RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487621.5

SEMA3C-209, Transcript of semaphorin 3C, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3C, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3C-209ENST00000487621 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.85■■■■■ 7.49
SEMA3C-209ENST00000487621 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.28■■■■■ 6.44
SEMA3C-209ENST00000487621 ABCC9O60706 1549 aa54.92■■■■■ 6.38
SEMA3C-209ENST00000487621 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.43■■■■■ 5.98
SEMA3C-209ENST00000487621 NACADO15069 1562 aa52.21■■■■■ 5.95
SEMA3C-209ENST00000487621 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.91■■■■■ 5.9
SEMA3C-209ENST00000487621 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.69■■■■■ 5.86
SEMA3C-209ENST00000487621 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.35■■■■■ 5.81
SEMA3C-209ENST00000487621 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.29■■■■■ 5.8
SEMA3C-209ENST00000487621 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.23■■■■■ 5.79
SEMA3C-209ENST00000487621 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.21■■■■■ 5.79
SEMA3C-209ENST00000487621 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.14■■■■■ 5.78
SEMA3C-209ENST00000487621 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.98■■■■■ 5.75
SEMA3C-209ENST00000487621 SCRIBQ14160 1630 aa50.37■■■■■ 5.65
SEMA3C-209ENST00000487621 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.32■■■■■ 5.65
SEMA3C-209ENST00000487621 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.66■■■■■ 5.54
SEMA3C-209ENST00000487621 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.64■■■■■ 5.54
SEMA3C-209ENST00000487621 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.45■■■■■ 5.51
SEMA3C-209ENST00000487621 NCAPD3P42695 1498 aa48.24■■■■■ 5.31
SEMA3C-209ENST00000487621 SMARCA4P51532 1647 aa48.14■■■■■ 5.3
SEMA3C-209ENST00000487621 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.13■■■■■ 5.3
SEMA3C-209ENST00000487621 SMARCA2P51531 1590 aa47.96■■■■■ 5.27
SEMA3C-209ENST00000487621 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.95■■■■■ 5.27
SEMA3C-209ENST00000487621 HMGXB3Q12766 1538 aa47.88■■■■■ 5.26
SEMA3C-209ENST00000487621 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.72■■■■■ 5.23
SEMA3C-209ENST00000487621 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.67■■■■■ 5.22
SEMA3C-209ENST00000487621 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.63■■■■■ 5.22
SEMA3C-209ENST00000487621 ERCC6Q03468 1493 aa47.34■■■■■ 5.17
SEMA3C-209ENST00000487621 NESP48681 1621 aa47.32■■■■■ 5.17
SEMA3C-209ENST00000487621 CUX2O14529 1486 aa47.21■■■■■ 5.15
SEMA3C-209ENST00000487621 WIZO95785 1651 aa47.06■■■■■ 5.12
SEMA3C-209ENST00000487621 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.03■■■■■ 5.12
SEMA3C-209ENST00000487621 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.84■■■■■ 5.09
SEMA3C-209ENST00000487621 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.78■■■■■ 5.08
SEMA3C-209ENST00000487621 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.78■■■■■ 5.08
SEMA3C-209ENST00000487621 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.77■■■■■ 5.08
SEMA3C-209ENST00000487621 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.75■■■■■ 5.07
SEMA3C-209ENST00000487621 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.65■■■■■ 5.06
SEMA3C-209ENST00000487621 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.52■■■■■ 5.04
SEMA3C-209ENST00000487621 CFTRP13569 1480 aa46.33■■■■■ 5.01
SEMA3C-209ENST00000487621 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.32■■■■■ 5.01
SEMA3C-209ENST00000487621 WDR62O43379 1518 aa46.23■■■■■ 4.99
SEMA3C-209ENST00000487621 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.2■■■■■ 4.99
SEMA3C-209ENST00000487621 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.2■■■■■ 4.99
SEMA3C-209ENST00000487621 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.01■■■■■ 4.96
SEMA3C-209ENST00000487621 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.83■■■■■ 4.93
SEMA3C-209ENST00000487621 PRDM2Q13029 1718 aa45.77■■■■■ 4.92
SEMA3C-209ENST00000487621 TOPBP1Q92547 1522 aa45.39■■■■■ 4.86
SEMA3C-209ENST00000487621 IFT140Q96RY7 1462 aa45.29■■■■■ 4.84
SEMA3C-209ENST00000487621 ABCC8Q09428 1581 aa45.29■■■■■ 4.84
SEMA3C-209ENST00000487621 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.24■■■■■ 4.83
SEMA3C-209ENST00000487621 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.21■■■■■ 4.83
SEMA3C-209ENST00000487621 OSCARQ8IYS5 282 aa45.09■■■■■ 4.81
SEMA3C-209ENST00000487621 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.97■■■■■ 4.79
SEMA3C-209ENST00000487621 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.96■■■■■ 4.79
SEMA3C-209ENST00000487621 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.93■■■■■ 4.78
SEMA3C-209ENST00000487621 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.93■■■■■ 4.78
SEMA3C-209ENST00000487621 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.83■■■■■ 4.77
SEMA3C-209ENST00000487621 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.78■■■■■ 4.76
SEMA3C-209ENST00000487621 TRIM41Q8WV44 630 aa44.77■■■■■ 4.76
SEMA3C-209ENST00000487621 CUX1P39880 1505 aa44.76■■■■■ 4.76
SEMA3C-209ENST00000487621 SOGA1O94964 1423 aa44.74■■■■■ 4.75
SEMA3C-209ENST00000487621 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.72■■■■■ 4.75
SEMA3C-209ENST00000487621 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.61■■■■■ 4.73
SEMA3C-209ENST00000487621 WDR97A6NE52 1622 aa44.52■■■■■ 4.72
SEMA3C-209ENST00000487621 CHD1O14646 1710 aa44.47■■■■■ 4.71
SEMA3C-209ENST00000487621 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.46■■■■■ 4.71
SEMA3C-209ENST00000487621 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.46■■■■■ 4.71
SEMA3C-209ENST00000487621 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.46■■■■■ 4.71
SEMA3C-209ENST00000487621 ARHGEF11O15085 1522 aa44.39■■■■■ 4.7
SEMA3C-209ENST00000487621 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.38■■■■■ 4.69
SEMA3C-209ENST00000487621 FBLN2P98095 1184 aa44.37■■■■■ 4.69
SEMA3C-209ENST00000487621 GRIN2BQ13224 1484 aa44.31■■■■■ 4.68
SEMA3C-209ENST00000487621 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.27■■■■■ 4.68
SEMA3C-209ENST00000487621 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.26■■■■■ 4.68
SEMA3C-209ENST00000487621 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.2■■■■■ 4.67
SEMA3C-209ENST00000487621 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.14■■■■■ 4.66
SEMA3C-209ENST00000487621 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.13■■■■■ 4.66
SEMA3C-209ENST00000487621 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.13■■■■■ 4.65
SEMA3C-209ENST00000487621 SYNJ2O15056 1496 aa44.12■■■■■ 4.65
SEMA3C-209ENST00000487621 TOP2BQ02880 1626 aa44.12■■■■■ 4.65
SEMA3C-209ENST00000487621 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.11■■■■■ 4.65
SEMA3C-209ENST00000487621 PBRM1Q86U86 1689 aa44.09■■■■■ 4.65
SEMA3C-209ENST00000487621 SYNJ1O43426 1573 aa44.08■■■■■ 4.65
SEMA3C-209ENST00000487621 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.08■■■■■ 4.65
SEMA3C-209ENST00000487621 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44■■■■■ 4.63
SEMA3C-209ENST00000487621 ARAP1Q96P48 1450 aa44■■■■■ 4.63
SEMA3C-209ENST00000487621 ADAMTS12P58397 1594 aa43.76■■■■■ 4.6
SEMA3C-209ENST00000487621 GRIN2AQ12879 1464 aa43.75■■■■■ 4.59
SEMA3C-209ENST00000487621 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.68■■■■■ 4.58
SEMA3C-209ENST00000487621 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.67■■■■■ 4.58
SEMA3C-209ENST00000487621 NUP160Q12769 1436 aa43.63■■■■■ 4.57
SEMA3C-209ENST00000487621 CEP170Q5SW79 1584 aa43.58■■■■■ 4.57
SEMA3C-209ENST00000487621 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.41■■■■■ 4.54
SEMA3C-209ENST00000487621 SHROOM2Q13796 1616 aa43.37■■■■■ 4.53
SEMA3C-209ENST00000487621 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.32■■■■■ 4.53
SEMA3C-209ENST00000487621 IGF1RP08069 1367 aa43.26■■■■■ 4.52
SEMA3C-209ENST00000487621 KIF27Q86VH2 1401 aa43.25■■■■■ 4.51
SEMA3C-209ENST00000487621 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.14■■■■■ 4.5
SEMA3C-209ENST00000487621 JPH4Q96JJ6 628 aa43.14■■■■■ 4.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms