PXK-212ENST00000491164 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.14■■■■■ 4.34
PXK-212ENST00000491164 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.12■■■■■ 4.33
PXK-212ENST00000491164 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.04■■■■■ 4.32
PXK-212ENST00000491164 SOGA1O94964 1423 aa42.01■■■■■ 4.32
PXK-212ENST00000491164 CUX1P39880 1505 aa41.97■■■■■ 4.31
PXK-212ENST00000491164 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.94■■■■■ 4.3
PXK-212ENST00000491164 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.94■■■■■ 4.3
PXK-212ENST00000491164 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.92■■■■■ 4.3
PXK-212ENST00000491164 WDR97A6NE52 1622 aa41.91■■■■■ 4.3
PXK-212ENST00000491164 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
PXK-212ENST00000491164 TRIM41Q8WV44 630 aa41.6■■■■■ 4.25
PXK-212ENST00000491164 CHD1O14646 1710 aa41.6■■■■■ 4.25
PXK-212ENST00000491164 GRIN2BQ13224 1484 aa41.6■■■■■ 4.25
PXK-212ENST00000491164 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.58■■■■■ 4.25
PXK-212ENST00000491164 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.57■■■■■ 4.25
PXK-212ENST00000491164 FBLN2P98095 1184 aa41.56■■■■■ 4.24
PXK-212ENST00000491164 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.55■■■■■ 4.24
PXK-212ENST00000491164 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.53■■■■■ 4.24
PXK-212ENST00000491164 TOP2BQ02880 1626 aa41.51■■■■■ 4.24
PXK-212ENST00000491164 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.51■■■■■ 4.23
PXK-212ENST00000491164 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.5■■■■■ 4.23
PXK-212ENST00000491164 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.45■■■■■ 4.23
PXK-212ENST00000491164 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.45■■■■■ 4.23
PXK-212ENST00000491164 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.45■■■■■ 4.23
PXK-212ENST00000491164 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.44■■■■■ 4.22
PXK-212ENST00000491164 ARHGEF11O15085 1522 aa41.41■■■■■ 4.22
PXK-212ENST00000491164 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.4■■■■■ 4.22
PXK-212ENST00000491164 SYNJ2O15056 1496 aa41.39■■■■■ 4.22
PXK-212ENST00000491164 SYNJ1O43426 1573 aa41.38■■■■■ 4.22
PXK-212ENST00000491164 PBRM1Q86U86 1689 aa41.37■■■■■ 4.21
PXK-212ENST00000491164 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.21■■■■■ 4.19
PXK-212ENST00000491164 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.09■■■■■ 4.17
PXK-212ENST00000491164 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.08■■■■■ 4.17
PXK-212ENST00000491164 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.04■■■■■ 4.16
PXK-212ENST00000491164 ADAMTS12P58397 1594 aa41.03■■■■■ 4.16
PXK-212ENST00000491164 GRIN2AQ12879 1464 aa41.02■■■■■ 4.16
PXK-212ENST00000491164 ARAP1Q96P48 1450 aa41.01■■■■■ 4.16
PXK-212ENST00000491164 NUP160Q12769 1436 aa40.9■■■■■ 4.14
PXK-212ENST00000491164 KIF27Q86VH2 1401 aa40.78■■■■■ 4.12
PXK-212ENST00000491164 CEP170Q5SW79 1584 aa40.78■■■■■ 4.12
PXK-212ENST00000491164 IGF1RP08069 1367 aa40.66■■■■■ 4.1
PXK-212ENST00000491164 SHROOM2Q13796 1616 aa40.64■■■■■ 4.1
PXK-212ENST00000491164 CUL7Q14999 1698 aa40.58■■■■■ 4.09
PXK-212ENST00000491164 JPH4Q96JJ6 628 aa40.51■■■■■ 4.08
PXK-212ENST00000491164 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.48■■■■■ 4.07
PXK-212ENST00000491164 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.44■■■■■ 4.06
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