RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489783.1

SHOC2-206, Transcript of SHOC2, leucine rich repeat scaffold protein, humanhuman

TSL 2

Gene SHOC2, Length 749 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2-206ENST00000489783 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.2■■■■■ 6.75
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SHOC2-206ENST00000489783 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.43■■■■■ 5.18
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SHOC2-206ENST00000489783 NCAPD3P42695 1498 aa45.36■■■■■ 4.85
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SHOC2-206ENST00000489783 SMARCA4P51532 1647 aa44.75■■■■■ 4.75
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SHOC2-206ENST00000489783 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.23■■■■■ 4.67
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SHOC2-206ENST00000489783 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.95■■■■■ 4.63
SHOC2-206ENST00000489783 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.88■■■■■ 4.61
SHOC2-206ENST00000489783 WDR62O43379 1518 aa43.78■■■■■ 4.6
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SHOC2-206ENST00000489783 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.51■■■■■ 4.56
SHOC2-206ENST00000489783 WIZO95785 1651 aa43.49■■■■■ 4.55
SHOC2-206ENST00000489783 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.43■■■■■ 4.54
SHOC2-206ENST00000489783 CFTRP13569 1480 aa43.24■■■■■ 4.51
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SHOC2-206ENST00000489783 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.8■■■■■ 4.44
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SHOC2-206ENST00000489783 IFT140Q96RY7 1462 aa42.69■■■■■ 4.42
SHOC2-206ENST00000489783 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.61■■■■■ 4.41
SHOC2-206ENST00000489783 PRDM2Q13029 1718 aa42.54■■■■■ 4.4
SHOC2-206ENST00000489783 TOPBP1Q92547 1522 aa42.51■■■■■ 4.39
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SHOC2-206ENST00000489783 FBLN2P98095 1184 aa42.23■■■■■ 4.35
SHOC2-206ENST00000489783 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.22■■■■■ 4.35
SHOC2-206ENST00000489783 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.17■■■■■ 4.34
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SHOC2-206ENST00000489783 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.78■■■■■ 4.28
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SHOC2-206ENST00000489783 SYNJ1O43426 1573 aa41.62■■■■■ 4.25
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SHOC2-206ENST00000489783 CEP170Q5SW79 1584 aa40.94■■■■■ 4.14
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SHOC2-206ENST00000489783 JPH4Q96JJ6 628 aa40.58■■■■■ 4.09
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SHOC2-206ENST00000489783 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.52■■■■■ 4.08
SHOC2-206ENST00000489783 TOP2BQ02880 1626 aa40.49■■■■■ 4.07
SHOC2-206ENST00000489783 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.47■■■■■ 4.07
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