RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489379.1

EHD1-211, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene EHD1, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-211ENST00000489379 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.45■■■■■ 7.11
EHD1-211ENST00000489379 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.03■■■■■ 6.08
EHD1-211ENST00000489379 ABCC9O60706 1549 aa51.92■■■■■ 5.9
EHD1-211ENST00000489379 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50■■■■■ 5.59
EHD1-211ENST00000489379 NACADO15069 1562 aa49.91■■■■■ 5.58
EHD1-211ENST00000489379 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.67■■■■■ 5.54
EHD1-211ENST00000489379 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.59■■■■■ 5.53
EHD1-211ENST00000489379 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.47■■■■■ 5.51
EHD1-211ENST00000489379 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.27■■■■■ 5.48
EHD1-211ENST00000489379 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.82■■■■■ 5.41
EHD1-211ENST00000489379 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.44■■■■■ 5.34
EHD1-211ENST00000489379 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.39■■■■■ 5.34
EHD1-211ENST00000489379 SCRIBQ14160 1630 aa48.21■■■■■ 5.31
EHD1-211ENST00000489379 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.05■■■■■ 5.28
EHD1-211ENST00000489379 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.79■■■■■ 5.24
EHD1-211ENST00000489379 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.16■■■■■ 5.14
EHD1-211ENST00000489379 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.01■■■■■ 5.12
EHD1-211ENST00000489379 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.73■■■■■ 5.07
EHD1-211ENST00000489379 SMARCA4P51532 1647 aa46.17■■■■■ 4.98
EHD1-211ENST00000489379 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.13■■■■■ 4.98
EHD1-211ENST00000489379 NCAPD3P42695 1498 aa46.02■■■■■ 4.96
EHD1-211ENST00000489379 SMARCA2P51531 1590 aa45.97■■■■■ 4.95
EHD1-211ENST00000489379 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.96■■■■■ 4.95
EHD1-211ENST00000489379 HMGXB3Q12766 1538 aa45.78■■■■■ 4.92
EHD1-211ENST00000489379 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.78■■■■■ 4.92
EHD1-211ENST00000489379 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.75■■■■■ 4.91
EHD1-211ENST00000489379 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.59■■■■■ 4.89
EHD1-211ENST00000489379 WIZO95785 1651 aa45.25■■■■■ 4.83
EHD1-211ENST00000489379 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.18■■■■■ 4.82
EHD1-211ENST00000489379 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.86■■■■■ 4.77
EHD1-211ENST00000489379 NESP48681 1621 aa44.84■■■■■ 4.77
EHD1-211ENST00000489379 ERCC6Q03468 1493 aa44.84■■■■■ 4.77
EHD1-211ENST00000489379 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.82■■■■■ 4.77
EHD1-211ENST00000489379 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.65■■■■■ 4.74
EHD1-211ENST00000489379 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.57■■■■■ 4.72
EHD1-211ENST00000489379 CUX2O14529 1486 aa44.51■■■■■ 4.72
EHD1-211ENST00000489379 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.39■■■■■ 4.7
EHD1-211ENST00000489379 CFTRP13569 1480 aa44.34■■■■■ 4.69
EHD1-211ENST00000489379 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.29■■■■■ 4.68
EHD1-211ENST00000489379 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.25■■■■■ 4.67
EHD1-211ENST00000489379 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.11■■■■■ 4.65
EHD1-211ENST00000489379 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.09■■■■■ 4.65
EHD1-211ENST00000489379 PRDM2Q13029 1718 aa44.07■■■■■ 4.65
EHD1-211ENST00000489379 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.07■■■■■ 4.65
EHD1-211ENST00000489379 WDR62O43379 1518 aa43.94■■■■■ 4.62
EHD1-211ENST00000489379 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.81■■■■■ 4.6
EHD1-211ENST00000489379 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.64■■■■■ 4.58
EHD1-211ENST00000489379 ABCC8Q09428 1581 aa43.5■■■■■ 4.55
EHD1-211ENST00000489379 TOPBP1Q92547 1522 aa43.38■■■■■ 4.54
EHD1-211ENST00000489379 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.34■■■■■ 4.53
EHD1-211ENST00000489379 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.34■■■■■ 4.53
EHD1-211ENST00000489379 IFT140Q96RY7 1462 aa43.2■■■■■ 4.51
EHD1-211ENST00000489379 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.99■■■■■ 4.47
EHD1-211ENST00000489379 CUX1P39880 1505 aa42.94■■■■■ 4.46
EHD1-211ENST00000489379 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.93■■■■■ 4.46
EHD1-211ENST00000489379 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.92■■■■■ 4.46
EHD1-211ENST00000489379 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.84■■■■■ 4.45
EHD1-211ENST00000489379 SOGA1O94964 1423 aa42.83■■■■■ 4.45
EHD1-211ENST00000489379 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.79■■■■■ 4.44
EHD1-211ENST00000489379 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.74■■■■■ 4.43
EHD1-211ENST00000489379 WDR97A6NE52 1622 aa42.71■■■■■ 4.43
EHD1-211ENST00000489379 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.67■■■■■ 4.42
EHD1-211ENST00000489379 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.63■■■■■ 4.42
EHD1-211ENST00000489379 OSCARQ8IYS5 282 aa42.61■■■■■ 4.41
EHD1-211ENST00000489379 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.59■■■■■ 4.41
EHD1-211ENST00000489379 TOP2BQ02880 1626 aa42.58■■■■■ 4.41
EHD1-211ENST00000489379 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.55■■■■■ 4.4
EHD1-211ENST00000489379 SYNJ1O43426 1573 aa42.48■■■■■ 4.39
EHD1-211ENST00000489379 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.47■■■■■ 4.39
EHD1-211ENST00000489379 GRIN2BQ13224 1484 aa42.38■■■■■ 4.38
EHD1-211ENST00000489379 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.34■■■■■ 4.37
EHD1-211ENST00000489379 CHD1O14646 1710 aa42.32■■■■■ 4.36
EHD1-211ENST00000489379 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.31■■■■■ 4.36
EHD1-211ENST00000489379 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.3■■■■■ 4.36
EHD1-211ENST00000489379 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.29■■■■■ 4.36
EHD1-211ENST00000489379 PBRM1Q86U86 1689 aa42.27■■■■■ 4.36
EHD1-211ENST00000489379 FBLN2P98095 1184 aa42.21■■■■■ 4.35
EHD1-211ENST00000489379 SYNJ2O15056 1496 aa42.12■■■■■ 4.33
EHD1-211ENST00000489379 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.12■■■■■ 4.33
EHD1-211ENST00000489379 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42■■■■■ 4.31
EHD1-211ENST00000489379 ADAMTS12P58397 1594 aa41.9■■■■■ 4.3
EHD1-211ENST00000489379 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.89■■■■■ 4.3
EHD1-211ENST00000489379 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.89■■■■■ 4.3
EHD1-211ENST00000489379 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.89■■■■■ 4.3
EHD1-211ENST00000489379 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.86■■■■■ 4.29
EHD1-211ENST00000489379 ARHGEF11O15085 1522 aa41.86■■■■■ 4.29
EHD1-211ENST00000489379 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.85■■■■■ 4.29
EHD1-211ENST00000489379 GRIN2AQ12879 1464 aa41.81■■■■■ 4.28
EHD1-211ENST00000489379 KIF27Q86VH2 1401 aa41.79■■■■■ 4.28
EHD1-211ENST00000489379 TRIM41Q8WV44 630 aa41.73■■■■■ 4.27
EHD1-211ENST00000489379 NUP160Q12769 1436 aa41.64■■■■■ 4.26
EHD1-211ENST00000489379 IGF1RP08069 1367 aa41.61■■■■■ 4.25
EHD1-211ENST00000489379 CUL7Q14999 1698 aa41.58■■■■■ 4.25
EHD1-211ENST00000489379 CEP170Q5SW79 1584 aa41.57■■■■■ 4.25
EHD1-211ENST00000489379 ARAP1Q96P48 1450 aa41.48■■■■■ 4.23
EHD1-211ENST00000489379 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.46■■■■■ 4.23
EHD1-211ENST00000489379 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.37■■■■■ 4.21
EHD1-211ENST00000489379 SHROOM2Q13796 1616 aa41.37■■■■■ 4.21
EHD1-211ENST00000489379 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.28■■■■■ 4.2
EHD1-211ENST00000489379 JPH4Q96JJ6 628 aa41.22■■■■■ 4.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 128.7 ms