RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486842.1

NYX-203, Transcript of nyctalopin, humanhuman

TSL 3

Gene NYX, Length 494 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYX-203ENST00000486842 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.03■■■■■ 6.24
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NYX-203ENST00000486842 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.24■■■■■ 4.83
NYX-203ENST00000486842 NACADO15069 1562 aa45.18■■■■■ 4.82
NYX-203ENST00000486842 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.09■■■■■ 4.81
NYX-203ENST00000486842 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.02■■■■■ 4.8
NYX-203ENST00000486842 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.91■■■■■ 4.78
NYX-203ENST00000486842 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.71■■■■■ 4.75
NYX-203ENST00000486842 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.22■■■■■ 4.67
NYX-203ENST00000486842 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.9■■■■■ 4.62
NYX-203ENST00000486842 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.87■■■■■ 4.61
NYX-203ENST00000486842 SCRIBQ14160 1630 aa43.84■■■■■ 4.61
NYX-203ENST00000486842 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.41■■■■■ 4.54
NYX-203ENST00000486842 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.13■■■■■ 4.49
NYX-203ENST00000486842 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.71■■■■■ 4.43
NYX-203ENST00000486842 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.53■■■■■ 4.4
NYX-203ENST00000486842 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.24■■■■■ 4.35
NYX-203ENST00000486842 SMARCA4P51532 1647 aa41.94■■■■■ 4.3
NYX-203ENST00000486842 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.88■■■■■ 4.3
NYX-203ENST00000486842 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.7■■■■■ 4.27
NYX-203ENST00000486842 NCAPD3P42695 1498 aa41.67■■■■■ 4.26
NYX-203ENST00000486842 SMARCA2P51531 1590 aa41.66■■■■■ 4.26
NYX-203ENST00000486842 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.64■■■■■ 4.26
NYX-203ENST00000486842 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.54■■■■■ 4.24
NYX-203ENST00000486842 HMGXB3Q12766 1538 aa41.49■■■■■ 4.23
NYX-203ENST00000486842 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.36■■■■■ 4.21
NYX-203ENST00000486842 WIZO95785 1651 aa41.2■■■■■ 4.19
NYX-203ENST00000486842 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.15■■■■■ 4.18
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NYX-203ENST00000486842 NESP48681 1621 aa40.67■■■■■ 4.1
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NYX-203ENST00000486842 ERCC6Q03468 1493 aa40.52■■■■■ 4.08
NYX-203ENST00000486842 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.45■■■■■ 4.07
NYX-203ENST00000486842 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.3■■■■■ 4.04
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NYX-203ENST00000486842 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.22■■■■■ 4.03
NYX-203ENST00000486842 CFTRP13569 1480 aa40.22■■■■■ 4.03
NYX-203ENST00000486842 CUX2O14529 1486 aa40.11■■■■■ 4.01
NYX-203ENST00000486842 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.09■■■■■ 4.01
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NYX-203ENST00000486842 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40■■■■□ 3.99
NYX-203ENST00000486842 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.96■■■■□ 3.99
NYX-203ENST00000486842 PRDM2Q13029 1718 aa39.95■■■■□ 3.99
NYX-203ENST00000486842 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.9■■■■□ 3.98
NYX-203ENST00000486842 WDR62O43379 1518 aa39.78■■■■□ 3.96
NYX-203ENST00000486842 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.6■■■■□ 3.93
NYX-203ENST00000486842 TOPBP1Q92547 1522 aa39.37■■■■□ 3.89
NYX-203ENST00000486842 ABCC8Q09428 1581 aa39.35■■■■□ 3.89
NYX-203ENST00000486842 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.33■■■■□ 3.89
NYX-203ENST00000486842 IFT140Q96RY7 1462 aa39.11■■■■□ 3.85
NYX-203ENST00000486842 CUX1P39880 1505 aa39.06■■■■□ 3.84
NYX-203ENST00000486842 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.03■■■■□ 3.84
NYX-203ENST00000486842 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.95■■■■□ 3.83
NYX-203ENST00000486842 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.94■■■■□ 3.82
NYX-203ENST00000486842 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.93■■■■□ 3.82
NYX-203ENST00000486842 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.85■■■■□ 3.81
NYX-203ENST00000486842 SOGA1O94964 1423 aa38.85■■■■□ 3.81
NYX-203ENST00000486842 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.85■■■■□ 3.81
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NYX-203ENST00000486842 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.8■■■■□ 3.8
NYX-203ENST00000486842 TOP2BQ02880 1626 aa38.74■■■■□ 3.79
NYX-203ENST00000486842 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.74■■■■□ 3.79
NYX-203ENST00000486842 SYNJ1O43426 1573 aa38.72■■■■□ 3.79
NYX-203ENST00000486842 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.71■■■■□ 3.79
NYX-203ENST00000486842 WDR97A6NE52 1622 aa38.64■■■■□ 3.78
NYX-203ENST00000486842 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.63■■■■□ 3.77
NYX-203ENST00000486842 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.56■■■■□ 3.76
NYX-203ENST00000486842 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.42■■■■□ 3.74
NYX-203ENST00000486842 GRIN2BQ13224 1484 aa38.41■■■■□ 3.74
NYX-203ENST00000486842 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.41■■■■□ 3.74
NYX-203ENST00000486842 OSCARQ8IYS5 282 aa38.41■■■■□ 3.74
NYX-203ENST00000486842 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.36■■■■□ 3.73
NYX-203ENST00000486842 PBRM1Q86U86 1689 aa38.36■■■■□ 3.73
NYX-203ENST00000486842 CHD1O14646 1710 aa38.32■■■■□ 3.73
NYX-203ENST00000486842 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.32■■■■□ 3.72
NYX-203ENST00000486842 FBLN2P98095 1184 aa38.22■■■■□ 3.71
NYX-203ENST00000486842 SYNJ2O15056 1496 aa38.17■■■■□ 3.7
NYX-203ENST00000486842 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.12■■■■□ 3.69
NYX-203ENST00000486842 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.1■■■■□ 3.69
NYX-203ENST00000486842 ADAMTS12P58397 1594 aa38.06■■■■□ 3.68
NYX-203ENST00000486842 KIF27Q86VH2 1401 aa37.99■■■■□ 3.67
NYX-203ENST00000486842 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.97■■■■□ 3.67
NYX-203ENST00000486842 GRIN2AQ12879 1464 aa37.93■■■■□ 3.66
NYX-203ENST00000486842 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.91■■■■□ 3.66
NYX-203ENST00000486842 TRIM41Q8WV44 630 aa37.84■■■■□ 3.65
NYX-203ENST00000486842 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.83■■■■□ 3.65
NYX-203ENST00000486842 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.83■■■■□ 3.65
NYX-203ENST00000486842 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.83■■■■□ 3.65
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NYX-203ENST00000486842 CUL7Q14999 1698 aa37.76■■■■□ 3.64
NYX-203ENST00000486842 NUP160Q12769 1436 aa37.76■■■■□ 3.63
NYX-203ENST00000486842 CEP170Q5SW79 1584 aa37.75■■■■□ 3.63
NYX-203ENST00000486842 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.64■■■■□ 3.62
NYX-203ENST00000486842 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.6■■■■□ 3.61
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NYX-203ENST00000486842 SHROOM2Q13796 1616 aa37.49■■■■□ 3.59
NYX-203ENST00000486842 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.43■■■■□ 3.58
NYX-203ENST00000486842 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.39■■■■□ 3.58
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