RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487774.1

C7orf49-211, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C7orf49, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf49-211ENST00000487774 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.93■■■■■ 5.42
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C7orf49-211ENST00000487774 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.44■■■■■ 4.39
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C7orf49-211ENST00000487774 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.53■■■■■ 4.24
C7orf49-211ENST00000487774 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.33■■■■■ 4.21
C7orf49-211ENST00000487774 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.16■■■■■ 4.18
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C7orf49-211ENST00000487774 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.6■■■■■ 4.09
C7orf49-211ENST00000487774 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.6■■■■■ 4.09
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C7orf49-211ENST00000487774 SCRIBQ14160 1630 aa40.25■■■■■ 4.03
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C7orf49-211ENST00000487774 NESP48681 1621 aa38.45■■■■□ 3.75
C7orf49-211ENST00000487774 HMGXB3Q12766 1538 aa38.42■■■■□ 3.74
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C7orf49-211ENST00000487774 SMARCA4P51532 1647 aa38.33■■■■□ 3.73
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C7orf49-211ENST00000487774 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.97■■■■□ 3.67
C7orf49-211ENST00000487774 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.91■■■■□ 3.66
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C7orf49-211ENST00000487774 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.71■■■■□ 3.63
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C7orf49-211ENST00000487774 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.23■■■■□ 3.55
C7orf49-211ENST00000487774 WIZO95785 1651 aa37.2■■■■□ 3.55
C7orf49-211ENST00000487774 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.13■■■■□ 3.54
C7orf49-211ENST00000487774 OSCARQ8IYS5 282 aa37.13■■■■□ 3.53
C7orf49-211ENST00000487774 CFTRP13569 1480 aa36.99■■■■□ 3.51
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C7orf49-211ENST00000487774 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.78■■■■□ 3.48
C7orf49-211ENST00000487774 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.78■■■■□ 3.48
C7orf49-211ENST00000487774 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.66■■■■□ 3.46
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C7orf49-211ENST00000487774 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
C7orf49-211ENST00000487774 ARHGEF11O15085 1522 aa36.59■■■■□ 3.45
C7orf49-211ENST00000487774 IFT140Q96RY7 1462 aa36.52■■■■□ 3.44
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C7orf49-211ENST00000487774 ARAP1Q96P48 1450 aa36.19■■■■□ 3.38
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C7orf49-211ENST00000487774 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.15■■■■□ 3.38
C7orf49-211ENST00000487774 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.14■■■■□ 3.38
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C7orf49-211ENST00000487774 SOGA1O94964 1423 aa35.74■■■■□ 3.31
C7orf49-211ENST00000487774 WDR97A6NE52 1622 aa35.64■■■■□ 3.3
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C7orf49-211ENST00000487774 CUX1P39880 1505 aa35.47■■■■□ 3.27
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C7orf49-211ENST00000487774 PBRM1Q86U86 1689 aa35.33■■■■□ 3.25
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C7orf49-211ENST00000487774 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.15■■■■□ 3.22
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C7orf49-211ENST00000487774 CEP170Q5SW79 1584 aa35.04■■■■□ 3.2
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C7orf49-211ENST00000487774 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.9■■■■□ 3.18
C7orf49-211ENST00000487774 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.83■■■■□ 3.17
C7orf49-211ENST00000487774 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.81■■■■□ 3.16
C7orf49-211ENST00000487774 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.71■■■■□ 3.15
C7orf49-211ENST00000487774 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.68■■■■□ 3.14
C7orf49-211ENST00000487774 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.68■■■■□ 3.14
C7orf49-211ENST00000487774 TOP2BQ02880 1626 aa34.66■■■■□ 3.14
C7orf49-211ENST00000487774 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.61■■■■□ 3.13
C7orf49-211ENST00000487774 JPH4Q96JJ6 628 aa34.6■■■■□ 3.13
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