RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.37■■■□□ 2.29
NISCH-214ENST00000490425 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.12■■□□□ 1.77
NISCH-214ENST00000490425 ABCC9O60706 1549 aa25.78■■□□□ 1.72
NISCH-214ENST00000490425 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.69■■□□□ 1.54
NISCH-214ENST00000490425 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.67■■□□□ 1.54
NISCH-214ENST00000490425 NACADO15069 1562 aa24.6■■□□□ 1.53
NISCH-214ENST00000490425 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
NISCH-214ENST00000490425 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.37■■□□□ 1.49
NISCH-214ENST00000490425 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.25■■□□□ 1.47
NISCH-214ENST00000490425 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.13■■□□□ 1.45
NISCH-214ENST00000490425 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.1■■□□□ 1.45
NISCH-214ENST00000490425 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.96■■□□□ 1.43
NISCH-214ENST00000490425 SCRIBQ14160 1630 aa23.91■■□□□ 1.42
NISCH-214ENST00000490425 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.81■■□□□ 1.4
NISCH-214ENST00000490425 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.61■■□□□ 1.37
NISCH-214ENST00000490425 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
NISCH-214ENST00000490425 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.28■■□□□ 1.32
NISCH-214ENST00000490425 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.15■■□□□ 1.3
NISCH-214ENST00000490425 SMARCA4P51532 1647 aa22.82■■□□□ 1.24
NISCH-214ENST00000490425 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
NISCH-214ENST00000490425 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.73■■□□□ 1.23
NISCH-214ENST00000490425 NCAPD3P42695 1498 aa22.72■■□□□ 1.23
NISCH-214ENST00000490425 SMARCA2P51531 1590 aa22.67■■□□□ 1.22
NISCH-214ENST00000490425 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.66■■□□□ 1.22
NISCH-214ENST00000490425 HMGXB3Q12766 1538 aa22.57■■□□□ 1.2
NISCH-214ENST00000490425 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.55■■□□□ 1.2
NISCH-214ENST00000490425 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
NISCH-214ENST00000490425 WIZO95785 1651 aa22.42■■□□□ 1.18
NISCH-214ENST00000490425 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
NISCH-214ENST00000490425 NESP48681 1621 aa22.28■■□□□ 1.16
NISCH-214ENST00000490425 ERCC6Q03468 1493 aa22.21■■□□□ 1.15
NISCH-214ENST00000490425 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
NISCH-214ENST00000490425 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.12■■□□□ 1.13
NISCH-214ENST00000490425 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.07■■□□□ 1.12
NISCH-214ENST00000490425 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22■■□□□ 1.11
NISCH-214ENST00000490425 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.98■■□□□ 1.11
NISCH-214ENST00000490425 CUX2O14529 1486 aa21.96■■□□□ 1.11
NISCH-214ENST00000490425 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
NISCH-214ENST00000490425 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.91■■□□□ 1.1
NISCH-214ENST00000490425 CFTRP13569 1480 aa21.9■■□□□ 1.1
NISCH-214ENST00000490425 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.82■■□□□ 1.08
NISCH-214ENST00000490425 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.8■■□□□ 1.08
NISCH-214ENST00000490425 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.79■■□□□ 1.08
NISCH-214ENST00000490425 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
NISCH-214ENST00000490425 WDR62O43379 1518 aa21.71■■□□□ 1.07
NISCH-214ENST00000490425 PRDM2Q13029 1718 aa21.69■■□□□ 1.06
NISCH-214ENST00000490425 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
NISCH-214ENST00000490425 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.48■■□□□ 1.03
NISCH-214ENST00000490425 TOPBP1Q92547 1522 aa21.46■■□□□ 1.03
NISCH-214ENST00000490425 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.4■■□□□ 1.02
NISCH-214ENST00000490425 ABCC8Q09428 1581 aa21.4■■□□□ 1.02
NISCH-214ENST00000490425 IFT140Q96RY7 1462 aa21.33■■□□□ 1.01
NISCH-214ENST00000490425 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
NISCH-214ENST00000490425 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
NISCH-214ENST00000490425 CUX1P39880 1505 aa21.27■■□□□ 1
NISCH-214ENST00000490425 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
NISCH-214ENST00000490425 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.22■□□□□ 0.99
NISCH-214ENST00000490425 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.2■□□□□ 0.98
NISCH-214ENST00000490425 SOGA1O94964 1423 aa21.19■□□□□ 0.98
NISCH-214ENST00000490425 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
NISCH-214ENST00000490425 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.17■□□□□ 0.983e-6■■■■□ 23.2
NISCH-214ENST00000490425 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
NISCH-214ENST00000490425 OSCARQ8IYS5 282 aa21.07■□□□□ 0.96
NISCH-214ENST00000490425 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.06■□□□□ 0.96
NISCH-214ENST00000490425 SYNJ1O43426 1573 aa21.04■□□□□ 0.96
NISCH-214ENST00000490425 TOP2BQ02880 1626 aa21.02■□□□□ 0.96
NISCH-214ENST00000490425 WDR97A6NE52 1622 aa21■□□□□ 0.95
NISCH-214ENST00000490425 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21■□□□□ 0.95
NISCH-214ENST00000490425 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.97■□□□□ 0.95
NISCH-214ENST00000490425 FBLN2P98095 1184 aa20.96■□□□□ 0.95
NISCH-214ENST00000490425 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.95■□□□□ 0.94
NISCH-214ENST00000490425 GRIN2BQ13224 1484 aa20.94■□□□□ 0.94
NISCH-214ENST00000490425 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.94■□□□□ 0.94
NISCH-214ENST00000490425 CHD1O14646 1710 aa20.93■□□□□ 0.94
NISCH-214ENST00000490425 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.9■□□□□ 0.94
NISCH-214ENST00000490425 PBRM1Q86U86 1689 aa20.89■□□□□ 0.93
NISCH-214ENST00000490425 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
NISCH-214ENST00000490425 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
NISCH-214ENST00000490425 SYNJ2O15056 1496 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-214ENST00000490425 TRIM41Q8WV44 630 aa20.79■□□□□ 0.92
NISCH-214ENST00000490425 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.75■□□□□ 0.91
NISCH-214ENST00000490425 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.75■□□□□ 0.91
NISCH-214ENST00000490425 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.75■□□□□ 0.91
NISCH-214ENST00000490425 ARHGEF11O15085 1522 aa20.73■□□□□ 0.91
NISCH-214ENST00000490425 ADAMTS12P58397 1594 aa20.72■□□□□ 0.91
NISCH-214ENST00000490425 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-214ENST00000490425 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-214ENST00000490425 GRIN2AQ12879 1464 aa20.68■□□□□ 0.9
NISCH-214ENST00000490425 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.67■□□□□ 0.9
NISCH-214ENST00000490425 KIF27Q86VH2 1401 aa20.63■□□□□ 0.89
NISCH-214ENST00000490425 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.59■□□□□ 0.89
NISCH-214ENST00000490425 CEP170Q5SW79 1584 aa20.59■□□□□ 0.89
NISCH-214ENST00000490425 IGF1RP08069 1367 aa20.59■□□□□ 0.89
NISCH-214ENST00000490425 NUP160Q12769 1436 aa20.58■□□□□ 0.88
NISCH-214ENST00000490425 ARAP1Q96P48 1450 aa20.57■□□□□ 0.88
NISCH-214ENST00000490425 CUL7Q14999 1698 aa20.48■□□□□ 0.87
NISCH-214ENST00000490425 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.48■□□□□ 0.87
NISCH-214ENST00000490425 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.46■□□□□ 0.87
NISCH-214ENST00000490425 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.46■□□□□ 0.87
NISCH-214ENST00000490425 SHROOM2Q13796 1616 aa20.42■□□□□ 0.86
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