RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487563.1

PLOD3-215, Transcript of procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, human

TSL 2

Gene PLOD3, Length 712 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLOD3-215	ENST00000487563	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		58.47	■■■■■ 6.95
PLOD3-215	ENST00000487563	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		52.34	■■■■■ 5.97
PLOD3-215	ENST00000487563	ABCC9	O60706	1549 aa		52	■■■■■ 5.92
PLOD3-215	ENST00000487563	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		49.67	■■■■■ 5.54
PLOD3-215	ENST00000487563	NACAD	O15069	1562 aa		49.39	■■■■■ 5.5
PLOD3-215	ENST00000487563	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		49.26	■■■■■ 5.48
PLOD3-215	ENST00000487563	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		48.78	■■■■■ 5.4
PLOD3-215	ENST00000487563	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	48.55	■■■■■ 5.36
PLOD3-215	ENST00000487563	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		48.49	■■■■■ 5.35
PLOD3-215	ENST00000487563	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	48.44	■■■■■ 5.34
PLOD3-215	ENST00000487563	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		48.33	■■■■■ 5.33
PLOD3-215	ENST00000487563	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		48.31	■■■■■ 5.32
PLOD3-215	ENST00000487563	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		48.13	■■■■■ 5.29
PLOD3-215	ENST00000487563	SCRIB	Q14160	1630 aa		47.74	■■■■■ 5.23
PLOD3-215	ENST00000487563	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		47.59	■■■■■ 5.21
PLOD3-215	ENST00000487563	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		46.97	■■■■■ 5.11
PLOD3-215	ENST00000487563	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	46.97	■■■■■ 5.11
PLOD3-215	ENST00000487563	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		46.8	■■■■■ 5.08
PLOD3-215	ENST00000487563	SMARCA4	P51532	1647 aa		45.55	■■■■■ 4.88
PLOD3-215	ENST00000487563	NCAPD3	P42695	1498 aa		45.55	■■■■■ 4.88
PLOD3-215	ENST00000487563	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		45.49	■■■■■ 4.87
PLOD3-215	ENST00000487563	SMARCA2	P51531	1590 aa		45.42	■■■■■ 4.86
PLOD3-215	ENST00000487563	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	45.4	■■■■■ 4.86
PLOD3-215	ENST00000487563	HMGXB3	Q12766	1538 aa		45.29	■■■■■ 4.84
PLOD3-215	ENST00000487563	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	45.12	■■■■■ 4.81
PLOD3-215	ENST00000487563	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		45.07	■■■■■ 4.8
PLOD3-215	ENST00000487563	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		45.05	■■■■■ 4.8
PLOD3-215	ENST00000487563	ERCC6	Q03468	1493 aa		44.93	■■■■■ 4.78
PLOD3-215	ENST00000487563	NES	P48681	1621 aa		44.74	■■■■■ 4.75
PLOD3-215	ENST00000487563	CUX2	O14529	1486 aa		44.66	■■■■■ 4.74
PLOD3-215	ENST00000487563	WIZ	O95785	1651 aa		44.54	■■■■■ 4.72
PLOD3-215	ENST00000487563	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		44.52	■■■■■ 4.72
PLOD3-215	ENST00000487563	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		44.26	■■■■■ 4.68
PLOD3-215	ENST00000487563	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	44.24	■■■■■ 4.67
PLOD3-215	ENST00000487563	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	44.23	■■■■■ 4.67
PLOD3-215	ENST00000487563	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		44.2	■■■■■ 4.67
PLOD3-215	ENST00000487563	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		44.2	■■■■■ 4.67
PLOD3-215	ENST00000487563	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		44.16	■■■■■ 4.66
PLOD3-215	ENST00000487563	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	44.03	■■■■■ 4.64
PLOD3-215	ENST00000487563	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		43.86	■■■■■ 4.61
PLOD3-215	ENST00000487563	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		43.78	■■■■■ 4.6
PLOD3-215	ENST00000487563	CFTR	P13569	1480 aa		43.76	■■■■■ 4.6
PLOD3-215	ENST00000487563	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		43.74	■■■■■ 4.59
PLOD3-215	ENST00000487563	WDR62	O43379	1518 aa		43.71	■■■■■ 4.59
PLOD3-215	ENST00000487563	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		43.49	■■■■■ 4.55
PLOD3-215	ENST00000487563	PRDM2	Q13029	1718 aa		43.41	■■■■■ 4.54
PLOD3-215	ENST00000487563	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	43.32	■■■■■ 4.53
PLOD3-215	ENST00000487563	TOPBP1	Q92547	1522 aa		42.93	■■■■■ 4.46
PLOD3-215	ENST00000487563	ABCC8	Q09428	1581 aa		42.89	■■■■■ 4.46
PLOD3-215	ENST00000487563	IFT140	Q96RY7	1462 aa		42.87	■■■■■ 4.45
PLOD3-215	ENST00000487563	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		42.83	■■■■■ 4.45
PLOD3-215	ENST00000487563	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	42.73	■■■■■ 4.43
PLOD3-215	ENST00000487563	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		42.67	■■■■■ 4.42
PLOD3-215	ENST00000487563	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	42.63	■■■■■ 4.41
PLOD3-215	ENST00000487563	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	42.56	■■■■■ 4.4
PLOD3-215	ENST00000487563	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	42.52	■■■■■ 4.4
PLOD3-215	ENST00000487563	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	42.5	■■■■■ 4.39
PLOD3-215	ENST00000487563	TRIM41	Q8WV44	630 aa		42.49	■■■■■ 4.39
PLOD3-215	ENST00000487563	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	42.39	■■■■■ 4.38	1e-6	■■■■■ 31.1
PLOD3-215	ENST00000487563	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		42.35	■■■■■ 4.37
PLOD3-215	ENST00000487563	SOGA1	O94964	1423 aa		42.34	■■■■■ 4.37
PLOD3-215	ENST00000487563	CUX1	P39880	1505 aa		42.32	■■■■■ 4.37
PLOD3-215	ENST00000487563	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		42.32	■■■■■ 4.37
PLOD3-215	ENST00000487563	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	42.2	■■■■■ 4.35
PLOD3-215	ENST00000487563	CHD1	O14646	1710 aa		42.17	■■■■■ 4.34
PLOD3-215	ENST00000487563	WDR97	A6NE52	1622 aa		42.14	■■■■■ 4.34
PLOD3-215	ENST00000487563	FBLN2	P98095	1184 aa		42.12	■■■■■ 4.33
PLOD3-215	ENST00000487563	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		42.09	■■■■■ 4.33
PLOD3-215	ENST00000487563	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		42.09	■■■■■ 4.33
PLOD3-215	ENST00000487563	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		42.09	■■■■■ 4.33
PLOD3-215	ENST00000487563	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		42.01	■■■■■ 4.32
PLOD3-215	ENST00000487563	ARHGEF11	O15085	1522 aa		42	■■■■■ 4.31
PLOD3-215	ENST00000487563	GRIN2B	Q13224	1484 aa		41.95	■■■■■ 4.31
PLOD3-215	ENST00000487563	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	41.92	■■■■■ 4.3
PLOD3-215	ENST00000487563	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		41.85	■■■■■ 4.29
PLOD3-215	ENST00000487563	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	41.84	■■■■■ 4.29
PLOD3-215	ENST00000487563	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		41.84	■■■■■ 4.29
PLOD3-215	ENST00000487563	PBRM1	Q86U86	1689 aa		41.82	■■■■■ 4.29
PLOD3-215	ENST00000487563	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	41.78	■■■■■ 4.28
PLOD3-215	ENST00000487563	SYNJ2	O15056	1496 aa		41.76	■■■■■ 4.28
PLOD3-215	ENST00000487563	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		41.76	■■■■■ 4.28
PLOD3-215	ENST00000487563	TOP2B	Q02880	1626 aa		41.75	■■■■■ 4.27
PLOD3-215	ENST00000487563	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		41.75	■■■■■ 4.27
PLOD3-215	ENST00000487563	SYNJ1	O43426	1573 aa		41.73	■■■■■ 4.27
PLOD3-215	ENST00000487563	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		41.66	■■■■■ 4.26
PLOD3-215	ENST00000487563	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		41.66	■■■■■ 4.26
PLOD3-215	ENST00000487563	ARAP1	Q96P48	1450 aa		41.6	■■■■■ 4.25
PLOD3-215	ENST00000487563	ADAMTS12	P58397	1594 aa		41.44	■■■■■ 4.22
PLOD3-215	ENST00000487563	GRIN2A	Q12879	1464 aa		41.41	■■■■■ 4.22
PLOD3-215	ENST00000487563	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		41.34	■■■■■ 4.21
PLOD3-215	ENST00000487563	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		41.33	■■■■■ 4.21
PLOD3-215	ENST00000487563	CEP170	Q5SW79	1584 aa		41.22	■■■■■ 4.19
PLOD3-215	ENST00000487563	NUP160	Q12769	1436 aa		41.22	■■■■■ 4.19
PLOD3-215	ENST00000487563	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	41.15	■■■■■ 4.18
PLOD3-215	ENST00000487563	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		41.03	■■■■■ 4.16
PLOD3-215	ENST00000487563	SHROOM2	Q13796	1616 aa		41	■■■■■ 4.15
PLOD3-215	ENST00000487563	KIF27	Q86VH2	1401 aa		40.98	■■■■■ 4.15
PLOD3-215	ENST00000487563	IGF1R	P08069	1367 aa		40.85	■■■■■ 4.13
PLOD3-215	ENST00000487563	CUL7	Q14999	1698 aa		40.85	■■■■■ 4.13
PLOD3-215	ENST00000487563	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		40.84	■■■■■ 4.13

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