RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489782.1

MMP23B-207, Transcript of matrix metallopeptidase 23B, humanhuman

TSL 2

Gene MMP23B, Length 626 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP23B-207ENST00000489782 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.09■■■■■ 7.37
MMP23B-207ENST00000489782 ABCC9O60706 1549 aa55.31■■■■■ 6.45
MMP23B-207ENST00000489782 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.02■■■■■ 6.4
MMP23B-207ENST00000489782 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.51■■■■■ 6
MMP23B-207ENST00000489782 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.17■■■■■ 5.94
MMP23B-207ENST00000489782 NACADO15069 1562 aa52.06■■■■■ 5.92
MMP23B-207ENST00000489782 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.67■■■■■ 5.86
MMP23B-207ENST00000489782 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.42■■■■■ 5.82
MMP23B-207ENST00000489782 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.41■■■■■ 5.82
MMP23B-207ENST00000489782 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.22■■■■■ 5.79
MMP23B-207ENST00000489782 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.02■■■■■ 5.76
MMP23B-207ENST00000489782 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.57■■■■■ 5.69
MMP23B-207ENST00000489782 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.44■■■■■ 5.67
MMP23B-207ENST00000489782 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.26■■■■■ 5.64
MMP23B-207ENST00000489782 SCRIBQ14160 1630 aa50.11■■■■■ 5.61
MMP23B-207ENST00000489782 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.98■■■■■ 5.59
MMP23B-207ENST00000489782 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.86■■■■■ 5.57
MMP23B-207ENST00000489782 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.78■■■■■ 5.56
MMP23B-207ENST00000489782 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.14■■■■■ 5.3
MMP23B-207ENST00000489782 NCAPD3P42695 1498 aa48.04■■■■■ 5.28
MMP23B-207ENST00000489782 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.86■■■■■ 5.25
MMP23B-207ENST00000489782 CUX2O14529 1486 aa47.82■■■■■ 5.25
MMP23B-207ENST00000489782 ERCC6Q03468 1493 aa47.78■■■■■ 5.24
MMP23B-207ENST00000489782 SMARCA4P51532 1647 aa47.77■■■■■ 5.24
MMP23B-207ENST00000489782 SMARCA2P51531 1590 aa47.72■■■■■ 5.23
MMP23B-207ENST00000489782 HMGXB3Q12766 1538 aa47.69■■■■■ 5.22
MMP23B-207ENST00000489782 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.45■■■■■ 5.19
MMP23B-207ENST00000489782 NESP48681 1621 aa47.43■■■■■ 5.18
MMP23B-207ENST00000489782 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.39■■■■■ 5.18
MMP23B-207ENST00000489782 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.28■■■■■ 5.16
MMP23B-207ENST00000489782 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.08■■■■■ 5.13
MMP23B-207ENST00000489782 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.05■■■■■ 5.12
MMP23B-207ENST00000489782 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.05■■■■■ 5.12
MMP23B-207ENST00000489782 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.86■■■■■ 5.09
MMP23B-207ENST00000489782 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.75■■■■■ 5.07
MMP23B-207ENST00000489782 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.56■■■■■ 5.04
MMP23B-207ENST00000489782 WIZO95785 1651 aa46.53■■■■■ 5.04
MMP23B-207ENST00000489782 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.4■■■■■ 5.02
MMP23B-207ENST00000489782 WDR62O43379 1518 aa46.31■■■■■ 5
MMP23B-207ENST00000489782 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.14■■■■■ 4.98
MMP23B-207ENST00000489782 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.06■■■■■ 4.96
MMP23B-207ENST00000489782 CFTRP13569 1480 aa45.98■■■■■ 4.95
MMP23B-207ENST00000489782 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.96■■■■■ 4.95
MMP23B-207ENST00000489782 TRIM41Q8WV44 630 aa45.91■■■■■ 4.94
MMP23B-207ENST00000489782 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.89■■■■■ 4.94
MMP23B-207ENST00000489782 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.72■■■■■ 4.91
MMP23B-207ENST00000489782 PRDM2Q13029 1718 aa45.58■■■■■ 4.89
MMP23B-207ENST00000489782 OSCARQ8IYS5 282 aa45.54■■■■■ 4.88
MMP23B-207ENST00000489782 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.36■■■■■ 4.85
MMP23B-207ENST00000489782 IFT140Q96RY7 1462 aa45.23■■■■■ 4.83
MMP23B-207ENST00000489782 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.2■■■■■ 4.83
MMP23B-207ENST00000489782 TOPBP1Q92547 1522 aa45.16■■■■■ 4.82
MMP23B-207ENST00000489782 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.06■■■■■ 4.8
MMP23B-207ENST00000489782 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.06■■■■■ 4.8
MMP23B-207ENST00000489782 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.06■■■■■ 4.8
MMP23B-207ENST00000489782 ABCC8Q09428 1581 aa45.01■■■■■ 4.8
MMP23B-207ENST00000489782 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.98■■■■■ 4.79
MMP23B-207ENST00000489782 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.97■■■■■ 4.79
MMP23B-207ENST00000489782 ARHGEF11O15085 1522 aa44.85■■■■■ 4.77
MMP23B-207ENST00000489782 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.8■■■■■ 4.76
MMP23B-207ENST00000489782 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.73■■■■■ 4.75
MMP23B-207ENST00000489782 CHD1O14646 1710 aa44.72■■■■■ 4.75
MMP23B-207ENST00000489782 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.67■■■■■ 4.74
MMP23B-207ENST00000489782 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.52■■■■■ 4.72
MMP23B-207ENST00000489782 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.5■■■■■ 4.71
MMP23B-207ENST00000489782 FBLN2P98095 1184 aa44.49■■■■■ 4.71
MMP23B-207ENST00000489782 SOGA1O94964 1423 aa44.43■■■■■ 4.7
MMP23B-207ENST00000489782 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.4■■■■■ 4.7
MMP23B-207ENST00000489782 ARAP1Q96P48 1450 aa44.4■■■■■ 4.7
MMP23B-207ENST00000489782 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.34■■■■■ 4.69
MMP23B-207ENST00000489782 WDR97A6NE52 1622 aa44.32■■■■■ 4.68
MMP23B-207ENST00000489782 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.29■■■■■ 4.68
MMP23B-207ENST00000489782 CUX1P39880 1505 aa44.26■■■■■ 4.68
MMP23B-207ENST00000489782 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.16■■■■■ 4.66
MMP23B-207ENST00000489782 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.15■■■■■ 4.66
MMP23B-207ENST00000489782 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.13■■■■■ 4.66
MMP23B-207ENST00000489782 SYNJ1O43426 1573 aa44.1■■■■■ 4.65
MMP23B-207ENST00000489782 GRIN2BQ13224 1484 aa44.1■■■■■ 4.65
MMP23B-207ENST00000489782 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.1■■■■■ 4.65
MMP23B-207ENST00000489782 SYNJ2O15056 1496 aa44.01■■■■■ 4.64
MMP23B-207ENST00000489782 PBRM1Q86U86 1689 aa43.98■■■■■ 4.63
MMP23B-207ENST00000489782 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.91■■■■■ 4.62
MMP23B-207ENST00000489782 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.82■■■■■ 4.61
MMP23B-207ENST00000489782 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.81■■■■■ 4.6
MMP23B-207ENST00000489782 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.65■■■■■ 4.58
MMP23B-207ENST00000489782 GRIN2AQ12879 1464 aa43.55■■■■■ 4.56
MMP23B-207ENST00000489782 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.55■■■■■ 4.56
MMP23B-207ENST00000489782 ADAMTS12P58397 1594 aa43.51■■■■■ 4.56
MMP23B-207ENST00000489782 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.49■■■■■ 4.55
MMP23B-207ENST00000489782 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.46■■■■■ 4.55
MMP23B-207ENST00000489782 TOP2BQ02880 1626 aa43.46■■■■■ 4.55
MMP23B-207ENST00000489782 CEP170Q5SW79 1584 aa43.44■■■■■ 4.54
MMP23B-207ENST00000489782 NUP160Q12769 1436 aa43.41■■■■■ 4.54
MMP23B-207ENST00000489782 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.33■■■■■ 4.53
MMP23B-207ENST00000489782 SHROOM2Q13796 1616 aa43.3■■■■■ 4.52
MMP23B-207ENST00000489782 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.26■■■■■ 4.52
MMP23B-207ENST00000489782 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP43.08■■■■■ 4.49
MMP23B-207ENST00000489782 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.01■■■■■ 4.48
MMP23B-207ENST00000489782 JPH4Q96JJ6 628 aa42.93■■■■■ 4.46
MMP23B-207ENST00000489782 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.92■■■■■ 4.46
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