RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488157.5

NISCH-210, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-210ENST00000488157 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.45■■■□□ 2.31
NISCH-210ENST00000488157 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.11■■□□□ 1.77
NISCH-210ENST00000488157 ABCC9O60706 1549 aa25.63■■□□□ 1.69
NISCH-210ENST00000488157 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.68■■□□□ 1.54
NISCH-210ENST00000488157 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.57■■□□□ 1.52
NISCH-210ENST00000488157 NACADO15069 1562 aa24.54■■□□□ 1.52
NISCH-210ENST00000488157 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
NISCH-210ENST00000488157 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.36■■□□□ 1.49
NISCH-210ENST00000488157 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.3■■□□□ 1.48
NISCH-210ENST00000488157 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.12■■□□□ 1.45
NISCH-210ENST00000488157 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24■■□□□ 1.43
NISCH-210ENST00000488157 SCRIBQ14160 1630 aa23.92■■□□□ 1.42
NISCH-210ENST00000488157 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.91■■□□□ 1.42
NISCH-210ENST00000488157 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.57■■□□□ 1.36
NISCH-210ENST00000488157 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.48■■□□□ 1.35
NISCH-210ENST00000488157 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
NISCH-210ENST00000488157 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.15■■□□□ 1.3
NISCH-210ENST00000488157 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.02■■□□□ 1.28
NISCH-210ENST00000488157 SMARCA4P51532 1647 aa22.85■■□□□ 1.25
NISCH-210ENST00000488157 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
NISCH-210ENST00000488157 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.76■■□□□ 1.23
NISCH-210ENST00000488157 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.72■■□□□ 1.23
NISCH-210ENST00000488157 NCAPD3P42695 1498 aa22.66■■□□□ 1.22
NISCH-210ENST00000488157 SMARCA2P51531 1590 aa22.63■■□□□ 1.21
NISCH-210ENST00000488157 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.58■■□□□ 1.2
NISCH-210ENST00000488157 HMGXB3Q12766 1538 aa22.53■■□□□ 1.2
NISCH-210ENST00000488157 WIZO95785 1651 aa22.53■■□□□ 1.2
NISCH-210ENST00000488157 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
NISCH-210ENST00000488157 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
NISCH-210ENST00000488157 NESP48681 1621 aa22.22■■□□□ 1.15
NISCH-210ENST00000488157 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
NISCH-210ENST00000488157 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.04■■□□□ 1.12
NISCH-210ENST00000488157 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.02■■□□□ 1.12
NISCH-210ENST00000488157 ERCC6Q03468 1493 aa22.02■■□□□ 1.12
NISCH-210ENST00000488157 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
NISCH-210ENST00000488157 CCDC88BA6NC98 1476 aa22■■□□□ 1.11
NISCH-210ENST00000488157 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.92■■□□□ 1.1
NISCH-210ENST00000488157 CFTRP13569 1480 aa21.9■■□□□ 1.1
NISCH-210ENST00000488157 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.89■■□□□ 1.09
NISCH-210ENST00000488157 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
NISCH-210ENST00000488157 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.78■■□□□ 1.08
NISCH-210ENST00000488157 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.73■■□□□ 1.07
NISCH-210ENST00000488157 PRDM2Q13029 1718 aa21.73■■□□□ 1.07
NISCH-210ENST00000488157 CUX2O14529 1486 aa21.72■■□□□ 1.07
NISCH-210ENST00000488157 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.69■■□□□ 1.06
NISCH-210ENST00000488157 WDR62O43379 1518 aa21.62■■□□□ 1.05
NISCH-210ENST00000488157 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
NISCH-210ENST00000488157 TOPBP1Q92547 1522 aa21.45■■□□□ 1.02
NISCH-210ENST00000488157 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.4■■□□□ 1.02
NISCH-210ENST00000488157 ABCC8Q09428 1581 aa21.36■■□□□ 1.01
NISCH-210ENST00000488157 CUX1P39880 1505 aa21.33■■□□□ 1
NISCH-210ENST00000488157 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
NISCH-210ENST00000488157 IFT140Q96RY7 1462 aa21.26■□□□□ 0.99
NISCH-210ENST00000488157 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
NISCH-210ENST00000488157 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.23■□□□□ 0.99
NISCH-210ENST00000488157 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.23■□□□□ 0.99
NISCH-210ENST00000488157 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
NISCH-210ENST00000488157 SOGA1O94964 1423 aa21.19■□□□□ 0.98
NISCH-210ENST00000488157 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.17■□□□□ 0.98
NISCH-210ENST00000488157 SYNJ1O43426 1573 aa21.16■□□□□ 0.98
NISCH-210ENST00000488157 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.13■□□□□ 0.97
NISCH-210ENST00000488157 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
NISCH-210ENST00000488157 TOP2BQ02880 1626 aa21.11■□□□□ 0.97
NISCH-210ENST00000488157 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.11■□□□□ 0.97
NISCH-210ENST00000488157 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
NISCH-210ENST00000488157 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.1■□□□□ 0.97
NISCH-210ENST00000488157 WDR97A6NE52 1622 aa21.05■□□□□ 0.96
NISCH-210ENST00000488157 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.99■□□□□ 0.95
NISCH-210ENST00000488157 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.93■□□□□ 0.94
NISCH-210ENST00000488157 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.93■□□□□ 0.94
NISCH-210ENST00000488157 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.9■□□□□ 0.94
NISCH-210ENST00000488157 PBRM1Q86U86 1689 aa20.89■□□□□ 0.94
NISCH-210ENST00000488157 GRIN2BQ13224 1484 aa20.89■□□□□ 0.94
NISCH-210ENST00000488157 OSCARQ8IYS5 282 aa20.89■□□□□ 0.93
NISCH-210ENST00000488157 CHD1O14646 1710 aa20.88■□□□□ 0.93
NISCH-210ENST00000488157 FBLN2P98095 1184 aa20.87■□□□□ 0.93
NISCH-210ENST00000488157 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
NISCH-210ENST00000488157 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
NISCH-210ENST00000488157 SYNJ2O15056 1496 aa20.75■□□□□ 0.91
NISCH-210ENST00000488157 TRIM41Q8WV44 630 aa20.72■□□□□ 0.91
NISCH-210ENST00000488157 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.72■□□□□ 0.91
NISCH-210ENST00000488157 ADAMTS12P58397 1594 aa20.72■□□□□ 0.91
NISCH-210ENST00000488157 KIF27Q86VH2 1401 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-210ENST00000488157 IGF1RP08069 1367 aa20.66■□□□□ 0.9
NISCH-210ENST00000488157 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.66■□□□□ 0.9
NISCH-210ENST00000488157 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.66■□□□□ 0.9
NISCH-210ENST00000488157 GRIN2AQ12879 1464 aa20.64■□□□□ 0.89
NISCH-210ENST00000488157 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.62■□□□□ 0.89
NISCH-210ENST00000488157 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.58■□□□□ 0.89
NISCH-210ENST00000488157 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.58■□□□□ 0.89
NISCH-210ENST00000488157 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.58■□□□□ 0.89
NISCH-210ENST00000488157 CEP170Q5SW79 1584 aa20.58■□□□□ 0.88
NISCH-210ENST00000488157 ARHGEF11O15085 1522 aa20.56■□□□□ 0.88
NISCH-210ENST00000488157 NUP160Q12769 1436 aa20.54■□□□□ 0.88
NISCH-210ENST00000488157 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.54■□□□□ 0.88
NISCH-210ENST00000488157 CUL7Q14999 1698 aa20.54■□□□□ 0.88
NISCH-210ENST00000488157 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.52■□□□□ 0.88
NISCH-210ENST00000488157 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.42■□□□□ 0.86
NISCH-210ENST00000488157 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.42■□□□□ 0.86
NISCH-210ENST00000488157 ARAP1Q96P48 1450 aa20.42■□□□□ 0.86
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