RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486917.1

PRRT1-208, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene PRRT1, Length 620 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-208ENST00000486917 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.08■■■■□ 3.37
PRRT1-208ENST00000486917 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.5■■■□□ 2.79
PRRT1-208ENST00000486917 ABCC9O60706 1549 aa32.45■■■□□ 2.78
PRRT1-208ENST00000486917 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.91■■■□□ 2.54
PRRT1-208ENST00000486917 NACADO15069 1562 aa30.69■■■□□ 2.5
PRRT1-208ENST00000486917 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.49■■■□□ 2.47
PRRT1-208ENST00000486917 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.34■■■□□ 2.45
PRRT1-208ENST00000486917 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.33■■■□□ 2.45
PRRT1-208ENST00000486917 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.26■■■□□ 2.43
PRRT1-208ENST00000486917 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.14■■■□□ 2.42
PRRT1-208ENST00000486917 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.05■■■□□ 2.4
PRRT1-208ENST00000486917 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
PRRT1-208ENST00000486917 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.83■■■□□ 2.37
PRRT1-208ENST00000486917 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.61■■■□□ 2.33
PRRT1-208ENST00000486917 SCRIBQ14160 1630 aa29.54■■■□□ 2.32
PRRT1-208ENST00000486917 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.37■■■□□ 2.29
PRRT1-208ENST00000486917 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
PRRT1-208ENST00000486917 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.24■■■□□ 2.27
PRRT1-208ENST00000486917 NCAPD3P42695 1498 aa28.3■■■□□ 2.12
PRRT1-208ENST00000486917 SMARCA4P51532 1647 aa28.2■■■□□ 2.1
PRRT1-208ENST00000486917 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.2■■■□□ 2.1
PRRT1-208ENST00000486917 SMARCA2P51531 1590 aa28.14■■■□□ 2.1
PRRT1-208ENST00000486917 HMGXB3Q12766 1538 aa28.12■■■□□ 2.09
PRRT1-208ENST00000486917 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.05■■■□□ 2.08
PRRT1-208ENST00000486917 CUX2O14529 1486 aa28.03■■■□□ 2.08
PRRT1-208ENST00000486917 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
PRRT1-208ENST00000486917 ERCC6Q03468 1493 aa28.01■■■□□ 2.07
PRRT1-208ENST00000486917 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.94■■■□□ 2.06
PRRT1-208ENST00000486917 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
PRRT1-208ENST00000486917 NESP48681 1621 aa27.88■■■□□ 2.05
PRRT1-208ENST00000486917 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.8■■■□□ 2.04
PRRT1-208ENST00000486917 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.71■■■□□ 2.03
PRRT1-208ENST00000486917 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
PRRT1-208ENST00000486917 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.6■■■□□ 2.01
PRRT1-208ENST00000486917 WIZO95785 1651 aa27.5■■□□□ 1.99
PRRT1-208ENST00000486917 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.48■■□□□ 1.99
PRRT1-208ENST00000486917 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.4■■□□□ 1.98
PRRT1-208ENST00000486917 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.27■■□□□ 1.96
PRRT1-208ENST00000486917 WDR62O43379 1518 aa27.26■■□□□ 1.95
PRRT1-208ENST00000486917 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
PRRT1-208ENST00000486917 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.15■■□□□ 1.94
PRRT1-208ENST00000486917 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
PRRT1-208ENST00000486917 CFTRP13569 1480 aa27.11■■□□□ 1.93
PRRT1-208ENST00000486917 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.11■■□□□ 1.93
PRRT1-208ENST00000486917 PRDM2Q13029 1718 aa26.99■■□□□ 1.91
PRRT1-208ENST00000486917 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
PRRT1-208ENST00000486917 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.79■■□□□ 1.88
PRRT1-208ENST00000486917 TRIM41Q8WV44 630 aa26.72■■□□□ 1.87
PRRT1-208ENST00000486917 OSCARQ8IYS5 282 aa26.66■■□□□ 1.86
PRRT1-208ENST00000486917 IFT140Q96RY7 1462 aa26.62■■□□□ 1.85
PRRT1-208ENST00000486917 TOPBP1Q92547 1522 aa26.61■■□□□ 1.85
PRRT1-208ENST00000486917 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
PRRT1-208ENST00000486917 ABCC8Q09428 1581 aa26.54■■□□□ 1.84
PRRT1-208ENST00000486917 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.53■■□□□ 1.84
PRRT1-208ENST00000486917 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
PRRT1-208ENST00000486917 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.43■■□□□ 1.82
PRRT1-208ENST00000486917 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.43■■□□□ 1.82
PRRT1-208ENST00000486917 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.43■■□□□ 1.82
PRRT1-208ENST00000486917 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
PRRT1-208ENST00000486917 CHD1O14646 1710 aa26.34■■□□□ 1.81
PRRT1-208ENST00000486917 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
PRRT1-208ENST00000486917 ARHGEF11O15085 1522 aa26.31■■□□□ 1.8
PRRT1-208ENST00000486917 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.3■■□□□ 1.82e-19■■■■■ 71.9
PRRT1-208ENST00000486917 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.21■■□□□ 1.79
PRRT1-208ENST00000486917 SOGA1O94964 1423 aa26.16■■□□□ 1.78
PRRT1-208ENST00000486917 WDR97A6NE52 1622 aa26.16■■□□□ 1.78
PRRT1-208ENST00000486917 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.15■■□□□ 1.78
PRRT1-208ENST00000486917 CUX1P39880 1505 aa26.13■■□□□ 1.77
PRRT1-208ENST00000486917 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PRRT1-208ENST00000486917 FBLN2P98095 1184 aa26.07■■□□□ 1.76
PRRT1-208ENST00000486917 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.05■■□□□ 1.76
PRRT1-208ENST00000486917 ARAP1Q96P48 1450 aa26.04■■□□□ 1.76
PRRT1-208ENST00000486917 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.03■■□□□ 1.76
PRRT1-208ENST00000486917 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
PRRT1-208ENST00000486917 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.99■■□□□ 1.75
PRRT1-208ENST00000486917 PBRM1Q86U86 1689 aa25.97■■□□□ 1.75
PRRT1-208ENST00000486917 GRIN2BQ13224 1484 aa25.97■■□□□ 1.75
PRRT1-208ENST00000486917 SYNJ1O43426 1573 aa25.95■■□□□ 1.75
PRRT1-208ENST00000486917 SYNJ2O15056 1496 aa25.91■■□□□ 1.74
PRRT1-208ENST00000486917 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
PRRT1-208ENST00000486917 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.88■■□□□ 1.73
PRRT1-208ENST00000486917 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.87■■□□□ 1.73
PRRT1-208ENST00000486917 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.86■■□□□ 1.73
PRRT1-208ENST00000486917 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
PRRT1-208ENST00000486917 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.75■■□□□ 1.71
PRRT1-208ENST00000486917 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
PRRT1-208ENST00000486917 TOP2BQ02880 1626 aa25.71■■□□□ 1.71
PRRT1-208ENST00000486917 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.7■■□□□ 1.7
PRRT1-208ENST00000486917 ADAMTS12P58397 1594 aa25.67■■□□□ 1.7
PRRT1-208ENST00000486917 GRIN2AQ12879 1464 aa25.66■■□□□ 1.7
PRRT1-208ENST00000486917 CEP170Q5SW79 1584 aa25.6■■□□□ 1.69
PRRT1-208ENST00000486917 NUP160Q12769 1436 aa25.57■■□□□ 1.68
PRRT1-208ENST00000486917 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.56■■□□□ 1.68
PRRT1-208ENST00000486917 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.54■■□□□ 1.68
PRRT1-208ENST00000486917 SHROOM2Q13796 1616 aa25.54■■□□□ 1.68
PRRT1-208ENST00000486917 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.54■■□□□ 1.68
PRRT1-208ENST00000486917 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.32■■□□□ 1.64
PRRT1-208ENST00000486917 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
PRRT1-208ENST00000486917 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.27■■□□□ 1.64
PRRT1-208ENST00000486917 JPH4Q96JJ6 628 aa25.24■■□□□ 1.63
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