RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488613.1

DOK1-211, Transcript of docking protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene DOK1, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DOK1-211ENST00000488613 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.71■■■■■ 6.83
DOK1-211ENST00000488613 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.42■■■■■ 5.82
DOK1-211ENST00000488613 ABCC9O60706 1549 aa50.62■■■■■ 5.69
DOK1-211ENST00000488613 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.56■■■■■ 5.36
DOK1-211ENST00000488613 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.56■■■■■ 5.36
DOK1-211ENST00000488613 NACADO15069 1562 aa48.4■■■■■ 5.34
DOK1-211ENST00000488613 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.03■■■■■ 5.28
DOK1-211ENST00000488613 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.93■■■■■ 5.26
DOK1-211ENST00000488613 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.66■■■■■ 5.22
DOK1-211ENST00000488613 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.41■■■■■ 5.18
DOK1-211ENST00000488613 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.28■■■■■ 5.16
DOK1-211ENST00000488613 SCRIBQ14160 1630 aa47.02■■■■■ 5.12
DOK1-211ENST00000488613 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.99■■■■■ 5.11
DOK1-211ENST00000488613 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.52■■■■■ 5.04
DOK1-211ENST00000488613 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.49■■■■■ 5.03
DOK1-211ENST00000488613 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.84■■■■■ 4.93
DOK1-211ENST00000488613 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.73■■■■■ 4.91
DOK1-211ENST00000488613 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.49■■■■■ 4.87
DOK1-211ENST00000488613 SMARCA4P51532 1647 aa44.87■■■■■ 4.77
DOK1-211ENST00000488613 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.79■■■■■ 4.76
DOK1-211ENST00000488613 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.65■■■■■ 4.74
DOK1-211ENST00000488613 SMARCA2P51531 1590 aa44.64■■■■■ 4.74
DOK1-211ENST00000488613 NCAPD3P42695 1498 aa44.6■■■■■ 4.73
DOK1-211ENST00000488613 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.5■■■■■ 4.71
DOK1-211ENST00000488613 HMGXB3Q12766 1538 aa44.42■■■■■ 4.7
DOK1-211ENST00000488613 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.36■■■■■ 4.69
DOK1-211ENST00000488613 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.33■■■■■ 4.69
DOK1-211ENST00000488613 WIZO95785 1651 aa44.04■■■■■ 4.64
DOK1-211ENST00000488613 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.89■■■■■ 4.62
DOK1-211ENST00000488613 ERCC6Q03468 1493 aa43.73■■■■■ 4.59
DOK1-211ENST00000488613 NESP48681 1621 aa43.7■■■■■ 4.59
DOK1-211ENST00000488613 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.56■■■■■ 4.56
DOK1-211ENST00000488613 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.54■■■■■ 4.56
DOK1-211ENST00000488613 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.35■■■■■ 4.53
DOK1-211ENST00000488613 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.29■■■■■ 4.52
DOK1-211ENST00000488613 CUX2O14529 1486 aa43.21■■■■■ 4.51
DOK1-211ENST00000488613 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.19■■■■■ 4.5
DOK1-211ENST00000488613 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.05■■■■■ 4.48
DOK1-211ENST00000488613 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.03■■■■■ 4.48
DOK1-211ENST00000488613 CFTRP13569 1480 aa43.02■■■■■ 4.48
DOK1-211ENST00000488613 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.92■■■■■ 4.46
DOK1-211ENST00000488613 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.91■■■■■ 4.46
DOK1-211ENST00000488613 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.86■■■■■ 4.45
DOK1-211ENST00000488613 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.83■■■■■ 4.45
DOK1-211ENST00000488613 PRDM2Q13029 1718 aa42.74■■■■■ 4.43
DOK1-211ENST00000488613 WDR62O43379 1518 aa42.67■■■■■ 4.42
DOK1-211ENST00000488613 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.46■■■■■ 4.39
DOK1-211ENST00000488613 TOPBP1Q92547 1522 aa42.18■■■■■ 4.34
DOK1-211ENST00000488613 ABCC8Q09428 1581 aa42.15■■■■■ 4.34
DOK1-211ENST00000488613 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.12■■■■■ 4.33
DOK1-211ENST00000488613 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.09■■■■■ 4.33
DOK1-211ENST00000488613 IFT140Q96RY7 1462 aa41.98■■■■■ 4.31
DOK1-211ENST00000488613 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.79■■■■■ 4.28
DOK1-211ENST00000488613 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.79■■■■■ 4.28
DOK1-211ENST00000488613 CUX1P39880 1505 aa41.77■■■■■ 4.28
DOK1-211ENST00000488613 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.7■■■■■ 4.27
DOK1-211ENST00000488613 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.69■■■■■ 4.27
DOK1-211ENST00000488613 SOGA1O94964 1423 aa41.66■■■■■ 4.26
DOK1-211ENST00000488613 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.65■■■■■ 4.26
DOK1-211ENST00000488613 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.65■■■■■ 4.26
DOK1-211ENST00000488613 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.55■■■■■ 4.24
DOK1-211ENST00000488613 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.46■■■■■ 4.23
DOK1-211ENST00000488613 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.46■■■■■ 4.23
DOK1-211ENST00000488613 OSCARQ8IYS5 282 aa41.42■■■■■ 4.22
DOK1-211ENST00000488613 SYNJ1O43426 1573 aa41.35■■■■■ 4.21
DOK1-211ENST00000488613 WDR97A6NE52 1622 aa41.35■■■■■ 4.21
DOK1-211ENST00000488613 TOP2BQ02880 1626 aa41.35■■■■■ 4.21
DOK1-211ENST00000488613 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.35■■■■■ 4.21
DOK1-211ENST00000488613 FBLN2P98095 1184 aa41.25■■■■■ 4.19
DOK1-211ENST00000488613 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.23■■■■■ 4.19
DOK1-211ENST00000488613 GRIN2BQ13224 1484 aa41.2■■■■■ 4.19
DOK1-211ENST00000488613 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.2■■■■■ 4.19
DOK1-211ENST00000488613 CHD1O14646 1710 aa41.18■■■■■ 4.18
DOK1-211ENST00000488613 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.18■■■■■ 4.18
DOK1-211ENST00000488613 PBRM1Q86U86 1689 aa41.12■■■■■ 4.17
DOK1-211ENST00000488613 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.1■■■■■ 4.17
DOK1-211ENST00000488613 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.09■■■■■ 4.17
DOK1-211ENST00000488613 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.03■■■■■ 4.16
DOK1-211ENST00000488613 SYNJ2O15056 1496 aa40.94■■■■■ 4.14
DOK1-211ENST00000488613 TRIM41Q8WV44 630 aa40.84■■■■■ 4.13
DOK1-211ENST00000488613 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.77■■■■■ 4.12
DOK1-211ENST00000488613 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.77■■■■■ 4.12
DOK1-211ENST00000488613 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.77■■■■■ 4.12
DOK1-211ENST00000488613 ADAMTS12P58397 1594 aa40.76■■■■■ 4.12
DOK1-211ENST00000488613 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.75■■■■■ 4.11
DOK1-211ENST00000488613 ARHGEF11O15085 1522 aa40.73■■■■■ 4.11
DOK1-211ENST00000488613 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.67■■■■■ 4.1
DOK1-211ENST00000488613 GRIN2AQ12879 1464 aa40.65■■■■■ 4.1
DOK1-211ENST00000488613 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.65■■■■■ 4.1
DOK1-211ENST00000488613 KIF27Q86VH2 1401 aa40.63■■■■■ 4.09
DOK1-211ENST00000488613 CEP170Q5SW79 1584 aa40.45■■■■■ 4.07
DOK1-211ENST00000488613 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.43■■■■■ 4.06
DOK1-211ENST00000488613 NUP160Q12769 1436 aa40.42■■■■■ 4.06
DOK1-211ENST00000488613 IGF1RP08069 1367 aa40.4■■■■■ 4.06
DOK1-211ENST00000488613 CUL7Q14999 1698 aa40.38■■■■■ 4.05
DOK1-211ENST00000488613 ARAP1Q96P48 1450 aa40.37■■■■■ 4.05
DOK1-211ENST00000488613 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.23■■■■■ 4.03
DOK1-211ENST00000488613 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.16■■■■■ 4.02
DOK1-211ENST00000488613 SHROOM2Q13796 1616 aa40.13■■■■■ 4.02
DOK1-211ENST00000488613 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.1■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.7 ms