RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487421.1

LAMA5-AS1-204, LAMA5 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene LAMA5-AS1, Length 612 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.25■■■■□ 3.87
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LAMA5-AS1-204ENST00000487421 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.33■■■■□ 3.25
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.01■■■■□ 3.03
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.87■■■■□ 3.01
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.57■■■□□ 2.96
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 NACADO15069 1562 aa33.51■■■□□ 2.95
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.42■■■□□ 2.94
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.17■■■□□ 2.9
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.91■■■□□ 2.86
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.81■■■□□ 2.84
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.42■■■□□ 2.78
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.34■■■□□ 2.77
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 SCRIBQ14160 1630 aa32.33■■■□□ 2.77
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.31■■■□□ 2.76
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.28■■■□□ 2.76
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.27■■■□□ 2.76
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.43■■■□□ 2.62
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 ERCC6Q03468 1493 aa31.01■■■□□ 2.55
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 CUX2O14529 1486 aa30.95■■■□□ 2.54
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 NCAPD3P42695 1498 aa30.94■■■□□ 2.54
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.84■■■□□ 2.53
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 NESP48681 1621 aa30.72■■■□□ 2.51
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 SMARCA4P51532 1647 aa30.72■■■□□ 2.51
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 SMARCA2P51531 1590 aa30.71■■■□□ 2.51
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 HMGXB3Q12766 1538 aa30.66■■■□□ 2.5
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LAMA5-AS1-204ENST00000487421 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.48■■■□□ 2.47
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.32■■■□□ 2.44
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.32■■■□□ 2.44
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.3■■■□□ 2.44
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.28■■■□□ 2.44
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.2■■■□□ 2.42
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 TRIM41Q8WV44 630 aa30.08■■■□□ 2.41
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.03■■■□□ 2.4
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.96■■■□□ 2.39
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 WIZO95785 1651 aa29.95■■■□□ 2.39
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 WDR62O43379 1518 aa29.86■■■□□ 2.37
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.79■■■□□ 2.36
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.73■■■□□ 2.35
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 CFTRP13569 1480 aa29.57■■■□□ 2.32
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 OSCARQ8IYS5 282 aa29.57■■■□□ 2.32
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 PRDM2Q13029 1718 aa29.28■■■□□ 2.28
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.22■■■□□ 2.27
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.22■■■□□ 2.27
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.22■■■□□ 2.27
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.18■■■□□ 2.26
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 IFT140Q96RY7 1462 aa29.17■■■□□ 2.26
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 TOPBP1Q92547 1522 aa29.11■■■□□ 2.25
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 ARHGEF11O15085 1522 aa29.07■■■□□ 2.24
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.24
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.99■■■□□ 2.23
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 ABCC8Q09428 1581 aa28.95■■■□□ 2.22
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.94■■■□□ 2.22
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.94■■■□□ 2.22
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 FBLN2P98095 1184 aa28.94■■■□□ 2.22
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 CHD1O14646 1710 aa28.92■■■□□ 2.22
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 ARAP1Q96P48 1450 aa28.76■■■□□ 2.19
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.76■■■□□ 2.19
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 SOGA1O94964 1423 aa28.68■■■□□ 2.18
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.61■■■□□ 2.17
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.57■■■□□ 2.16
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 CUX1P39880 1505 aa28.48■■■□□ 2.15
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.48■■■□□ 2.15
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 SYNJ1O43426 1573 aa28.47■■■□□ 2.15
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 GRIN2BQ13224 1484 aa28.43■■■□□ 2.14
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 WDR97A6NE52 1622 aa28.43■■■□□ 2.14
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 SYNJ2O15056 1496 aa28.37■■■□□ 2.13
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 PBRM1Q86U86 1689 aa28.33■■■□□ 2.13
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.31■■■□□ 2.12
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.17■■■□□ 2.1
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.17■■■□□ 2.1
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.11■■■□□ 2.09
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 GRIN2AQ12879 1464 aa28.07■■■□□ 2.08
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.01■■■□□ 2.08
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 CEP170Q5SW79 1584 aa28.01■■■□□ 2.07
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 ADAMTS12P58397 1594 aa28■■■□□ 2.07
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 NUP160Q12769 1436 aa27.94■■■□□ 2.06
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.9■■■□□ 2.06
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 TOP2BQ02880 1626 aa27.89■■■□□ 2.05
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.88■■■□□ 2.05
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 SHROOM2Q13796 1616 aa27.86■■■□□ 2.05
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
LAMA5-AS1-204ENST00000487421 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.79■■■□□ 2.04
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LAMA5-AS1-204ENST00000487421 JPH4Q96JJ6 628 aa27.76■■■□□ 2.03
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