RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486514.5

BNC2-209, Transcript of basonuclin 2, humanhuman

TSL 2

Gene BNC2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC2-209ENST00000486514 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.26■■■■■ 7.4
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BNC2-209ENST00000486514 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.93■■■■■ 6.38
BNC2-209ENST00000486514 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.26■■■■■ 5.96
BNC2-209ENST00000486514 NACADO15069 1562 aa51.91■■■■■ 5.9
BNC2-209ENST00000486514 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.66■■■■■ 5.86
BNC2-209ENST00000486514 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.58■■■■■ 5.85
BNC2-209ENST00000486514 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.19■■■■■ 5.79
BNC2-209ENST00000486514 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.18■■■■■ 5.78
BNC2-209ENST00000486514 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.17■■■■■ 5.78
BNC2-209ENST00000486514 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.83■■■■■ 5.73
BNC2-209ENST00000486514 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.78■■■■■ 5.72
BNC2-209ENST00000486514 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.56■■■■■ 5.68
BNC2-209ENST00000486514 SCRIBQ14160 1630 aa50.12■■■■■ 5.61
BNC2-209ENST00000486514 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.02■■■■■ 5.6
BNC2-209ENST00000486514 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.65■■■■■ 5.54
BNC2-209ENST00000486514 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.55■■■■■ 5.52
BNC2-209ENST00000486514 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.49■■■■■ 5.51
BNC2-209ENST00000486514 NCAPD3P42695 1498 aa47.94■■■■■ 5.26
BNC2-209ENST00000486514 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.82■■■■■ 5.25
BNC2-209ENST00000486514 SMARCA4P51532 1647 aa47.79■■■■■ 5.24
BNC2-209ENST00000486514 SMARCA2P51531 1590 aa47.65■■■■■ 5.22
BNC2-209ENST00000486514 HMGXB3Q12766 1538 aa47.59■■■■■ 5.21
BNC2-209ENST00000486514 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.52■■■■■ 5.2
BNC2-209ENST00000486514 ERCC6Q03468 1493 aa47.4■■■■■ 5.18
BNC2-209ENST00000486514 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.34■■■■■ 5.17
BNC2-209ENST00000486514 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.31■■■■■ 5.16
BNC2-209ENST00000486514 CUX2O14529 1486 aa47.3■■■■■ 5.16
BNC2-209ENST00000486514 NESP48681 1621 aa47.26■■■■■ 5.16
BNC2-209ENST00000486514 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.25■■■■■ 5.15
BNC2-209ENST00000486514 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.24■■■■■ 5.15
BNC2-209ENST00000486514 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.85■■■■■ 5.09
BNC2-209ENST00000486514 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.76■■■■■ 5.08
BNC2-209ENST00000486514 WIZO95785 1651 aa46.68■■■■■ 5.06
BNC2-209ENST00000486514 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.63■■■■■ 5.06
BNC2-209ENST00000486514 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.55■■■■■ 5.04
BNC2-209ENST00000486514 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.47■■■■■ 5.03
BNC2-209ENST00000486514 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.24■■■■■ 4.99
BNC2-209ENST00000486514 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.19■■■■■ 4.98
BNC2-209ENST00000486514 WDR62O43379 1518 aa46.1■■■■■ 4.97
BNC2-209ENST00000486514 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.05■■■■■ 4.96
BNC2-209ENST00000486514 CEP164Q9UPV0 1460 aa46■■■■■ 4.95
BNC2-209ENST00000486514 CFTRP13569 1480 aa45.98■■■■■ 4.95
BNC2-209ENST00000486514 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.98■■■■■ 4.95
BNC2-209ENST00000486514 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.63■■■■■ 4.9
BNC2-209ENST00000486514 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.55■■■■■ 4.88
BNC2-209ENST00000486514 PRDM2Q13029 1718 aa45.51■■■■■ 4.88
BNC2-209ENST00000486514 TRIM41Q8WV44 630 aa45.21■■■■■ 4.83
BNC2-209ENST00000486514 TOPBP1Q92547 1522 aa45.11■■■■■ 4.81
BNC2-209ENST00000486514 OSCARQ8IYS5 282 aa45.11■■■■■ 4.81
BNC2-209ENST00000486514 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.08■■■■■ 4.81
BNC2-209ENST00000486514 IFT140Q96RY7 1462 aa45.07■■■■■ 4.81
BNC2-209ENST00000486514 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.94■■■■■ 4.79
BNC2-209ENST00000486514 ABCC8Q09428 1581 aa44.93■■■■■ 4.78
BNC2-209ENST00000486514 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.82■■■■■ 4.76
BNC2-209ENST00000486514 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.74■■■■■ 4.75
BNC2-209ENST00000486514 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.66■■■■■ 4.74
BNC2-209ENST00000486514 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.65■■■■■ 4.74
BNC2-209ENST00000486514 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.61■■■■■ 4.73
BNC2-209ENST00000486514 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.61■■■■■ 4.73
BNC2-209ENST00000486514 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.61■■■■■ 4.73
BNC2-209ENST00000486514 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.53■■■■■ 4.72
BNC2-209ENST00000486514 CHD1O14646 1710 aa44.47■■■■■ 4.71
BNC2-209ENST00000486514 ARHGEF11O15085 1522 aa44.47■■■■■ 4.71
BNC2-209ENST00000486514 SOGA1O94964 1423 aa44.42■■■■■ 4.7
BNC2-209ENST00000486514 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.39■■■■■ 4.7
BNC2-209ENST00000486514 CUX1P39880 1505 aa44.38■■■■■ 4.69
BNC2-209ENST00000486514 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.37■■■■■ 4.69
BNC2-209ENST00000486514 FBLN2P98095 1184 aa44.3■■■■■ 4.68
BNC2-209ENST00000486514 WDR97A6NE52 1622 aa44.2■■■■■ 4.67
BNC2-209ENST00000486514 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.19■■■■■ 4.66
BNC2-209ENST00000486514 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.19■■■■■ 4.66
BNC2-209ENST00000486514 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.11■■■■■ 4.65
BNC2-209ENST00000486514 ARAP1Q96P48 1450 aa44.05■■■■■ 4.64
BNC2-209ENST00000486514 GRIN2BQ13224 1484 aa44.03■■■■■ 4.64
BNC2-209ENST00000486514 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.03■■■■■ 4.64
BNC2-209ENST00000486514 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.97■■■■■ 4.63
BNC2-209ENST00000486514 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.95■■■■■ 4.63
BNC2-209ENST00000486514 PBRM1Q86U86 1689 aa43.91■■■■■ 4.62
BNC2-209ENST00000486514 SYNJ2O15056 1496 aa43.89■■■■■ 4.62
BNC2-209ENST00000486514 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.89■■■■■ 4.62
BNC2-209ENST00000486514 SYNJ1O43426 1573 aa43.88■■■■■ 4.62
BNC2-209ENST00000486514 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.87■■■■■ 4.61
BNC2-209ENST00000486514 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.84■■■■■ 4.61
BNC2-209ENST00000486514 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.66■■■■■ 4.58
BNC2-209ENST00000486514 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.65■■■■■ 4.58
BNC2-209ENST00000486514 TOP2BQ02880 1626 aa43.64■■■■■ 4.58
BNC2-209ENST00000486514 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.58■■■■■ 4.57
BNC2-209ENST00000486514 GRIN2AQ12879 1464 aa43.5■■■■■ 4.55
BNC2-209ENST00000486514 ADAMTS12P58397 1594 aa43.5■■■■■ 4.55
BNC2-209ENST00000486514 CEP170Q5SW79 1584 aa43.38■■■■■ 4.54
BNC2-209ENST00000486514 NUP160Q12769 1436 aa43.35■■■■■ 4.53
BNC2-209ENST00000486514 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.34■■■■■ 4.53
BNC2-209ENST00000486514 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.32■■■■■ 4.53
BNC2-209ENST00000486514 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.3■■■■■ 4.52
BNC2-209ENST00000486514 SHROOM2Q13796 1616 aa43.17■■■■■ 4.5
BNC2-209ENST00000486514 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.92■■■■■ 4.46
BNC2-209ENST00000486514 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.9■■■■■ 4.46
BNC2-209ENST00000486514 JPH4Q96JJ6 628 aa42.86■■■■■ 4.45
BNC2-209ENST00000486514 IGF1RP08069 1367 aa42.77■■■■■ 4.44
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