RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488196.5

STRADB-209, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 424 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-209ENST00000488196 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.06■■■■■ 6.73
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STRADB-209ENST00000488196 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.92■■■■■ 5.26
STRADB-209ENST00000488196 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.89■■■■■ 5.26
STRADB-209ENST00000488196 NACADO15069 1562 aa47.79■■■■■ 5.24
STRADB-209ENST00000488196 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.47■■■■■ 5.19
STRADB-209ENST00000488196 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.39■■■■■ 5.18
STRADB-209ENST00000488196 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.13■■■■■ 5.14
STRADB-209ENST00000488196 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.91■■■■■ 5.1
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STRADB-209ENST00000488196 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.87■■■■■ 4.93
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STRADB-209ENST00000488196 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.19■■■■■ 4.83
STRADB-209ENST00000488196 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.92■■■■■ 4.78
STRADB-209ENST00000488196 SMARCA4P51532 1647 aa44.33■■■■■ 4.69
STRADB-209ENST00000488196 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.22■■■■■ 4.67
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STRADB-209ENST00000488196 NCAPD3P42695 1498 aa44.13■■■■■ 4.65
STRADB-209ENST00000488196 SMARCA2P51531 1590 aa44.04■■■■■ 4.64
STRADB-209ENST00000488196 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.01■■■■■ 4.64
STRADB-209ENST00000488196 HMGXB3Q12766 1538 aa43.87■■■■■ 4.61
STRADB-209ENST00000488196 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.85■■■■■ 4.61
STRADB-209ENST00000488196 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.76■■■■■ 4.6
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STRADB-209ENST00000488196 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.42■■■■■ 4.54
STRADB-209ENST00000488196 NESP48681 1621 aa43.22■■■■■ 4.51
STRADB-209ENST00000488196 ERCC6Q03468 1493 aa43.08■■■■■ 4.49
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STRADB-209ENST00000488196 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.85■■■■■ 4.45
STRADB-209ENST00000488196 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.71■■■■■ 4.43
STRADB-209ENST00000488196 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.68■■■■■ 4.42
STRADB-209ENST00000488196 CUX2O14529 1486 aa42.65■■■■■ 4.42
STRADB-209ENST00000488196 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.55■■■■■ 4.4
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STRADB-209ENST00000488196 CFTRP13569 1480 aa42.54■■■■■ 4.4
STRADB-209ENST00000488196 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.37■■■■■ 4.37
STRADB-209ENST00000488196 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.32■■■■■ 4.37
STRADB-209ENST00000488196 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.3■■■■■ 4.36
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STRADB-209ENST00000488196 PRDM2Q13029 1718 aa42.19■■■■■ 4.34
STRADB-209ENST00000488196 WDR62O43379 1518 aa42.16■■■■■ 4.34
STRADB-209ENST00000488196 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.98■■■■■ 4.31
STRADB-209ENST00000488196 TOPBP1Q92547 1522 aa41.68■■■■■ 4.26
STRADB-209ENST00000488196 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.67■■■■■ 4.26
STRADB-209ENST00000488196 ABCC8Q09428 1581 aa41.59■■■■■ 4.25
STRADB-209ENST00000488196 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.58■■■■■ 4.25
STRADB-209ENST00000488196 IFT140Q96RY7 1462 aa41.43■■■■■ 4.22
STRADB-209ENST00000488196 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.34■■■■■ 4.21
STRADB-209ENST00000488196 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.3■■■■■ 4.2
STRADB-209ENST00000488196 CUX1P39880 1505 aa41.29■■■■■ 4.2
STRADB-209ENST00000488196 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.22■■■■■ 4.19
STRADB-209ENST00000488196 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.18■■■■■ 4.18
STRADB-209ENST00000488196 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.18■■■■■ 4.18
STRADB-209ENST00000488196 SOGA1O94964 1423 aa41.15■■■■■ 4.18
STRADB-209ENST00000488196 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
STRADB-209ENST00000488196 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.09■■■■■ 4.17
STRADB-209ENST00000488196 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
STRADB-209ENST00000488196 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.93■■■■■ 4.14
STRADB-209ENST00000488196 OSCARQ8IYS5 282 aa40.91■■■■■ 4.14
STRADB-209ENST00000488196 SYNJ1O43426 1573 aa40.86■■■■■ 4.13
STRADB-209ENST00000488196 TOP2BQ02880 1626 aa40.85■■■■■ 4.13
STRADB-209ENST00000488196 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.84■■■■■ 4.13
STRADB-209ENST00000488196 WDR97A6NE52 1622 aa40.82■■■■■ 4.13
STRADB-209ENST00000488196 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.74■■■■■ 4.11
STRADB-209ENST00000488196 CHD1O14646 1710 aa40.67■■■■■ 4.1
STRADB-209ENST00000488196 GRIN2BQ13224 1484 aa40.66■■■■■ 4.1
STRADB-209ENST00000488196 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.66■■■■■ 4.1
STRADB-209ENST00000488196 FBLN2P98095 1184 aa40.66■■■■■ 4.1
STRADB-209ENST00000488196 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.65■■■■■ 4.1
STRADB-209ENST00000488196 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.6■■■■■ 4.09
STRADB-209ENST00000488196 PBRM1Q86U86 1689 aa40.58■■■■■ 4.09
STRADB-209ENST00000488196 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.55■■■■■ 4.08
STRADB-209ENST00000488196 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.47■■■■■ 4.07
STRADB-209ENST00000488196 SYNJ2O15056 1496 aa40.41■■■■■ 4.06
STRADB-209ENST00000488196 TRIM41Q8WV44 630 aa40.28■■■■■ 4.04
STRADB-209ENST00000488196 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.27■■■■■ 4.04
STRADB-209ENST00000488196 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.27■■■■■ 4.04
STRADB-209ENST00000488196 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.27■■■■■ 4.04
STRADB-209ENST00000488196 ADAMTS12P58397 1594 aa40.23■■■■■ 4.03
STRADB-209ENST00000488196 ARHGEF11O15085 1522 aa40.23■■■■■ 4.03
STRADB-209ENST00000488196 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.23■■■■■ 4.03
STRADB-209ENST00000488196 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.18■■■■■ 4.02
STRADB-209ENST00000488196 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.16■■■■■ 4.02
STRADB-209ENST00000488196 GRIN2AQ12879 1464 aa40.14■■■■■ 4.02
STRADB-209ENST00000488196 KIF27Q86VH2 1401 aa40.08■■■■■ 4.01
STRADB-209ENST00000488196 IGF1RP08069 1367 aa39.98■■■■□ 3.99
STRADB-209ENST00000488196 CEP170Q5SW79 1584 aa39.97■■■■□ 3.99
STRADB-209ENST00000488196 NUP160Q12769 1436 aa39.97■■■■□ 3.99
STRADB-209ENST00000488196 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.94■■■■□ 3.98
STRADB-209ENST00000488196 ARAP1Q96P48 1450 aa39.92■■■■□ 3.98
STRADB-209ENST00000488196 CUL7Q14999 1698 aa39.82■■■■□ 3.96
STRADB-209ENST00000488196 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.75■■■■□ 3.95
STRADB-209ENST00000488196 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.73■■■■□ 3.95
STRADB-209ENST00000488196 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.69■■■■□ 3.94
STRADB-209ENST00000488196 SHROOM2Q13796 1616 aa39.68■■■■□ 3.94
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