RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490917.1

BAP1-210, Transcript of BRCA1 associated protein 1, human

TSL 5

Gene BAP1, Length 521 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BAP1-210	ENST00000490917	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		56.58	■■■■■ 6.65
BAP1-210	ENST00000490917	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		50.79	■■■■■ 5.72
BAP1-210	ENST00000490917	ABCC9	O60706	1549 aa		50.62	■■■■■ 5.69
BAP1-210	ENST00000490917	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		48.3	■■■■■ 5.32
BAP1-210	ENST00000490917	NACAD	O15069	1562 aa		48.01	■■■■■ 5.28
BAP1-210	ENST00000490917	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		47.67	■■■■■ 5.22
BAP1-210	ENST00000490917	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		47.45	■■■■■ 5.19
BAP1-210	ENST00000490917	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		47.43	■■■■■ 5.18
BAP1-210	ENST00000490917	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		47.17	■■■■■ 5.14
BAP1-210	ENST00000490917	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	47.14	■■■■■ 5.14
BAP1-210	ENST00000490917	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	46.89	■■■■■ 5.1
BAP1-210	ENST00000490917	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		46.85	■■■■■ 5.09
BAP1-210	ENST00000490917	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		46.82	■■■■■ 5.09
BAP1-210	ENST00000490917	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		46.34	■■■■■ 5.01
BAP1-210	ENST00000490917	SCRIB	Q14160	1630 aa		46.16	■■■■■ 4.98
BAP1-210	ENST00000490917	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		45.77	■■■■■ 4.92
BAP1-210	ENST00000490917	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	45.71	■■■■■ 4.91
BAP1-210	ENST00000490917	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		45.64	■■■■■ 4.9
BAP1-210	ENST00000490917	NCAPD3	P42695	1498 aa		44.33	■■■■■ 4.69
BAP1-210	ENST00000490917	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		44.15	■■■■■ 4.66
BAP1-210	ENST00000490917	SMARCA4	P51532	1647 aa		44.11	■■■■■ 4.65
BAP1-210	ENST00000490917	SMARCA2	P51531	1590 aa		44.06	■■■■■ 4.64
BAP1-210	ENST00000490917	HMGXB3	Q12766	1538 aa		43.99	■■■■■ 4.63
BAP1-210	ENST00000490917	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	43.94	■■■■■ 4.62
BAP1-210	ENST00000490917	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		43.75	■■■■■ 4.59
BAP1-210	ENST00000490917	ERCC6	Q03468	1493 aa		43.74	■■■■■ 4.59
BAP1-210	ENST00000490917	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	43.72	■■■■■ 4.59
BAP1-210	ENST00000490917	CUX2	O14529	1486 aa		43.7	■■■■■ 4.59
BAP1-210	ENST00000490917	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		43.62	■■■■■ 4.57
BAP1-210	ENST00000490917	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		43.55	■■■■■ 4.56
BAP1-210	ENST00000490917	NES	P48681	1621 aa		43.49	■■■■■ 4.55
BAP1-210	ENST00000490917	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		43.31	■■■■■ 4.52
BAP1-210	ENST00000490917	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	43.08	■■■■■ 4.49
BAP1-210	ENST00000490917	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		43.06	■■■■■ 4.48
BAP1-210	ENST00000490917	WIZ	O95785	1651 aa		43.03	■■■■■ 4.48
BAP1-210	ENST00000490917	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		42.97	■■■■■ 4.47
BAP1-210	ENST00000490917	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		42.96	■■■■■ 4.47
BAP1-210	ENST00000490917	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	42.71	■■■■■ 4.43
BAP1-210	ENST00000490917	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		42.64	■■■■■ 4.42
BAP1-210	ENST00000490917	WDR62	O43379	1518 aa		42.54	■■■■■ 4.4
BAP1-210	ENST00000490917	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	42.53	■■■■■ 4.4
BAP1-210	ENST00000490917	CFTR	P13569	1480 aa		42.49	■■■■■ 4.39
BAP1-210	ENST00000490917	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		42.49	■■■■■ 4.39
BAP1-210	ENST00000490917	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		42.44	■■■■■ 4.38
BAP1-210	ENST00000490917	PRDM2	Q13029	1718 aa		42.07	■■■■■ 4.33
BAP1-210	ENST00000490917	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	42.06	■■■■■ 4.32
BAP1-210	ENST00000490917	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		42.04	■■■■■ 4.32
BAP1-210	ENST00000490917	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		41.73	■■■■■ 4.27
BAP1-210	ENST00000490917	IFT140	Q96RY7	1462 aa		41.66	■■■■■ 4.26
BAP1-210	ENST00000490917	ABCC8	Q09428	1581 aa		41.65	■■■■■ 4.26
BAP1-210	ENST00000490917	TOPBP1	Q92547	1522 aa		41.64	■■■■■ 4.26
BAP1-210	ENST00000490917	TRIM41	Q8WV44	630 aa		41.62	■■■■■ 4.25
BAP1-210	ENST00000490917	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	41.51	■■■■■ 4.24
BAP1-210	ENST00000490917	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		41.5	■■■■■ 4.23
BAP1-210	ENST00000490917	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	41.3	■■■■■ 4.2
BAP1-210	ENST00000490917	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	41.28	■■■■■ 4.2
BAP1-210	ENST00000490917	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	41.21	■■■■■ 4.19
BAP1-210	ENST00000490917	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	41.16	■■■■■ 4.18	2e-10	■■■■□ 24.2
BAP1-210	ENST00000490917	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		41.11	■■■■■ 4.17
BAP1-210	ENST00000490917	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		41.11	■■■■■ 4.17
BAP1-210	ENST00000490917	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		41.11	■■■■■ 4.17
BAP1-210	ENST00000490917	SOGA1	O94964	1423 aa		41.05	■■■■■ 4.16
BAP1-210	ENST00000490917	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		41.02	■■■■■ 4.16
BAP1-210	ENST00000490917	ARHGEF11	O15085	1522 aa		40.99	■■■■■ 4.15
BAP1-210	ENST00000490917	CHD1	O14646	1710 aa		40.98	■■■■■ 4.15
BAP1-210	ENST00000490917	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		40.96	■■■■■ 4.15
BAP1-210	ENST00000490917	WDR97	A6NE52	1622 aa		40.94	■■■■■ 4.14
BAP1-210	ENST00000490917	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	40.92	■■■■■ 4.14
BAP1-210	ENST00000490917	CUX1	P39880	1505 aa		40.92	■■■■■ 4.14
BAP1-210	ENST00000490917	FBLN2	P98095	1184 aa		40.88	■■■■■ 4.13
BAP1-210	ENST00000490917	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	40.8	■■■■■ 4.12
BAP1-210	ENST00000490917	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		40.73	■■■■■ 4.11
BAP1-210	ENST00000490917	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	40.7	■■■■■ 4.11
BAP1-210	ENST00000490917	GRIN2B	Q13224	1484 aa		40.7	■■■■■ 4.11
BAP1-210	ENST00000490917	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		40.69	■■■■■ 4.1
BAP1-210	ENST00000490917	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	40.65	■■■■■ 4.1
BAP1-210	ENST00000490917	ARAP1	Q96P48	1450 aa		40.58	■■■■■ 4.09
BAP1-210	ENST00000490917	SYNJ2	O15056	1496 aa		40.56	■■■■■ 4.08
BAP1-210	ENST00000490917	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		40.55	■■■■■ 4.08
BAP1-210	ENST00000490917	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		40.55	■■■■■ 4.08
BAP1-210	ENST00000490917	SYNJ1	O43426	1573 aa		40.55	■■■■■ 4.08
BAP1-210	ENST00000490917	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		40.54	■■■■■ 4.08
BAP1-210	ENST00000490917	PBRM1	Q86U86	1689 aa		40.5	■■■■■ 4.07
BAP1-210	ENST00000490917	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		40.44	■■■■■ 4.06
BAP1-210	ENST00000490917	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	40.4	■■■■■ 4.06
BAP1-210	ENST00000490917	TOP2B	Q02880	1626 aa		40.32	■■■■■ 4.05
BAP1-210	ENST00000490917	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		40.32	■■■■■ 4.05
BAP1-210	ENST00000490917	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	40.21	■■■■■ 4.03
BAP1-210	ENST00000490917	GRIN2A	Q12879	1464 aa		40.15	■■■■■ 4.02
BAP1-210	ENST00000490917	ADAMTS12	P58397	1594 aa		40.11	■■■■■ 4.01
BAP1-210	ENST00000490917	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		40.06	■■■■■ 4
BAP1-210	ENST00000490917	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		40.05	■■■■■ 4
BAP1-210	ENST00000490917	NUP160	Q12769	1436 aa		40.04	■■■■■ 4
BAP1-210	ENST00000490917	CEP170	Q5SW79	1584 aa		39.97	■■■■□ 3.99
BAP1-210	ENST00000490917	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		39.85	■■■■□ 3.97
BAP1-210	ENST00000490917	SHROOM2	Q13796	1616 aa		39.85	■■■■□ 3.97
BAP1-210	ENST00000490917	JPH4	Q96JJ6	628 aa		39.65	■■■■□ 3.94
BAP1-210	ENST00000490917	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	39.63	■■■■□ 3.93
BAP1-210	ENST00000490917	KIF27	Q86VH2	1401 aa		39.55	■■■■□ 3.92
BAP1-210	ENST00000490917	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		39.55	■■■■□ 3.92

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