RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486362.1

TTLL11-205, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 11, humanhuman

TSL 3

Gene TTLL11, Length 453 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11-205ENST00000486362 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.62■■■■□ 3.61
TTLL11-205ENST00000486362 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.42■■■□□ 2.94
TTLL11-205ENST00000486362 ABCC9O60706 1549 aa32.83■■■□□ 2.85
TTLL11-205ENST00000486362 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.55■■■□□ 2.64
TTLL11-205ENST00000486362 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.53■■■□□ 2.64
TTLL11-205ENST00000486362 NACADO15069 1562 aa31.47■■■□□ 2.63
TTLL11-205ENST00000486362 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
TTLL11-205ENST00000486362 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.26■■■□□ 2.59
TTLL11-205ENST00000486362 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.11■■■□□ 2.57
TTLL11-205ENST00000486362 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.71■■■□□ 2.51
TTLL11-205ENST00000486362 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.69■■■□□ 2.5
TTLL11-205ENST00000486362 SCRIBQ14160 1630 aa30.55■■■□□ 2.48
TTLL11-205ENST00000486362 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.54■■■□□ 2.48
TTLL11-205ENST00000486362 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.25■■■□□ 2.43
TTLL11-205ENST00000486362 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.16■■■□□ 2.42
TTLL11-205ENST00000486362 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
TTLL11-205ENST00000486362 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.65■■■□□ 2.34
TTLL11-205ENST00000486362 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.5■■■□□ 2.31
TTLL11-205ENST00000486362 SMARCA4P51532 1647 aa29.19■■■□□ 2.26
TTLL11-205ENST00000486362 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
TTLL11-205ENST00000486362 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.07■■■□□ 2.24
TTLL11-205ENST00000486362 NCAPD3P42695 1498 aa29.06■■■□□ 2.24
TTLL11-205ENST00000486362 SMARCA2P51531 1590 aa29.03■■■□□ 2.24
TTLL11-205ENST00000486362 MROH2BQ7Z745 1585 aa29■■■□□ 2.23
TTLL11-205ENST00000486362 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.9■■■□□ 2.22
TTLL11-205ENST00000486362 HMGXB3Q12766 1538 aa28.89■■■□□ 2.22
TTLL11-205ENST00000486362 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
TTLL11-205ENST00000486362 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
TTLL11-205ENST00000486362 WIZO95785 1651 aa28.66■■■□□ 2.18
TTLL11-205ENST00000486362 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
TTLL11-205ENST00000486362 NESP48681 1621 aa28.37■■■□□ 2.13
TTLL11-205ENST00000486362 ERCC6Q03468 1493 aa28.33■■■□□ 2.13
TTLL11-205ENST00000486362 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.28■■■□□ 2.12
TTLL11-205ENST00000486362 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.23■■■□□ 2.11
TTLL11-205ENST00000486362 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.14■■■□□ 2.1
TTLL11-205ENST00000486362 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.05■■■□□ 2.08
TTLL11-205ENST00000486362 CFTRP13569 1480 aa28.04■■■□□ 2.08
TTLL11-205ENST00000486362 CUX2O14529 1486 aa28■■■□□ 2.07
TTLL11-205ENST00000486362 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.99■■■□□ 2.07
TTLL11-205ENST00000486362 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
TTLL11-205ENST00000486362 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
TTLL11-205ENST00000486362 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.9■■■□□ 2.06
TTLL11-205ENST00000486362 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.88■■■□□ 2.05
TTLL11-205ENST00000486362 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.83■■■□□ 2.05
TTLL11-205ENST00000486362 WDR62O43379 1518 aa27.72■■■□□ 2.03
TTLL11-205ENST00000486362 PRDM2Q13029 1718 aa27.72■■■□□ 2.03
TTLL11-205ENST00000486362 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
TTLL11-205ENST00000486362 ABCC8Q09428 1581 aa27.43■■□□□ 1.98
TTLL11-205ENST00000486362 TOPBP1Q92547 1522 aa27.43■■□□□ 1.98
TTLL11-205ENST00000486362 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.39■■□□□ 1.97
TTLL11-205ENST00000486362 IFT140Q96RY7 1462 aa27.29■■□□□ 1.96
TTLL11-205ENST00000486362 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.21■■□□□ 1.95
TTLL11-205ENST00000486362 CUX1P39880 1505 aa27.21■■□□□ 1.95
TTLL11-205ENST00000486362 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.95
TTLL11-205ENST00000486362 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
TTLL11-205ENST00000486362 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.13■■□□□ 1.93
TTLL11-205ENST00000486362 SOGA1O94964 1423 aa27.11■■□□□ 1.93
TTLL11-205ENST00000486362 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
TTLL11-205ENST00000486362 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.1■■□□□ 1.93
TTLL11-205ENST00000486362 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.05■■□□□ 1.92
TTLL11-205ENST00000486362 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
TTLL11-205ENST00000486362 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.02■■□□□ 1.92
TTLL11-205ENST00000486362 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
TTLL11-205ENST00000486362 TOP2BQ02880 1626 aa26.95■■□□□ 1.91
TTLL11-205ENST00000486362 SYNJ1O43426 1573 aa26.94■■□□□ 1.9
TTLL11-205ENST00000486362 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.92■■□□□ 1.9
TTLL11-205ENST00000486362 WDR97A6NE52 1622 aa26.9■■□□□ 1.9
TTLL11-205ENST00000486362 OSCARQ8IYS5 282 aa26.87■■□□□ 1.89
TTLL11-205ENST00000486362 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.86■■□□□ 1.89
TTLL11-205ENST00000486362 GRIN2BQ13224 1484 aa26.8■■□□□ 1.88
TTLL11-205ENST00000486362 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.79■■□□□ 1.88
TTLL11-205ENST00000486362 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.76■■□□□ 1.87
TTLL11-205ENST00000486362 FBLN2P98095 1184 aa26.76■■□□□ 1.87
TTLL11-205ENST00000486362 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.73■■□□□ 1.87
TTLL11-205ENST00000486362 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
TTLL11-205ENST00000486362 PBRM1Q86U86 1689 aa26.67■■□□□ 1.86
TTLL11-205ENST00000486362 CHD1O14646 1710 aa26.66■■□□□ 1.86
TTLL11-205ENST00000486362 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
TTLL11-205ENST00000486362 SYNJ2O15056 1496 aa26.62■■□□□ 1.85
TTLL11-205ENST00000486362 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.54■■□□□ 1.84
TTLL11-205ENST00000486362 ADAMTS12P58397 1594 aa26.5■■□□□ 1.83
TTLL11-205ENST00000486362 KIF27Q86VH2 1401 aa26.49■■□□□ 1.83
TTLL11-205ENST00000486362 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.48■■□□□ 1.83
TTLL11-205ENST00000486362 GRIN2AQ12879 1464 aa26.45■■□□□ 1.82
TTLL11-205ENST00000486362 TRIM41Q8WV44 630 aa26.42■■□□□ 1.82
TTLL11-205ENST00000486362 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.41■■□□□ 1.82
TTLL11-205ENST00000486362 ARHGEF11O15085 1522 aa26.4■■□□□ 1.82
TTLL11-205ENST00000486362 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.38■■□□□ 1.81
TTLL11-205ENST00000486362 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.38■■□□□ 1.81
TTLL11-205ENST00000486362 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.38■■□□□ 1.81
TTLL11-205ENST00000486362 IGF1RP08069 1367 aa26.37■■□□□ 1.81
TTLL11-205ENST00000486362 NUP160Q12769 1436 aa26.32■■□□□ 1.8
TTLL11-205ENST00000486362 CEP170Q5SW79 1584 aa26.29■■□□□ 1.8
TTLL11-205ENST00000486362 CUL7Q14999 1698 aa26.27■■□□□ 1.8
TTLL11-205ENST00000486362 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.23■■□□□ 1.79
TTLL11-205ENST00000486362 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.21■■□□□ 1.79
TTLL11-205ENST00000486362 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.2■■□□□ 1.79
TTLL11-205ENST00000486362 ARAP1Q96P48 1450 aa26.18■■□□□ 1.78
TTLL11-205ENST00000486362 SHROOM2Q13796 1616 aa26.09■■□□□ 1.77
TTLL11-205ENST00000486362 JPH4Q96JJ6 628 aa26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.4 ms