RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486217.2

LIN7B-206, Transcript of lin-7 homolog B, crumbs cell polarity complex component, humanhuman

TSL 2

Gene LIN7B, Length 367 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN7B-206ENST00000486217 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.74■■■■■ 6.51
LIN7B-206ENST00000486217 ABCC9O60706 1549 aa50.19■■■■■ 5.62
LIN7B-206ENST00000486217 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.1■■■■■ 5.61
LIN7B-206ENST00000486217 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.74■■■■■ 5.23
LIN7B-206ENST00000486217 NACADO15069 1562 aa47.37■■■■■ 5.17
LIN7B-206ENST00000486217 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.17■■■■■ 5.14
LIN7B-206ENST00000486217 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.08■■■■■ 5.13
LIN7B-206ENST00000486217 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.7■■■■■ 5.07
LIN7B-206ENST00000486217 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.68■■■■■ 5.06
LIN7B-206ENST00000486217 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.63■■■■■ 5.05
LIN7B-206ENST00000486217 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.3■■■■■ 5
LIN7B-206ENST00000486217 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.17■■■■■ 4.98
LIN7B-206ENST00000486217 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.01■■■■■ 4.96
LIN7B-206ENST00000486217 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.68■■■■■ 4.9
LIN7B-206ENST00000486217 SCRIBQ14160 1630 aa45.67■■■■■ 4.9
LIN7B-206ENST00000486217 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.34■■■■■ 4.85
LIN7B-206ENST00000486217 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.21■■■■■ 4.83
LIN7B-206ENST00000486217 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.2■■■■■ 4.83
LIN7B-206ENST00000486217 NCAPD3P42695 1498 aa43.69■■■■■ 4.58
LIN7B-206ENST00000486217 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.56■■■■■ 4.56
LIN7B-206ENST00000486217 SMARCA4P51532 1647 aa43.53■■■■■ 4.56
LIN7B-206ENST00000486217 SMARCA2P51531 1590 aa43.47■■■■■ 4.55
LIN7B-206ENST00000486217 HMGXB3Q12766 1538 aa43.39■■■■■ 4.54
LIN7B-206ENST00000486217 ERCC6Q03468 1493 aa43.38■■■■■ 4.53
LIN7B-206ENST00000486217 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.32■■■■■ 4.53
LIN7B-206ENST00000486217 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.3■■■■■ 4.52
LIN7B-206ENST00000486217 CUX2O14529 1486 aa43.27■■■■■ 4.52
LIN7B-206ENST00000486217 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.19■■■■■ 4.5
LIN7B-206ENST00000486217 NESP48681 1621 aa43.07■■■■■ 4.48
LIN7B-206ENST00000486217 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.07■■■■■ 4.48
LIN7B-206ENST00000486217 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.95■■■■■ 4.47
LIN7B-206ENST00000486217 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.77■■■■■ 4.44
LIN7B-206ENST00000486217 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.66■■■■■ 4.42
LIN7B-206ENST00000486217 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.56■■■■■ 4.4
LIN7B-206ENST00000486217 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.53■■■■■ 4.4
LIN7B-206ENST00000486217 WIZO95785 1651 aa42.47■■■■■ 4.39
LIN7B-206ENST00000486217 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.38■■■■■ 4.37
LIN7B-206ENST00000486217 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.17■■■■■ 4.34
LIN7B-206ENST00000486217 WDR62O43379 1518 aa42.05■■■■■ 4.32
LIN7B-206ENST00000486217 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.02■■■■■ 4.32
LIN7B-206ENST00000486217 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.99■■■■■ 4.31
LIN7B-206ENST00000486217 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.92■■■■■ 4.3
LIN7B-206ENST00000486217 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.91■■■■■ 4.3
LIN7B-206ENST00000486217 CFTRP13569 1480 aa41.86■■■■■ 4.29
LIN7B-206ENST00000486217 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.25
LIN7B-206ENST00000486217 PRDM2Q13029 1718 aa41.53■■■■■ 4.24
LIN7B-206ENST00000486217 TRIM41Q8WV44 630 aa41.48■■■■■ 4.23
LIN7B-206ENST00000486217 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.42■■■■■ 4.22
LIN7B-206ENST00000486217 OSCARQ8IYS5 282 aa41.3■■■■■ 4.2
LIN7B-206ENST00000486217 IFT140Q96RY7 1462 aa41.14■■■■■ 4.18
LIN7B-206ENST00000486217 TOPBP1Q92547 1522 aa41.11■■■■■ 4.17
LIN7B-206ENST00000486217 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.08■■■■■ 4.17
LIN7B-206ENST00000486217 ABCC8Q09428 1581 aa41.03■■■■■ 4.16
LIN7B-206ENST00000486217 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.97■■■■■ 4.15
LIN7B-206ENST00000486217 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.13
LIN7B-206ENST00000486217 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.78■■■■■ 4.12
LIN7B-206ENST00000486217 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.78■■■■■ 4.12
LIN7B-206ENST00000486217 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.78■■■■■ 4.12
LIN7B-206ENST00000486217 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.75■■■■■ 4.11
LIN7B-206ENST00000486217 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.7■■■■■ 4.116e-7■■■■■ 41.6
LIN7B-206ENST00000486217 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.68■■■■■ 4.1
LIN7B-206ENST00000486217 ARHGEF11O15085 1522 aa40.62■■■■■ 4.09
LIN7B-206ENST00000486217 CHD1O14646 1710 aa40.62■■■■■ 4.09
LIN7B-206ENST00000486217 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.54■■■■■ 4.08
LIN7B-206ENST00000486217 SOGA1O94964 1423 aa40.5■■■■■ 4.07
LIN7B-206ENST00000486217 FBLN2P98095 1184 aa40.5■■■■■ 4.07
LIN7B-206ENST00000486217 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.43■■■■■ 4.06
LIN7B-206ENST00000486217 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.43■■■■■ 4.06
LIN7B-206ENST00000486217 CUX1P39880 1505 aa40.37■■■■■ 4.05
LIN7B-206ENST00000486217 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.35■■■■■ 4.05
LIN7B-206ENST00000486217 WDR97A6NE52 1622 aa40.34■■■■■ 4.05
LIN7B-206ENST00000486217 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.3■■■■■ 4.04
LIN7B-206ENST00000486217 ARAP1Q96P48 1450 aa40.21■■■■■ 4.03
LIN7B-206ENST00000486217 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
LIN7B-206ENST00000486217 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.17■■■■■ 4.02
LIN7B-206ENST00000486217 GRIN2BQ13224 1484 aa40.16■■■■■ 4.02
LIN7B-206ENST00000486217 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.16■■■■■ 4.02
LIN7B-206ENST00000486217 SYNJ1O43426 1573 aa40.1■■■■■ 4.01
LIN7B-206ENST00000486217 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.09■■■■■ 4.01
LIN7B-206ENST00000486217 PBRM1Q86U86 1689 aa40.05■■■■■ 4
LIN7B-206ENST00000486217 SYNJ2O15056 1496 aa40.05■■■■■ 4
LIN7B-206ENST00000486217 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.02■■■■■ 4
LIN7B-206ENST00000486217 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.98■■■■□ 3.99
LIN7B-206ENST00000486217 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.95■■■■□ 3.99
LIN7B-206ENST00000486217 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.91■■■■□ 3.98
LIN7B-206ENST00000486217 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.79■■■■□ 3.96
LIN7B-206ENST00000486217 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.72■■■■□ 3.95
LIN7B-206ENST00000486217 TOP2BQ02880 1626 aa39.71■■■■□ 3.95
LIN7B-206ENST00000486217 GRIN2AQ12879 1464 aa39.65■■■■□ 3.94
LIN7B-206ENST00000486217 ADAMTS12P58397 1594 aa39.63■■■■□ 3.94
LIN7B-206ENST00000486217 CEP170Q5SW79 1584 aa39.51■■■■□ 3.92
LIN7B-206ENST00000486217 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.49■■■■□ 3.91
LIN7B-206ENST00000486217 NUP160Q12769 1436 aa39.49■■■■□ 3.91
LIN7B-206ENST00000486217 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.46■■■■□ 3.91
LIN7B-206ENST00000486217 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.46■■■■□ 3.91
LIN7B-206ENST00000486217 SHROOM2Q13796 1616 aa39.35■■■■□ 3.89
LIN7B-206ENST00000486217 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.15■■■■□ 3.86
LIN7B-206ENST00000486217 JPH4Q96JJ6 628 aa39.1■■■■□ 3.85
LIN7B-206ENST00000486217 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.07■■■■□ 3.84
LIN7B-206ENST00000486217 KIF27Q86VH2 1401 aa38.94■■■■□ 3.82
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