RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489695.1

HOXA9-205, Transcript of homeobox A9, humanhuman

TSL 3

Gene HOXA9, Length 521 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9-205ENST00000489695 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.58■■■■■ 6.65
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HOXA9-205ENST00000489695 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.68■■■■■ 5.38
HOXA9-205ENST00000489695 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.6■■■■■ 5.37
HOXA9-205ENST00000489695 NACADO15069 1562 aa48.27■■■■■ 5.32
HOXA9-205ENST00000489695 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.86■■■■■ 5.25
HOXA9-205ENST00000489695 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.73■■■■■ 5.23
HOXA9-205ENST00000489695 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.53■■■■■ 5.2
HOXA9-205ENST00000489695 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.5■■■■■ 5.2
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HOXA9-205ENST00000489695 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.66■■■■■ 5.06
HOXA9-205ENST00000489695 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.35■■■■■ 5.01
HOXA9-205ENST00000489695 SCRIBQ14160 1630 aa46.32■■■■■ 5.01
HOXA9-205ENST00000489695 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.3■■■■■ 5
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HOXA9-205ENST00000489695 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.95■■■■■ 4.79
HOXA9-205ENST00000489695 NCAPD3P42695 1498 aa44.61■■■■■ 4.73
HOXA9-205ENST00000489695 CUX2O14529 1486 aa44.46■■■■■ 4.71
HOXA9-205ENST00000489695 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.39■■■■■ 4.7
HOXA9-205ENST00000489695 ERCC6Q03468 1493 aa44.33■■■■■ 4.69
HOXA9-205ENST00000489695 SMARCA2P51531 1590 aa44.22■■■■■ 4.67
HOXA9-205ENST00000489695 HMGXB3Q12766 1538 aa44.19■■■■■ 4.67
HOXA9-205ENST00000489695 SMARCA4P51532 1647 aa44.19■■■■■ 4.66
HOXA9-205ENST00000489695 NESP48681 1621 aa43.98■■■■■ 4.63
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HOXA9-205ENST00000489695 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.62■■■■■ 4.57
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HOXA9-205ENST00000489695 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.4■■■■■ 4.54
HOXA9-205ENST00000489695 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.33■■■■■ 4.53
HOXA9-205ENST00000489695 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.22■■■■■ 4.51
HOXA9-205ENST00000489695 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.03■■■■■ 4.48
HOXA9-205ENST00000489695 WIZO95785 1651 aa42.98■■■■■ 4.47
HOXA9-205ENST00000489695 WDR62O43379 1518 aa42.95■■■■■ 4.47
HOXA9-205ENST00000489695 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.76■■■■■ 4.44
HOXA9-205ENST00000489695 TRIM41Q8WV44 630 aa42.7■■■■■ 4.43
HOXA9-205ENST00000489695 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.69■■■■■ 4.42
HOXA9-205ENST00000489695 CFTRP13569 1480 aa42.64■■■■■ 4.42
HOXA9-205ENST00000489695 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.54■■■■■ 4.4
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HOXA9-205ENST00000489695 PRDM2Q13029 1718 aa42.05■■■■■ 4.32
HOXA9-205ENST00000489695 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.99■■■■■ 4.31
HOXA9-205ENST00000489695 IFT140Q96RY7 1462 aa41.95■■■■■ 4.31
HOXA9-205ENST00000489695 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.92■■■■■ 4.3
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HOXA9-205ENST00000489695 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.8■■■■■ 4.28
HOXA9-205ENST00000489695 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.8■■■■■ 4.28
HOXA9-205ENST00000489695 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.8■■■■■ 4.28
HOXA9-205ENST00000489695 ABCC8Q09428 1581 aa41.74■■■■■ 4.27
HOXA9-205ENST00000489695 ARHGEF11O15085 1522 aa41.64■■■■■ 4.26
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HOXA9-205ENST00000489695 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.38■■■■■ 4.21
HOXA9-205ENST00000489695 CHD1O14646 1710 aa41.35■■■■■ 4.21
HOXA9-205ENST00000489695 FBLN2P98095 1184 aa41.25■■■■■ 4.19
HOXA9-205ENST00000489695 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.22■■■■■ 4.19
HOXA9-205ENST00000489695 ARAP1Q96P48 1450 aa41.21■■■■■ 4.19
HOXA9-205ENST00000489695 SOGA1O94964 1423 aa41.2■■■■■ 4.19
HOXA9-205ENST00000489695 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.16■■■■■ 4.18
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HOXA9-205ENST00000489695 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.05■■■■■ 4.16
HOXA9-205ENST00000489695 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.02■■■■■ 4.16
HOXA9-205ENST00000489695 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.01■■■■■ 4.16
HOXA9-205ENST00000489695 CUX1P39880 1505 aa40.96■■■■■ 4.15
HOXA9-205ENST00000489695 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.96■■■■■ 4.15
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HOXA9-205ENST00000489695 GRIN2BQ13224 1484 aa40.89■■■■■ 4.14
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HOXA9-205ENST00000489695 SYNJ2O15056 1496 aa40.81■■■■■ 4.12
HOXA9-205ENST00000489695 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.68■■■■■ 4.1
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HOXA9-205ENST00000489695 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.59■■■■■ 4.09
HOXA9-205ENST00000489695 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.54■■■■■ 4.08
HOXA9-205ENST00000489695 GRIN2AQ12879 1464 aa40.35■■■■■ 4.05
HOXA9-205ENST00000489695 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.34■■■■■ 4.05
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HOXA9-205ENST00000489695 TOP2BQ02880 1626 aa40.18■■■■■ 4.02
HOXA9-205ENST00000489695 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.16■■■■■ 4.02
HOXA9-205ENST00000489695 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.16■■■■■ 4.02
HOXA9-205ENST00000489695 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.12■■■■■ 4.01
HOXA9-205ENST00000489695 SHROOM2Q13796 1616 aa40.1■■■■■ 4.01
HOXA9-205ENST00000489695 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.07■■■■■ 4.01
HOXA9-205ENST00000489695 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.88■■■■□ 3.97
HOXA9-205ENST00000489695 JPH4Q96JJ6 628 aa39.85■■■■□ 3.97
HOXA9-205ENST00000489695 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.73■■■■□ 3.95
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