RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490320.2

C3orf80-202, Transcript of chromosome 3 open reading frame 80, humanhuman

TSL 3

Gene C3orf80, Length 1,110 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf80-202ENST00000490320 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.67■■■■■ 7.78
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C3orf80-202ENST00000490320 ABCC9O60706 1549 aa56.6■■■■■ 6.65
C3orf80-202ENST00000490320 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.12■■■■■ 6.26
C3orf80-202ENST00000490320 NACADO15069 1562 aa53.87■■■■■ 6.21
C3orf80-202ENST00000490320 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.46■■■■■ 6.15
C3orf80-202ENST00000490320 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.31■■■■■ 6.12
C3orf80-202ENST00000490320 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.85■■■■■ 6.05
C3orf80-202ENST00000490320 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.82■■■■■ 6.05
C3orf80-202ENST00000490320 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.79■■■■■ 6.04
C3orf80-202ENST00000490320 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.71■■■■■ 6.03
C3orf80-202ENST00000490320 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.71■■■■■ 6.03
C3orf80-202ENST00000490320 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.49■■■■■ 5.99
C3orf80-202ENST00000490320 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.98■■■■■ 5.91
C3orf80-202ENST00000490320 SCRIBQ14160 1630 aa51.87■■■■■ 5.89
C3orf80-202ENST00000490320 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.19■■■■■ 5.78
C3orf80-202ENST00000490320 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.19■■■■■ 5.78
C3orf80-202ENST00000490320 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.01■■■■■ 5.76
C3orf80-202ENST00000490320 NCAPD3P42695 1498 aa49.72■■■■■ 5.55
C3orf80-202ENST00000490320 SMARCA4P51532 1647 aa49.59■■■■■ 5.53
C3orf80-202ENST00000490320 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.57■■■■■ 5.53
C3orf80-202ENST00000490320 SMARCA2P51531 1590 aa49.49■■■■■ 5.51
C3orf80-202ENST00000490320 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.43■■■■■ 5.5
C3orf80-202ENST00000490320 HMGXB3Q12766 1538 aa49.38■■■■■ 5.5
C3orf80-202ENST00000490320 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.18■■■■■ 5.46
C3orf80-202ENST00000490320 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.1■■■■■ 5.45
C3orf80-202ENST00000490320 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.02■■■■■ 5.44
C3orf80-202ENST00000490320 ERCC6Q03468 1493 aa48.89■■■■■ 5.42
C3orf80-202ENST00000490320 CUX2O14529 1486 aa48.78■■■■■ 5.4
C3orf80-202ENST00000490320 NESP48681 1621 aa48.7■■■■■ 5.39
C3orf80-202ENST00000490320 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.54■■■■■ 5.36
C3orf80-202ENST00000490320 WIZO95785 1651 aa48.42■■■■■ 5.34
C3orf80-202ENST00000490320 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.34■■■■■ 5.33
C3orf80-202ENST00000490320 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.24■■■■■ 5.31
C3orf80-202ENST00000490320 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.22■■■■■ 5.31
C3orf80-202ENST00000490320 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.2■■■■■ 5.31
C3orf80-202ENST00000490320 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.15■■■■■ 5.3
C3orf80-202ENST00000490320 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.11■■■■■ 5.29
C3orf80-202ENST00000490320 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.91■■■■■ 5.26
C3orf80-202ENST00000490320 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.78■■■■■ 5.24
C3orf80-202ENST00000490320 CFTRP13569 1480 aa47.72■■■■■ 5.23
C3orf80-202ENST00000490320 WDR62O43379 1518 aa47.67■■■■■ 5.22
C3orf80-202ENST00000490320 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.65■■■■■ 5.22
C3orf80-202ENST00000490320 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.62■■■■■ 5.21
C3orf80-202ENST00000490320 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.33■■■■■ 5.17
C3orf80-202ENST00000490320 PRDM2Q13029 1718 aa47.25■■■■■ 5.15
C3orf80-202ENST00000490320 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.19■■■■■ 5.14
C3orf80-202ENST00000490320 ABCC8Q09428 1581 aa46.77■■■■■ 5.08
C3orf80-202ENST00000490320 TOPBP1Q92547 1522 aa46.75■■■■■ 5.07
C3orf80-202ENST00000490320 IFT140Q96RY7 1462 aa46.71■■■■■ 5.07
C3orf80-202ENST00000490320 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.63■■■■■ 5.06
C3orf80-202ENST00000490320 OSCARQ8IYS5 282 aa46.56■■■■■ 5.04
C3orf80-202ENST00000490320 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.52■■■■■ 5.04
C3orf80-202ENST00000490320 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.32■■■■■ 5
C3orf80-202ENST00000490320 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.31■■■■■ 5
C3orf80-202ENST00000490320 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.3■■■■■ 5
C3orf80-202ENST00000490320 TRIM41Q8WV44 630 aa46.23■■■■■ 4.99
C3orf80-202ENST00000490320 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.14■■■■■ 4.98
C3orf80-202ENST00000490320 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.14■■■■■ 4.98
C3orf80-202ENST00000490320 SOGA1O94964 1423 aa46.09■■■■■ 4.97
C3orf80-202ENST00000490320 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.07■■■■■ 4.97
C3orf80-202ENST00000490320 CUX1P39880 1505 aa46.04■■■■■ 4.96
C3orf80-202ENST00000490320 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.04■■■■■ 4.96
C3orf80-202ENST00000490320 WDR97A6NE52 1622 aa45.98■■■■■ 4.95
C3orf80-202ENST00000490320 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.92■■■■■ 4.94
C3orf80-202ENST00000490320 CHD1O14646 1710 aa45.88■■■■■ 4.93
C3orf80-202ENST00000490320 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.87■■■■■ 4.93
C3orf80-202ENST00000490320 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.87■■■■■ 4.93
C3orf80-202ENST00000490320 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.87■■■■■ 4.93
C3orf80-202ENST00000490320 ARHGEF11O15085 1522 aa45.79■■■■■ 4.92
C3orf80-202ENST00000490320 FBLN2P98095 1184 aa45.74■■■■■ 4.91
C3orf80-202ENST00000490320 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.71■■■■■ 4.91
C3orf80-202ENST00000490320 GRIN2BQ13224 1484 aa45.68■■■■■ 4.9
C3orf80-202ENST00000490320 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.68■■■■■ 4.9
C3orf80-202ENST00000490320 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.59■■■■■ 4.89
C3orf80-202ENST00000490320 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.55■■■■■ 4.88
C3orf80-202ENST00000490320 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.53■■■■■ 4.88
C3orf80-202ENST00000490320 SYNJ2O15056 1496 aa45.5■■■■■ 4.87
C3orf80-202ENST00000490320 PBRM1Q86U86 1689 aa45.47■■■■■ 4.87
C3orf80-202ENST00000490320 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.47■■■■■ 4.87
C3orf80-202ENST00000490320 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.46■■■■■ 4.87
C3orf80-202ENST00000490320 SYNJ1O43426 1573 aa45.44■■■■■ 4.86
C3orf80-202ENST00000490320 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.43■■■■■ 4.86
C3orf80-202ENST00000490320 TOP2BQ02880 1626 aa45.43■■■■■ 4.86
C3orf80-202ENST00000490320 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.43■■■■■ 4.86
C3orf80-202ENST00000490320 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.38■■■■■ 4.86
C3orf80-202ENST00000490320 ARAP1Q96P48 1450 aa45.35■■■■■ 4.85
C3orf80-202ENST00000490320 ADAMTS12P58397 1594 aa45.09■■■■■ 4.81
C3orf80-202ENST00000490320 GRIN2AQ12879 1464 aa45.08■■■■■ 4.81
C3orf80-202ENST00000490320 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.03■■■■■ 4.8
C3orf80-202ENST00000490320 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.01■■■■■ 4.8
C3orf80-202ENST00000490320 NUP160Q12769 1436 aa44.94■■■■■ 4.79
C3orf80-202ENST00000490320 CEP170Q5SW79 1584 aa44.87■■■■■ 4.77
C3orf80-202ENST00000490320 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.76■■■■■ 4.76
C3orf80-202ENST00000490320 SHROOM2Q13796 1616 aa44.7■■■■■ 4.75
C3orf80-202ENST00000490320 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.65■■■■■ 4.74
C3orf80-202ENST00000490320 KIF27Q86VH2 1401 aa44.57■■■■■ 4.72
C3orf80-202ENST00000490320 IGF1RP08069 1367 aa44.49■■■■■ 4.71
C3orf80-202ENST00000490320 JPH4Q96JJ6 628 aa44.45■■■■■ 4.71
C3orf80-202ENST00000490320 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.45■■■■■ 4.71
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