RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486028.1

HMG20B-211, Transcript of high mobility group 20B, humanhuman

TSL 2

Gene HMG20B, Length 719 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20B-211ENST00000486028 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.04■■■□□ 2.4
HMG20B-211ENST00000486028 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.64■■□□□ 1.85
HMG20B-211ENST00000486028 ABCC9O60706 1549 aa26.14■■□□□ 1.77
HMG20B-211ENST00000486028 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.22■■□□□ 1.63
HMG20B-211ENST00000486028 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.13■■□□□ 1.61
HMG20B-211ENST00000486028 NACADO15069 1562 aa25.11■■□□□ 1.61
HMG20B-211ENST00000486028 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
HMG20B-211ENST00000486028 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.96■■□□□ 1.59
HMG20B-211ENST00000486028 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.86■■□□□ 1.57
HMG20B-211ENST00000486028 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.49■■□□□ 1.51
HMG20B-211ENST00000486028 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.46■■□□□ 1.51
HMG20B-211ENST00000486028 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.43■■□□□ 1.5
HMG20B-211ENST00000486028 SCRIBQ14160 1630 aa24.34■■□□□ 1.49
HMG20B-211ENST00000486028 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.33■■□□□ 1.48
HMG20B-211ENST00000486028 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.12■■□□□ 1.45
HMG20B-211ENST00000486028 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.02■■□□□ 1.44
HMG20B-211ENST00000486028 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
HMG20B-211ENST00000486028 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
HMG20B-211ENST00000486028 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.61■■□□□ 1.37
HMG20B-211ENST00000486028 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.49■■□□□ 1.35
HMG20B-211ENST00000486028 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
HMG20B-211ENST00000486028 SMARCA4P51532 1647 aa23.27■■□□□ 1.32
HMG20B-211ENST00000486028 NCAPD3P42695 1498 aa23.2■■□□□ 1.3
HMG20B-211ENST00000486028 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.19■■□□□ 1.3
HMG20B-211ENST00000486028 SMARCA2P51531 1590 aa23.16■■□□□ 1.3
HMG20B-211ENST00000486028 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.14■■□□□ 1.3
HMG20B-211ENST00000486028 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.05■■□□□ 1.28
HMG20B-211ENST00000486028 HMGXB3Q12766 1538 aa23.03■■□□□ 1.28
HMG20B-211ENST00000486028 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
HMG20B-211ENST00000486028 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
HMG20B-211ENST00000486028 WIZO95785 1651 aa22.87■■□□□ 1.25
HMG20B-211ENST00000486028 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
HMG20B-211ENST00000486028 NESP48681 1621 aa22.6■■□□□ 1.21
HMG20B-211ENST00000486028 ERCC6Q03468 1493 aa22.56■■□□□ 1.2
HMG20B-211ENST00000486028 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.55■■□□□ 1.2
HMG20B-211ENST00000486028 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.54■■□□□ 1.2
HMG20B-211ENST00000486028 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.46■■□□□ 1.19
HMG20B-211ENST00000486028 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.41■■□□□ 1.18
HMG20B-211ENST00000486028 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
HMG20B-211ENST00000486028 CFTRP13569 1480 aa22.38■■□□□ 1.17
HMG20B-211ENST00000486028 CUX2O14529 1486 aa22.29■■□□□ 1.16
HMG20B-211ENST00000486028 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.26■■□□□ 1.15
HMG20B-211ENST00000486028 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.26■■□□□ 1.15
HMG20B-211ENST00000486028 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.22■■□□□ 1.15
HMG20B-211ENST00000486028 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
HMG20B-211ENST00000486028 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.19■■□□□ 1.14
HMG20B-211ENST00000486028 PRDM2Q13029 1718 aa22.09■■□□□ 1.13
HMG20B-211ENST00000486028 WDR62O43379 1518 aa22.08■■□□□ 1.13
HMG20B-211ENST00000486028 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
HMG20B-211ENST00000486028 ABCC8Q09428 1581 aa21.93■■□□□ 1.1
HMG20B-211ENST00000486028 TOPBP1Q92547 1522 aa21.88■■□□□ 1.09
HMG20B-211ENST00000486028 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.84■■□□□ 1.09
HMG20B-211ENST00000486028 IFT140Q96RY7 1462 aa21.77■■□□□ 1.08
HMG20B-211ENST00000486028 CUX1P39880 1505 aa21.71■■□□□ 1.07
HMG20B-211ENST00000486028 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
HMG20B-211ENST00000486028 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.68■■□□□ 1.06
HMG20B-211ENST00000486028 SOGA1O94964 1423 aa21.66■■□□□ 1.06
HMG20B-211ENST00000486028 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
HMG20B-211ENST00000486028 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.64■■□□□ 1.06
HMG20B-211ENST00000486028 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.61■■□□□ 1.05
HMG20B-211ENST00000486028 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
HMG20B-211ENST00000486028 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.61■■□□□ 1.05
HMG20B-211ENST00000486028 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
HMG20B-211ENST00000486028 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.048e-12■□□□□ 9.2
HMG20B-211ENST00000486028 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
HMG20B-211ENST00000486028 TOP2BQ02880 1626 aa21.51■■□□□ 1.03
HMG20B-211ENST00000486028 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
HMG20B-211ENST00000486028 SYNJ1O43426 1573 aa21.49■■□□□ 1.03
HMG20B-211ENST00000486028 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.48■■□□□ 1.03
HMG20B-211ENST00000486028 OSCARQ8IYS5 282 aa21.46■■□□□ 1.03
HMG20B-211ENST00000486028 WDR97A6NE52 1622 aa21.45■■□□□ 1.02
HMG20B-211ENST00000486028 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.45■■□□□ 1.02
HMG20B-211ENST00000486028 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.39■■□□□ 1.02
HMG20B-211ENST00000486028 GRIN2BQ13224 1484 aa21.39■■□□□ 1.01
HMG20B-211ENST00000486028 FBLN2P98095 1184 aa21.36■■□□□ 1.01
HMG20B-211ENST00000486028 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.33■■□□□ 1.01
HMG20B-211ENST00000486028 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
HMG20B-211ENST00000486028 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
HMG20B-211ENST00000486028 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.3■■□□□ 1
HMG20B-211ENST00000486028 SYNJ2O15056 1496 aa21.24■□□□□ 0.99
HMG20B-211ENST00000486028 PBRM1Q86U86 1689 aa21.24■□□□□ 0.99
HMG20B-211ENST00000486028 CHD1O14646 1710 aa21.22■□□□□ 0.99
HMG20B-211ENST00000486028 KIF27Q86VH2 1401 aa21.19■□□□□ 0.98
HMG20B-211ENST00000486028 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.19■□□□□ 0.98
HMG20B-211ENST00000486028 TRIM41Q8WV44 630 aa21.18■□□□□ 0.98
HMG20B-211ENST00000486028 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.15■□□□□ 0.98
HMG20B-211ENST00000486028 IGF1RP08069 1367 aa21.1■□□□□ 0.97
HMG20B-211ENST00000486028 ADAMTS12P58397 1594 aa21.1■□□□□ 0.97
HMG20B-211ENST00000486028 GRIN2AQ12879 1464 aa21.08■□□□□ 0.97
HMG20B-211ENST00000486028 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.03■□□□□ 0.96
HMG20B-211ENST00000486028 ARHGEF11O15085 1522 aa21■□□□□ 0.95
HMG20B-211ENST00000486028 NUP160Q12769 1436 aa21■□□□□ 0.95
HMG20B-211ENST00000486028 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.98■□□□□ 0.95
HMG20B-211ENST00000486028 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.98■□□□□ 0.95
HMG20B-211ENST00000486028 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.98■□□□□ 0.95
HMG20B-211ENST00000486028 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.98■□□□□ 0.95
HMG20B-211ENST00000486028 CUL7Q14999 1698 aa20.96■□□□□ 0.95
HMG20B-211ENST00000486028 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.94■□□□□ 0.94
HMG20B-211ENST00000486028 CEP170Q5SW79 1584 aa20.94■□□□□ 0.94
HMG20B-211ENST00000486028 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.91■□□□□ 0.94
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