RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486076.5

GABPB2-205, Transcript of GA binding protein transcription factor subunit beta 2, humanhuman

TSL 5

Gene GABPB2, Length 833 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB2-205ENST00000486076 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.27■■■■□ 3.88
GABPB2-205ENST00000486076 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.94■■■■□ 3.18
GABPB2-205ENST00000486076 ABCC9O60706 1549 aa34.33■■■■□ 3.09
GABPB2-205ENST00000486076 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.96■■■□□ 2.87
GABPB2-205ENST00000486076 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.9■■■□□ 2.86
GABPB2-205ENST00000486076 NACADO15069 1562 aa32.88■■■□□ 2.85
GABPB2-205ENST00000486076 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.68■■■□□ 2.82
GABPB2-205ENST00000486076 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.63■■■□□ 2.81
GABPB2-205ENST00000486076 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.46■■■□□ 2.79
GABPB2-205ENST00000486076 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.22■■■□□ 2.75
GABPB2-205ENST00000486076 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.08■■■□□ 2.73
GABPB2-205ENST00000486076 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.96■■■□□ 2.71
GABPB2-205ENST00000486076 SCRIBQ14160 1630 aa31.91■■■□□ 2.7
GABPB2-205ENST00000486076 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.6■■■□□ 2.65
GABPB2-205ENST00000486076 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.59■■■□□ 2.65
GABPB2-205ENST00000486076 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
GABPB2-205ENST00000486076 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.03■■■□□ 2.56
GABPB2-205ENST00000486076 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.84■■■□□ 2.53
GABPB2-205ENST00000486076 SMARCA4P51532 1647 aa30.5■■■□□ 2.47
GABPB2-205ENST00000486076 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
GABPB2-205ENST00000486076 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.36■■■□□ 2.45
GABPB2-205ENST00000486076 NCAPD3P42695 1498 aa30.34■■■□□ 2.45
GABPB2-205ENST00000486076 SMARCA2P51531 1590 aa30.31■■■□□ 2.44
GABPB2-205ENST00000486076 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.28■■■□□ 2.44
GABPB2-205ENST00000486076 HMGXB3Q12766 1538 aa30.18■■■□□ 2.42
GABPB2-205ENST00000486076 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.17■■■□□ 2.42
GABPB2-205ENST00000486076 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
GABPB2-205ENST00000486076 WIZO95785 1651 aa29.95■■■□□ 2.38
GABPB2-205ENST00000486076 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
GABPB2-205ENST00000486076 NESP48681 1621 aa29.67■■■□□ 2.34
GABPB2-205ENST00000486076 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
GABPB2-205ENST00000486076 ERCC6Q03468 1493 aa29.6■■■□□ 2.33
GABPB2-205ENST00000486076 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.56■■■□□ 2.32
GABPB2-205ENST00000486076 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.47■■■□□ 2.31
GABPB2-205ENST00000486076 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.38■■■□□ 2.29
GABPB2-205ENST00000486076 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.32■■■□□ 2.28
GABPB2-205ENST00000486076 CUX2O14529 1486 aa29.29■■■□□ 2.28
GABPB2-205ENST00000486076 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.27■■■□□ 2.28
GABPB2-205ENST00000486076 CFTRP13569 1480 aa29.26■■■□□ 2.27
GABPB2-205ENST00000486076 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
GABPB2-205ENST00000486076 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.14■■■□□ 2.26
GABPB2-205ENST00000486076 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.11■■■□□ 2.25
GABPB2-205ENST00000486076 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
GABPB2-205ENST00000486076 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.09■■■□□ 2.25
GABPB2-205ENST00000486076 PRDM2Q13029 1718 aa29.04■■■□□ 2.24
GABPB2-205ENST00000486076 WDR62O43379 1518 aa28.97■■■□□ 2.23
GABPB2-205ENST00000486076 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
GABPB2-205ENST00000486076 TOPBP1Q92547 1522 aa28.66■■■□□ 2.18
GABPB2-205ENST00000486076 ABCC8Q09428 1581 aa28.63■■■□□ 2.17
GABPB2-205ENST00000486076 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.61■■■□□ 2.17
GABPB2-205ENST00000486076 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.53■■■□□ 2.16
GABPB2-205ENST00000486076 IFT140Q96RY7 1462 aa28.5■■■□□ 2.15
GABPB2-205ENST00000486076 CUX1P39880 1505 aa28.41■■■□□ 2.14
GABPB2-205ENST00000486076 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
GABPB2-205ENST00000486076 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
GABPB2-205ENST00000486076 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
GABPB2-205ENST00000486076 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.33■■■□□ 2.13
GABPB2-205ENST00000486076 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.3■■■□□ 2.12
GABPB2-205ENST00000486076 SOGA1O94964 1423 aa28.29■■■□□ 2.12
GABPB2-205ENST00000486076 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
GABPB2-205ENST00000486076 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.22■■■□□ 2.11
GABPB2-205ENST00000486076 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.18■■■□□ 2.1
GABPB2-205ENST00000486076 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
GABPB2-205ENST00000486076 TOP2BQ02880 1626 aa28.13■■■□□ 2.09
GABPB2-205ENST00000486076 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.12■■■□□ 2.09
GABPB2-205ENST00000486076 SYNJ1O43426 1573 aa28.11■■■□□ 2.09
GABPB2-205ENST00000486076 WDR97A6NE52 1622 aa28.1■■■□□ 2.09
GABPB2-205ENST00000486076 OSCARQ8IYS5 282 aa28.09■■■□□ 2.09
GABPB2-205ENST00000486076 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.04■■■□□ 2.08
GABPB2-205ENST00000486076 GRIN2BQ13224 1484 aa27.97■■■□□ 2.07
GABPB2-205ENST00000486076 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.96■■■□□ 2.07
GABPB2-205ENST00000486076 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.96■■■□□ 2.07
GABPB2-205ENST00000486076 CHD1O14646 1710 aa27.94■■■□□ 2.06
GABPB2-205ENST00000486076 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.93■■■□□ 2.06
GABPB2-205ENST00000486076 FBLN2P98095 1184 aa27.93■■■□□ 2.06
GABPB2-205ENST00000486076 PBRM1Q86U86 1689 aa27.91■■■□□ 2.06
GABPB2-205ENST00000486076 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
GABPB2-205ENST00000486076 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
GABPB2-205ENST00000486076 SYNJ2O15056 1496 aa27.79■■■□□ 2.04
GABPB2-205ENST00000486076 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.7■■■□□ 2.02
GABPB2-205ENST00000486076 ADAMTS12P58397 1594 aa27.68■■■□□ 2.02
GABPB2-205ENST00000486076 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.65■■■□□ 2.02
GABPB2-205ENST00000486076 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.65■■■□□ 2.02
GABPB2-205ENST00000486076 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.65■■■□□ 2.02
GABPB2-205ENST00000486076 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.64■■■□□ 2.02
GABPB2-205ENST00000486076 ARHGEF11O15085 1522 aa27.62■■■□□ 2.01
GABPB2-205ENST00000486076 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.62■■■□□ 2.01
GABPB2-205ENST00000486076 KIF27Q86VH2 1401 aa27.6■■■□□ 2.01
GABPB2-205ENST00000486076 GRIN2AQ12879 1464 aa27.6■■■□□ 2.01
GABPB2-205ENST00000486076 TRIM41Q8WV44 630 aa27.59■■■□□ 2.01
GABPB2-205ENST00000486076 IGF1RP08069 1367 aa27.5■■□□□ 1.99
GABPB2-205ENST00000486076 NUP160Q12769 1436 aa27.49■■□□□ 1.99
GABPB2-205ENST00000486076 CEP170Q5SW79 1584 aa27.48■■□□□ 1.99
GABPB2-205ENST00000486076 CUL7Q14999 1698 aa27.43■■□□□ 1.98
GABPB2-205ENST00000486076 ARAP1Q96P48 1450 aa27.4■■□□□ 1.98
GABPB2-205ENST00000486076 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.4■■□□□ 1.98
GABPB2-205ENST00000486076 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.35■■□□□ 1.97
GABPB2-205ENST00000486076 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.34■■□□□ 1.97
GABPB2-205ENST00000486076 SHROOM2Q13796 1616 aa27.28■■□□□ 1.96
GABPB2-205ENST00000486076 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.25■■□□□ 1.95
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