RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487114.1

MAP7D1-208, Transcript of MAP7 domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene MAP7D1, Length 890 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP7D1-208ENST00000487114 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.11■■■■■ 7.69
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MAP7D1-208ENST00000487114 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.99■■■■■ 6.07
MAP7D1-208ENST00000487114 NACADO15069 1562 aa52.89■■■■■ 6.06
MAP7D1-208ENST00000487114 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.84■■■■■ 6.05
MAP7D1-208ENST00000487114 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.53■■■■■ 6
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MAP7D1-208ENST00000487114 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.9■■■■■ 5.58
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MAP7D1-208ENST00000487114 SMARCA2P51531 1590 aa48.73■■■■■ 5.39
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MAP7D1-208ENST00000487114 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.53■■■■■ 5.36
MAP7D1-208ENST00000487114 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.4■■■■■ 5.34
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MAP7D1-208ENST00000487114 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.02■■■■■ 5.28
MAP7D1-208ENST00000487114 NESP48681 1621 aa47.7■■■■■ 5.23
MAP7D1-208ENST00000487114 ERCC6Q03468 1493 aa47.61■■■■■ 5.21
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MAP7D1-208ENST00000487114 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.41■■■■■ 5.18
MAP7D1-208ENST00000487114 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.29■■■■■ 5.16
MAP7D1-208ENST00000487114 CUX2O14529 1486 aa47.21■■■■■ 5.15
MAP7D1-208ENST00000487114 CFTRP13569 1480 aa47.08■■■■■ 5.13
MAP7D1-208ENST00000487114 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.06■■■■■ 5.12
MAP7D1-208ENST00000487114 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.02■■■■■ 5.12
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MAP7D1-208ENST00000487114 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.85■■■■■ 5.09
MAP7D1-208ENST00000487114 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.81■■■■■ 5.08
MAP7D1-208ENST00000487114 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.79■■■■■ 5.08
MAP7D1-208ENST00000487114 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.63■■■■■ 5.06
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MAP7D1-208ENST00000487114 TOPBP1Q92547 1522 aa46.07■■■■■ 4.97
MAP7D1-208ENST00000487114 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.06■■■■■ 4.96
MAP7D1-208ENST00000487114 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.97■■■■■ 4.95
MAP7D1-208ENST00000487114 IFT140Q96RY7 1462 aa45.85■■■■■ 4.93
MAP7D1-208ENST00000487114 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.67■■■■■ 4.9
MAP7D1-208ENST00000487114 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.65■■■■■ 4.9
MAP7D1-208ENST00000487114 CUX1P39880 1505 aa45.63■■■■■ 4.9
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MAP7D1-208ENST00000487114 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.52■■■■■ 4.88
MAP7D1-208ENST00000487114 SOGA1O94964 1423 aa45.5■■■■■ 4.87
MAP7D1-208ENST00000487114 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.47■■■■■ 4.87
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MAP7D1-208ENST00000487114 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.27■■■■■ 4.84
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MAP7D1-208ENST00000487114 OSCARQ8IYS5 282 aa45.24■■■■■ 4.83
MAP7D1-208ENST00000487114 WDR97A6NE52 1622 aa45.19■■■■■ 4.83
MAP7D1-208ENST00000487114 TOP2BQ02880 1626 aa45.15■■■■■ 4.82
MAP7D1-208ENST00000487114 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.13■■■■■ 4.82
MAP7D1-208ENST00000487114 SYNJ1O43426 1573 aa45.12■■■■■ 4.81
MAP7D1-208ENST00000487114 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.07■■■■■ 4.81
MAP7D1-208ENST00000487114 GRIN2BQ13224 1484 aa44.98■■■■■ 4.79
MAP7D1-208ENST00000487114 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.95■■■■■ 4.79
MAP7D1-208ENST00000487114 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.94■■■■■ 4.78
MAP7D1-208ENST00000487114 FBLN2P98095 1184 aa44.89■■■■■ 4.78
MAP7D1-208ENST00000487114 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.88■■■■■ 4.78
MAP7D1-208ENST00000487114 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.87■■■■■ 4.77
MAP7D1-208ENST00000487114 CHD1O14646 1710 aa44.84■■■■■ 4.77
MAP7D1-208ENST00000487114 PBRM1Q86U86 1689 aa44.77■■■■■ 4.76
MAP7D1-208ENST00000487114 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.74■■■■■ 4.75
MAP7D1-208ENST00000487114 SYNJ2O15056 1496 aa44.72■■■■■ 4.75
MAP7D1-208ENST00000487114 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.52■■■■■ 4.72
MAP7D1-208ENST00000487114 ADAMTS12P58397 1594 aa44.47■■■■■ 4.71
MAP7D1-208ENST00000487114 ARHGEF11O15085 1522 aa44.46■■■■■ 4.71
MAP7D1-208ENST00000487114 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.46■■■■■ 4.71
MAP7D1-208ENST00000487114 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.46■■■■■ 4.71
MAP7D1-208ENST00000487114 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.46■■■■■ 4.71
MAP7D1-208ENST00000487114 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.44■■■■■ 4.7
MAP7D1-208ENST00000487114 TRIM41Q8WV44 630 aa44.43■■■■■ 4.7
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MAP7D1-208ENST00000487114 GRIN2AQ12879 1464 aa44.4■■■■■ 4.7
MAP7D1-208ENST00000487114 KIF27Q86VH2 1401 aa44.36■■■■■ 4.69
MAP7D1-208ENST00000487114 NUP160Q12769 1436 aa44.23■■■■■ 4.67
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MAP7D1-208ENST00000487114 CEP170Q5SW79 1584 aa44.16■■■■■ 4.66
MAP7D1-208ENST00000487114 ARAP1Q96P48 1450 aa44.1■■■■■ 4.65
MAP7D1-208ENST00000487114 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.1■■■■■ 4.65
MAP7D1-208ENST00000487114 CUL7Q14999 1698 aa44.04■■■■■ 4.64
MAP7D1-208ENST00000487114 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.94■■■■■ 4.63
MAP7D1-208ENST00000487114 SHROOM2Q13796 1616 aa43.86■■■■■ 4.61
MAP7D1-208ENST00000487114 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.86■■■■■ 4.61
MAP7D1-208ENST00000487114 JPH4Q96JJ6 628 aa43.79■■■■■ 4.6
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