RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486790.2

RCC1-212, Transcript of regulator of chromosome condensation 1, humanhuman

TSL 5

Gene RCC1, Length 481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1-212ENST00000486790 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.06■■■■■ 8.17
RCC1-212ENST00000486790 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa59.35■■■■■ 7.09
RCC1-212ENST00000486790 ABCC9O60706 1549 aa59.16■■■■■ 7.06
RCC1-212ENST00000486790 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.5■■■■■ 6.63
RCC1-212ENST00000486790 NACADO15069 1562 aa56.12■■■■■ 6.58
RCC1-212ENST00000486790 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.83■■■■■ 6.53
RCC1-212ENST00000486790 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.36■■■■■ 6.45
RCC1-212ENST00000486790 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55.29■■■■■ 6.44
RCC1-212ENST00000486790 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP55.08■■■■■ 6.41
RCC1-212ENST00000486790 UNC13AQ9UPW8 1703 aa55.06■■■■■ 6.4
RCC1-212ENST00000486790 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.73■■■■■ 6.35
RCC1-212ENST00000486790 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.65■■■■■ 6.34
RCC1-212ENST00000486790 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.62■■■■■ 6.33
RCC1-212ENST00000486790 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.19■■■■■ 6.27
RCC1-212ENST00000486790 SCRIBQ14160 1630 aa53.97■■■■■ 6.23
RCC1-212ENST00000486790 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.49■■■■■ 6.15
RCC1-212ENST00000486790 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.4■■■■■ 6.14
RCC1-212ENST00000486790 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.36■■■■■ 6.13
RCC1-212ENST00000486790 NCAPD3P42695 1498 aa51.74■■■■■ 5.87
RCC1-212ENST00000486790 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.55■■■■■ 5.84
RCC1-212ENST00000486790 SMARCA2P51531 1590 aa51.54■■■■■ 5.84
RCC1-212ENST00000486790 SMARCA4P51532 1647 aa51.52■■■■■ 5.84
RCC1-212ENST00000486790 HMGXB3Q12766 1538 aa51.38■■■■■ 5.82
RCC1-212ENST00000486790 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.36■■■■■ 5.81
RCC1-212ENST00000486790 ERCC6Q03468 1493 aa51.25■■■■■ 5.79
RCC1-212ENST00000486790 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.13■■■■■ 5.78
RCC1-212ENST00000486790 CUX2O14529 1486 aa51.12■■■■■ 5.77
RCC1-212ENST00000486790 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.04■■■■■ 5.76
RCC1-212ENST00000486790 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.96■■■■■ 5.75
RCC1-212ENST00000486790 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.81■■■■■ 5.72
RCC1-212ENST00000486790 NESP48681 1621 aa50.76■■■■■ 5.72
RCC1-212ENST00000486790 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.63■■■■■ 5.7
RCC1-212ENST00000486790 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.4■■■■■ 5.66
RCC1-212ENST00000486790 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.3■■■■■ 5.64
RCC1-212ENST00000486790 WIZO95785 1651 aa50.23■■■■■ 5.63
RCC1-212ENST00000486790 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.19■■■■■ 5.63
RCC1-212ENST00000486790 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa50.19■■■■■ 5.63
RCC1-212ENST00000486790 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.86■■■■■ 5.57
RCC1-212ENST00000486790 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.82■■■■■ 5.57
RCC1-212ENST00000486790 WDR62O43379 1518 aa49.7■■■■■ 5.55
RCC1-212ENST00000486790 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.7■■■■■ 5.55
RCC1-212ENST00000486790 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.69■■■■■ 5.54
RCC1-212ENST00000486790 CFTRP13569 1480 aa49.6■■■■■ 5.53
RCC1-212ENST00000486790 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.6■■■■■ 5.53
RCC1-212ENST00000486790 PRDM2Q13029 1718 aa49.19■■■■■ 5.46
RCC1-212ENST00000486790 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.09■■■■■ 5.45
RCC1-212ENST00000486790 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.07■■■■■ 5.45
RCC1-212ENST00000486790 OSCARQ8IYS5 282 aa48.84■■■■■ 5.41
RCC1-212ENST00000486790 TRIM41Q8WV44 630 aa48.76■■■■■ 5.4
RCC1-212ENST00000486790 ABCC8Q09428 1581 aa48.74■■■■■ 5.39
RCC1-212ENST00000486790 IFT140Q96RY7 1462 aa48.72■■■■■ 5.39
RCC1-212ENST00000486790 TOPBP1Q92547 1522 aa48.64■■■■■ 5.38
RCC1-212ENST00000486790 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.51■■■■■ 5.36
RCC1-212ENST00000486790 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.46■■■■■ 5.35
RCC1-212ENST00000486790 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP48.27■■■■■ 5.32
RCC1-212ENST00000486790 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.17■■■■■ 5.3
RCC1-212ENST00000486790 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.13■■■■■ 5.3
RCC1-212ENST00000486790 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.08■■■■■ 5.296e-9■■■■■ 45.1
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RCC1-212ENST00000486790 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa48.04■■■■■ 5.28
RCC1-212ENST00000486790 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa48.04■■■■■ 5.28
RCC1-212ENST00000486790 SOGA1O94964 1423 aa47.99■■■■■ 5.27
RCC1-212ENST00000486790 ARHGEF11O15085 1522 aa47.91■■■■■ 5.26
RCC1-212ENST00000486790 CHD1O14646 1710 aa47.91■■■■■ 5.26
RCC1-212ENST00000486790 FBLN2P98095 1184 aa47.9■■■■■ 5.26
RCC1-212ENST00000486790 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.9■■■■■ 5.26
RCC1-212ENST00000486790 WDR97A6NE52 1622 aa47.89■■■■■ 5.26
RCC1-212ENST00000486790 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.84■■■■■ 5.25
RCC1-212ENST00000486790 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.81■■■■■ 5.24
RCC1-212ENST00000486790 CUX1P39880 1505 aa47.76■■■■■ 5.24
RCC1-212ENST00000486790 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.72■■■■■ 5.23
RCC1-212ENST00000486790 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.63■■■■■ 5.22
RCC1-212ENST00000486790 CYB5RLQ6IPT4 315 aa47.62■■■■■ 5.21
RCC1-212ENST00000486790 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.61■■■■■ 5.21
RCC1-212ENST00000486790 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.6■■■■■ 5.21
RCC1-212ENST00000486790 GRIN2BQ13224 1484 aa47.59■■■■■ 5.21
RCC1-212ENST00000486790 SYNJ1O43426 1573 aa47.48■■■■■ 5.19
RCC1-212ENST00000486790 SYNJ2O15056 1496 aa47.41■■■■■ 5.18
RCC1-212ENST00000486790 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.41■■■■■ 5.18
RCC1-212ENST00000486790 ARAP1Q96P48 1450 aa47.4■■■■■ 5.18
RCC1-212ENST00000486790 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.35■■■■■ 5.17
RCC1-212ENST00000486790 PBRM1Q86U86 1689 aa47.35■■■■■ 5.17
RCC1-212ENST00000486790 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.34■■■■■ 5.17
RCC1-212ENST00000486790 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.24■■■■■ 5.15
RCC1-212ENST00000486790 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.23■■■■■ 5.15
RCC1-212ENST00000486790 TRHP20396 242 aaPredicted RBP47.16■■■■■ 5.14
RCC1-212ENST00000486790 TOP2BQ02880 1626 aa47.09■■■■■ 5.13
RCC1-212ENST00000486790 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.08■■■■■ 5.13
RCC1-212ENST00000486790 GRIN2AQ12879 1464 aa46.93■■■■■ 5.1
RCC1-212ENST00000486790 ADAMTS12P58397 1594 aa46.88■■■■■ 5.1
RCC1-212ENST00000486790 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.83■■■■■ 5.09
RCC1-212ENST00000486790 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.81■■■■■ 5.08
RCC1-212ENST00000486790 NUP160Q12769 1436 aa46.74■■■■■ 5.07
RCC1-212ENST00000486790 CEP170Q5SW79 1584 aa46.68■■■■■ 5.06
RCC1-212ENST00000486790 SHROOM2Q13796 1616 aa46.52■■■■■ 5.04
RCC1-212ENST00000486790 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.48■■■■■ 5.03
RCC1-212ENST00000486790 JPH4Q96JJ6 628 aa46.35■■■■■ 5.01
RCC1-212ENST00000486790 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP46.32■■■■■ 5.01
RCC1-212ENST00000486790 KIF27Q86VH2 1401 aa46.28■■■■■ 5
RCC1-212ENST00000486790 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.2■■■■■ 4.99
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