RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488944.5

WDR46-238, Transcript of WD repeat domain 46, humanhuman

TSL 3

Gene WDR46, Length 538 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR46-238ENST00000488944 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.38■■■□□ 2.77
WDR46-238ENST00000488944 ABCC9O60706 1549 aa29.09■■■□□ 2.25
WDR46-238ENST00000488944 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.05■■■□□ 2.24
WDR46-238ENST00000488944 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.65■■■□□ 2.02
WDR46-238ENST00000488944 NACADO15069 1562 aa27.43■■□□□ 1.98
WDR46-238ENST00000488944 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.36■■□□□ 1.97
WDR46-238ENST00000488944 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.26■■□□□ 1.95
WDR46-238ENST00000488944 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.11■■□□□ 1.93
WDR46-238ENST00000488944 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.07■■□□□ 1.92
WDR46-238ENST00000488944 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.02■■□□□ 1.92
WDR46-238ENST00000488944 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.88■■□□□ 1.89
WDR46-238ENST00000488944 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
WDR46-238ENST00000488944 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.7■■□□□ 1.86
WDR46-238ENST00000488944 SCRIBQ14160 1630 aa26.54■■□□□ 1.84
WDR46-238ENST00000488944 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.42■■□□□ 1.82
WDR46-238ENST00000488944 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.27■■□□□ 1.8
WDR46-238ENST00000488944 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.79
WDR46-238ENST00000488944 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.17■■□□□ 1.78
WDR46-238ENST00000488944 NCAPD3P42695 1498 aa25.32■■□□□ 1.64
WDR46-238ENST00000488944 SMARCA4P51532 1647 aa25.28■■□□□ 1.64
WDR46-238ENST00000488944 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.28■■□□□ 1.64
WDR46-238ENST00000488944 SMARCA2P51531 1590 aa25.19■■□□□ 1.62
WDR46-238ENST00000488944 HMGXB3Q12766 1538 aa25.16■■□□□ 1.62
WDR46-238ENST00000488944 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
WDR46-238ENST00000488944 ERCC6Q03468 1493 aa25.08■■□□□ 1.6
WDR46-238ENST00000488944 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
WDR46-238ENST00000488944 CUX2O14529 1486 aa25■■□□□ 1.59
WDR46-238ENST00000488944 NESP48681 1621 aa25■■□□□ 1.59
WDR46-238ENST00000488944 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.99■■□□□ 1.59
WDR46-238ENST00000488944 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.98■■□□□ 1.59
WDR46-238ENST00000488944 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.96■■□□□ 1.59
WDR46-238ENST00000488944 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.77■■□□□ 1.56
WDR46-238ENST00000488944 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
WDR46-238ENST00000488944 WIZO95785 1651 aa24.71■■□□□ 1.55
WDR46-238ENST00000488944 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.69■■□□□ 1.54
WDR46-238ENST00000488944 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.61■■□□□ 1.53
WDR46-238ENST00000488944 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.56■■□□□ 1.52
WDR46-238ENST00000488944 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
WDR46-238ENST00000488944 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.43■■□□□ 1.5
WDR46-238ENST00000488944 WDR62O43379 1518 aa24.36■■□□□ 1.49
WDR46-238ENST00000488944 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
WDR46-238ENST00000488944 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.34■■□□□ 1.49
WDR46-238ENST00000488944 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.32■■□□□ 1.48
WDR46-238ENST00000488944 CFTRP13569 1480 aa24.29■■□□□ 1.48
WDR46-238ENST00000488944 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
WDR46-238ENST00000488944 PRDM2Q13029 1718 aa24.12■■□□□ 1.45
WDR46-238ENST00000488944 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.08■■□□□ 1.45
WDR46-238ENST00000488944 TRIM41Q8WV44 630 aa23.95■■□□□ 1.42
WDR46-238ENST00000488944 TOPBP1Q92547 1522 aa23.86■■□□□ 1.41
WDR46-238ENST00000488944 OSCARQ8IYS5 282 aa23.85■■□□□ 1.41
WDR46-238ENST00000488944 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
WDR46-238ENST00000488944 IFT140Q96RY7 1462 aa23.82■■□□□ 1.4
WDR46-238ENST00000488944 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.78■■□□□ 1.4
WDR46-238ENST00000488944 ABCC8Q09428 1581 aa23.75■■□□□ 1.39
WDR46-238ENST00000488944 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
WDR46-238ENST00000488944 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
WDR46-238ENST00000488944 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.62■■□□□ 1.377e-7■■■■■ 29.8
WDR46-238ENST00000488944 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
WDR46-238ENST00000488944 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.61■■□□□ 1.37
WDR46-238ENST00000488944 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.61■■□□□ 1.37
WDR46-238ENST00000488944 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.61■■□□□ 1.37
WDR46-238ENST00000488944 CHD1O14646 1710 aa23.56■■□□□ 1.36
WDR46-238ENST00000488944 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.56■■□□□ 1.36
WDR46-238ENST00000488944 ARHGEF11O15085 1522 aa23.52■■□□□ 1.36
WDR46-238ENST00000488944 SOGA1O94964 1423 aa23.5■■□□□ 1.35
WDR46-238ENST00000488944 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.49■■□□□ 1.35
WDR46-238ENST00000488944 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
WDR46-238ENST00000488944 CUX1P39880 1505 aa23.47■■□□□ 1.35
WDR46-238ENST00000488944 FBLN2P98095 1184 aa23.46■■□□□ 1.35
WDR46-238ENST00000488944 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
WDR46-238ENST00000488944 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.38■■□□□ 1.33
WDR46-238ENST00000488944 WDR97A6NE52 1622 aa23.36■■□□□ 1.33
WDR46-238ENST00000488944 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.33■■□□□ 1.33
WDR46-238ENST00000488944 ARAP1Q96P48 1450 aa23.3■■□□□ 1.32
WDR46-238ENST00000488944 GRIN2BQ13224 1484 aa23.28■■□□□ 1.32
WDR46-238ENST00000488944 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
WDR46-238ENST00000488944 PBRM1Q86U86 1689 aa23.26■■□□□ 1.31
WDR46-238ENST00000488944 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
WDR46-238ENST00000488944 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.24■■□□□ 1.31
WDR46-238ENST00000488944 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.22■■□□□ 1.31
WDR46-238ENST00000488944 SYNJ1O43426 1573 aa23.22■■□□□ 1.31
WDR46-238ENST00000488944 SYNJ2O15056 1496 aa23.21■■□□□ 1.31
WDR46-238ENST00000488944 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.19■■□□□ 1.3
WDR46-238ENST00000488944 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.18■■□□□ 1.3
WDR46-238ENST00000488944 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.1■■□□□ 1.29
WDR46-238ENST00000488944 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.08■■□□□ 1.29
WDR46-238ENST00000488944 TOP2BQ02880 1626 aa23.08■■□□□ 1.29
WDR46-238ENST00000488944 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
WDR46-238ENST00000488944 ADAMTS12P58397 1594 aa23.01■■□□□ 1.27
WDR46-238ENST00000488944 GRIN2AQ12879 1464 aa23■■□□□ 1.27
WDR46-238ENST00000488944 CEP170Q5SW79 1584 aa22.95■■□□□ 1.26
WDR46-238ENST00000488944 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.93■■□□□ 1.26
WDR46-238ENST00000488944 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.91■■□□□ 1.26
WDR46-238ENST00000488944 NUP160Q12769 1436 aa22.91■■□□□ 1.26
WDR46-238ENST00000488944 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.89■■□□□ 1.26
WDR46-238ENST00000488944 SHROOM2Q13796 1616 aa22.82■■□□□ 1.24
WDR46-238ENST00000488944 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
WDR46-238ENST00000488944 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.69■■□□□ 1.22
WDR46-238ENST00000488944 JPH4Q96JJ6 628 aa22.66■■□□□ 1.22
WDR46-238ENST00000488944 KIF27Q86VH2 1401 aa22.6■■□□□ 1.21
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