RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490108.1

TSC2-215, Transcript of TSC complex subunit 2, humanhuman

TSL 4

Gene TSC2, Length 482 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2-215ENST00000490108 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.85■■■■■ 5.57
TSC2-215ENST00000490108 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.68■■■■■ 4.74
TSC2-215ENST00000490108 ABCC9O60706 1549 aa44.5■■■■■ 4.71
TSC2-215ENST00000490108 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.43■■■■■ 4.38
TSC2-215ENST00000490108 NACADO15069 1562 aa42.16■■■■■ 4.34
TSC2-215ENST00000490108 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.01■■■■■ 4.32
TSC2-215ENST00000490108 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.59■■■■■ 4.25
TSC2-215ENST00000490108 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.48■■■■■ 4.23
TSC2-215ENST00000490108 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.48■■■■■ 4.23
TSC2-215ENST00000490108 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.44■■■■■ 4.22
TSC2-215ENST00000490108 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.21
TSC2-215ENST00000490108 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.16■■■■■ 4.18
TSC2-215ENST00000490108 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.16■■■■■ 4.18
TSC2-215ENST00000490108 SCRIBQ14160 1630 aa40.78■■■■■ 4.12
TSC2-215ENST00000490108 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.62■■■■■ 4.09
TSC2-215ENST00000490108 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.2■■■■■ 4.03
TSC2-215ENST00000490108 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.16■■■■■ 4.02
TSC2-215ENST00000490108 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.06■■■■■ 4
TSC2-215ENST00000490108 NCAPD3P42695 1498 aa38.88■■■■□ 3.81
TSC2-215ENST00000490108 SMARCA4P51532 1647 aa38.88■■■■□ 3.81
TSC2-215ENST00000490108 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.83■■■■□ 3.81
TSC2-215ENST00000490108 SMARCA2P51531 1590 aa38.75■■■■□ 3.79
TSC2-215ENST00000490108 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.7■■■■□ 3.79
TSC2-215ENST00000490108 HMGXB3Q12766 1538 aa38.67■■■■□ 3.78
TSC2-215ENST00000490108 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.51■■■■□ 3.76
TSC2-215ENST00000490108 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.45■■■■□ 3.75
TSC2-215ENST00000490108 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.44■■■■□ 3.74
TSC2-215ENST00000490108 ERCC6Q03468 1493 aa38.43■■■■□ 3.74
TSC2-215ENST00000490108 NESP48681 1621 aa38.28■■■■□ 3.72
TSC2-215ENST00000490108 CUX2O14529 1486 aa38.24■■■■□ 3.71
TSC2-215ENST00000490108 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.02■■■■□ 3.68
TSC2-215ENST00000490108 WIZO95785 1651 aa38■■■■□ 3.67
TSC2-215ENST00000490108 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.92■■■■□ 3.66
TSC2-215ENST00000490108 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.87■■■■□ 3.65
TSC2-215ENST00000490108 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.82■■■■□ 3.65
TSC2-215ENST00000490108 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.78■■■■□ 3.64
TSC2-215ENST00000490108 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.73■■■■□ 3.63
TSC2-215ENST00000490108 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.69■■■■□ 3.62
TSC2-215ENST00000490108 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.54■■■■□ 3.6
TSC2-215ENST00000490108 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.49■■■■□ 3.59
TSC2-215ENST00000490108 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.39■■■■□ 3.58
TSC2-215ENST00000490108 WDR62O43379 1518 aa37.38■■■■□ 3.57
TSC2-215ENST00000490108 CFTRP13569 1480 aa37.35■■■■□ 3.57
TSC2-215ENST00000490108 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.35■■■■□ 3.57
TSC2-215ENST00000490108 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.07■■■■□ 3.53
TSC2-215ENST00000490108 PRDM2Q13029 1718 aa37.06■■■■□ 3.52
TSC2-215ENST00000490108 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.03■■■■□ 3.52
TSC2-215ENST00000490108 TOPBP1Q92547 1522 aa36.66■■■■□ 3.46
TSC2-215ENST00000490108 IFT140Q96RY7 1462 aa36.61■■■■□ 3.45
TSC2-215ENST00000490108 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.56■■■■□ 3.44
TSC2-215ENST00000490108 ABCC8Q09428 1581 aa36.55■■■■□ 3.44
TSC2-215ENST00000490108 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
TSC2-215ENST00000490108 OSCARQ8IYS5 282 aa36.48■■■■□ 3.43
TSC2-215ENST00000490108 TRIM41Q8WV44 630 aa36.46■■■■□ 3.43
TSC2-215ENST00000490108 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
TSC2-215ENST00000490108 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
TSC2-215ENST00000490108 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.3■■■■□ 3.4
TSC2-215ENST00000490108 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
TSC2-215ENST00000490108 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.22■■■■□ 3.393e-7■■■■□ 23
TSC2-215ENST00000490108 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.17■■■■□ 3.38
TSC2-215ENST00000490108 CUX1P39880 1505 aa36.12■■■■□ 3.37
TSC2-215ENST00000490108 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.11■■■■□ 3.37
TSC2-215ENST00000490108 SOGA1O94964 1423 aa36.11■■■■□ 3.37
TSC2-215ENST00000490108 CHD1O14646 1710 aa36.08■■■■□ 3.37
TSC2-215ENST00000490108 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.07■■■■□ 3.36
TSC2-215ENST00000490108 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.07■■■■□ 3.36
TSC2-215ENST00000490108 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.07■■■■□ 3.36
TSC2-215ENST00000490108 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
TSC2-215ENST00000490108 FBLN2P98095 1184 aa35.97■■■■□ 3.35
TSC2-215ENST00000490108 ARHGEF11O15085 1522 aa35.96■■■■□ 3.35
TSC2-215ENST00000490108 WDR97A6NE52 1622 aa35.95■■■■□ 3.35
TSC2-215ENST00000490108 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.9■■■■□ 3.34
TSC2-215ENST00000490108 GRIN2BQ13224 1484 aa35.8■■■■□ 3.32
TSC2-215ENST00000490108 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
TSC2-215ENST00000490108 PBRM1Q86U86 1689 aa35.72■■■■□ 3.31
TSC2-215ENST00000490108 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.71■■■■□ 3.31
TSC2-215ENST00000490108 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.7■■■■□ 3.31
TSC2-215ENST00000490108 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.69■■■■□ 3.3
TSC2-215ENST00000490108 SYNJ2O15056 1496 aa35.66■■■■□ 3.3
TSC2-215ENST00000490108 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.65■■■■□ 3.3
TSC2-215ENST00000490108 SYNJ1O43426 1573 aa35.65■■■■□ 3.3
TSC2-215ENST00000490108 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.65■■■■□ 3.3
TSC2-215ENST00000490108 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.63■■■■□ 3.29
TSC2-215ENST00000490108 ARAP1Q96P48 1450 aa35.63■■■■□ 3.29
TSC2-215ENST00000490108 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.59■■■■□ 3.29
TSC2-215ENST00000490108 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.58■■■■□ 3.29
TSC2-215ENST00000490108 TOP2BQ02880 1626 aa35.57■■■■□ 3.29
TSC2-215ENST00000490108 ADAMTS12P58397 1594 aa35.39■■■■□ 3.26
TSC2-215ENST00000490108 GRIN2AQ12879 1464 aa35.35■■■■□ 3.25
TSC2-215ENST00000490108 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.25■■■■□ 3.23
TSC2-215ENST00000490108 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.25■■■■□ 3.23
TSC2-215ENST00000490108 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
TSC2-215ENST00000490108 CEP170Q5SW79 1584 aa35.22■■■■□ 3.23
TSC2-215ENST00000490108 NUP160Q12769 1436 aa35.2■■■■□ 3.23
TSC2-215ENST00000490108 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.11■■■■□ 3.21
TSC2-215ENST00000490108 SHROOM2Q13796 1616 aa35.03■■■■□ 3.2
TSC2-215ENST00000490108 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.89■■■■□ 3.18
TSC2-215ENST00000490108 KIF27Q86VH2 1401 aa34.89■■■■□ 3.18
TSC2-215ENST00000490108 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.86■■■■□ 3.17
TSC2-215ENST00000490108 CUL7Q14999 1698 aa34.81■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms