RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486229.5

NBPF3-212, Transcript of NBPF member 3, humanhuman

TSL 3

Gene NBPF3, Length 933 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3-212ENST00000486229 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.03■■■■■ 6.24
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NBPF3-212ENST00000486229 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.13■■■■■ 4.82
NBPF3-212ENST00000486229 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45■■■■■ 4.79
NBPF3-212ENST00000486229 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.89■■■■■ 4.78
NBPF3-212ENST00000486229 NACADO15069 1562 aa44.88■■■■■ 4.78
NBPF3-212ENST00000486229 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.84■■■■■ 4.77
NBPF3-212ENST00000486229 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.84■■■■■ 4.77
NBPF3-212ENST00000486229 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.77■■■■■ 4.76
NBPF3-212ENST00000486229 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.72■■■■■ 4.59
NBPF3-212ENST00000486229 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.71■■■■■ 4.59
NBPF3-212ENST00000486229 SCRIBQ14160 1630 aa43.59■■■■■ 4.57
NBPF3-212ENST00000486229 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.44■■■■■ 4.54
NBPF3-212ENST00000486229 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.08■■■■■ 4.49
NBPF3-212ENST00000486229 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.61■■■■■ 4.41
NBPF3-212ENST00000486229 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.55■■■■■ 4.4
NBPF3-212ENST00000486229 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.35■■■■■ 4.37
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NBPF3-212ENST00000486229 SMARCA4P51532 1647 aa41.8■■■■■ 4.28
NBPF3-212ENST00000486229 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.57■■■■■ 4.25
NBPF3-212ENST00000486229 SMARCA2P51531 1590 aa41.5■■■■■ 4.23
NBPF3-212ENST00000486229 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.42■■■■■ 4.22
NBPF3-212ENST00000486229 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.4■■■■■ 4.22
NBPF3-212ENST00000486229 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.35■■■■■ 4.21
NBPF3-212ENST00000486229 NCAPD3P42695 1498 aa41.34■■■■■ 4.21
NBPF3-212ENST00000486229 HMGXB3Q12766 1538 aa41.23■■■■■ 4.19
NBPF3-212ENST00000486229 WIZO95785 1651 aa41.18■■■■■ 4.18
NBPF3-212ENST00000486229 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.16■■■■■ 4.18
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NBPF3-212ENST00000486229 ERCC6Q03468 1493 aa40.66■■■■■ 4.1
NBPF3-212ENST00000486229 NESP48681 1621 aa40.32■■■■■ 4.05
NBPF3-212ENST00000486229 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.32■■■■■ 4.04
NBPF3-212ENST00000486229 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.21■■■■■ 4.03
NBPF3-212ENST00000486229 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.16■■■■■ 4.02
NBPF3-212ENST00000486229 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.12■■■■■ 4.01
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NBPF3-212ENST00000486229 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.82■■■■□ 3.96
NBPF3-212ENST00000486229 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.68■■■■□ 3.94
NBPF3-212ENST00000486229 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.62■■■■□ 3.93
NBPF3-212ENST00000486229 TRIM41Q8WV44 630 aa39.49■■■■□ 3.91
NBPF3-212ENST00000486229 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.42■■■■□ 3.9
NBPF3-212ENST00000486229 WDR62O43379 1518 aa39.39■■■■□ 3.9
NBPF3-212ENST00000486229 ABCC8Q09428 1581 aa39.32■■■■□ 3.88
NBPF3-212ENST00000486229 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.17■■■■□ 3.86
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NBPF3-212ENST00000486229 TOPBP1Q92547 1522 aa39.1■■■■□ 3.85
NBPF3-212ENST00000486229 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.06■■■■□ 3.84
NBPF3-212ENST00000486229 CUX1P39880 1505 aa38.98■■■■□ 3.83
NBPF3-212ENST00000486229 OSCARQ8IYS5 282 aa38.92■■■■□ 3.82
NBPF3-212ENST00000486229 TOP2BQ02880 1626 aa38.9■■■■□ 3.82
NBPF3-212ENST00000486229 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.9■■■■□ 3.82
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NBPF3-212ENST00000486229 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.8■■■■□ 3.8
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NBPF3-212ENST00000486229 IFT140Q96RY7 1462 aa38.78■■■■□ 3.8
NBPF3-212ENST00000486229 SOGA1O94964 1423 aa38.7■■■■□ 3.79
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NBPF3-212ENST00000486229 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.58■■■■□ 3.77
NBPF3-212ENST00000486229 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.58■■■■□ 3.77
NBPF3-212ENST00000486229 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.55■■■■□ 3.76
NBPF3-212ENST00000486229 WDR97A6NE52 1622 aa38.54■■■■□ 3.76
NBPF3-212ENST00000486229 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.5■■■■□ 3.75
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NBPF3-212ENST00000486229 ARHGEF11O15085 1522 aa38.36■■■■□ 3.73
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NBPF3-212ENST00000486229 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.31■■■■□ 3.72
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NBPF3-212ENST00000486229 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.27■■■■□ 3.72
NBPF3-212ENST00000486229 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.27■■■■□ 3.72
NBPF3-212ENST00000486229 KIF27Q86VH2 1401 aa38.25■■■■□ 3.71
NBPF3-212ENST00000486229 GRIN2BQ13224 1484 aa38.21■■■■□ 3.71
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NBPF3-212ENST00000486229 CHD1O14646 1710 aa38.01■■■■□ 3.67
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NBPF3-212ENST00000486229 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.75■■■■□ 3.63
NBPF3-212ENST00000486229 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.75■■■■□ 3.63
NBPF3-212ENST00000486229 GRIN2AQ12879 1464 aa37.67■■■■□ 3.62
NBPF3-212ENST00000486229 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.63■■■■□ 3.61
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