RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490709.1

GLIS3-216, Transcript of GLIS family zinc finger 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GLIS3, Length 768 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS3-216ENST00000490709 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.85■■■■■ 5.57
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GLIS3-216ENST00000490709 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.1■■■■■ 4.33
GLIS3-216ENST00000490709 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.95■■■■■ 4.31
GLIS3-216ENST00000490709 NACADO15069 1562 aa41.93■■■■■ 4.3
GLIS3-216ENST00000490709 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.49■■■■■ 4.23
GLIS3-216ENST00000490709 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.43■■■■■ 4.22
GLIS3-216ENST00000490709 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.21■■■■■ 4.19
GLIS3-216ENST00000490709 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.18■■■■■ 4.18
GLIS3-216ENST00000490709 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.04■■■■■ 4.16
GLIS3-216ENST00000490709 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.94■■■■■ 4.14
GLIS3-216ENST00000490709 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.82■■■■■ 4.12
GLIS3-216ENST00000490709 SCRIBQ14160 1630 aa40.64■■■■■ 4.1
GLIS3-216ENST00000490709 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.29■■■■■ 4.04
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GLIS3-216ENST00000490709 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.75■■■■□ 3.95
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GLIS3-216ENST00000490709 SMARCA4P51532 1647 aa38.8■■■■□ 3.8
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GLIS3-216ENST00000490709 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.66■■■■□ 3.78
GLIS3-216ENST00000490709 SMARCA2P51531 1590 aa38.6■■■■□ 3.77
GLIS3-216ENST00000490709 HMGXB3Q12766 1538 aa38.46■■■■□ 3.75
GLIS3-216ENST00000490709 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.44■■■■□ 3.74
GLIS3-216ENST00000490709 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.37■■■■□ 3.73
GLIS3-216ENST00000490709 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.35■■■■□ 3.73
GLIS3-216ENST00000490709 WIZO95785 1651 aa38.05■■■■□ 3.68
GLIS3-216ENST00000490709 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.05■■■■□ 3.68
GLIS3-216ENST00000490709 ERCC6Q03468 1493 aa37.95■■■■□ 3.67
GLIS3-216ENST00000490709 NESP48681 1621 aa37.94■■■■□ 3.66
GLIS3-216ENST00000490709 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.83■■■■□ 3.65
GLIS3-216ENST00000490709 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.76■■■■□ 3.63
GLIS3-216ENST00000490709 CUX2O14529 1486 aa37.63■■■■□ 3.61
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GLIS3-216ENST00000490709 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.55■■■■□ 3.6
GLIS3-216ENST00000490709 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.51■■■■□ 3.6
GLIS3-216ENST00000490709 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.51■■■■□ 3.59
GLIS3-216ENST00000490709 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.42■■■■□ 3.58
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GLIS3-216ENST00000490709 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.15■■■■□ 3.54
GLIS3-216ENST00000490709 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.13■■■■□ 3.54
GLIS3-216ENST00000490709 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.13■■■■□ 3.54
GLIS3-216ENST00000490709 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.13■■■■□ 3.54
GLIS3-216ENST00000490709 WDR62O43379 1518 aa37.03■■■■□ 3.52
GLIS3-216ENST00000490709 PRDM2Q13029 1718 aa37■■■■□ 3.51
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GLIS3-216ENST00000490709 TOPBP1Q92547 1522 aa36.5■■■■□ 3.43
GLIS3-216ENST00000490709 ABCC8Q09428 1581 aa36.45■■■■□ 3.43
GLIS3-216ENST00000490709 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.43■■■■□ 3.42
GLIS3-216ENST00000490709 IFT140Q96RY7 1462 aa36.36■■■■□ 3.41
GLIS3-216ENST00000490709 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
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GLIS3-216ENST00000490709 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.04■■■■□ 3.36
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GLIS3-216ENST00000490709 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.52■■■■□ 3.28
GLIS3-216ENST00000490709 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.52■■■■□ 3.28
GLIS3-216ENST00000490709 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.52■■■■□ 3.28
GLIS3-216ENST00000490709 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.52■■■■□ 3.28
GLIS3-216ENST00000490709 SYNJ2O15056 1496 aa35.45■■■■□ 3.27
GLIS3-216ENST00000490709 ARHGEF11O15085 1522 aa35.44■■■■□ 3.26
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GLIS3-216ENST00000490709 CEP170Q5SW79 1584 aa35.04■■■■□ 3.2
GLIS3-216ENST00000490709 NUP160Q12769 1436 aa35■■■■□ 3.19
GLIS3-216ENST00000490709 KIF27Q86VH2 1401 aa34.99■■■■□ 3.19
GLIS3-216ENST00000490709 IGF1RP08069 1367 aa34.87■■■■□ 3.17
GLIS3-216ENST00000490709 CUL7Q14999 1698 aa34.84■■■■□ 3.17
GLIS3-216ENST00000490709 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.82■■■■□ 3.16
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GLIS3-216ENST00000490709 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.73■■■■□ 3.15
GLIS3-216ENST00000490709 JPH4Q96JJ6 628 aa34.69■■■■□ 3.14
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