RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485941.2

NBPF3-211, Transcript of NBPF member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NBPF3, Length 921 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3-211ENST00000485941 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.93■■■■■ 7.02
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NBPF3-211ENST00000485941 NACADO15069 1562 aa50.03■■■■■ 5.6
NBPF3-211ENST00000485941 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.94■■■■■ 5.59
NBPF3-211ENST00000485941 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.56■■■■■ 5.52
NBPF3-211ENST00000485941 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.4■■■■■ 5.5
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NBPF3-211ENST00000485941 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.23■■■■■ 5.47
NBPF3-211ENST00000485941 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.02■■■■■ 5.44
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NBPF3-211ENST00000485941 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.29■■■■■ 5.32
NBPF3-211ENST00000485941 SCRIBQ14160 1630 aa48.09■■■■■ 5.29
NBPF3-211ENST00000485941 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.85■■■■■ 5.25
NBPF3-211ENST00000485941 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.75■■■■■ 5.23
NBPF3-211ENST00000485941 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.72■■■■■ 5.23
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NBPF3-211ENST00000485941 SMARCA4P51532 1647 aa45.94■■■■■ 4.94
NBPF3-211ENST00000485941 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.88■■■■■ 4.94
NBPF3-211ENST00000485941 SMARCA2P51531 1590 aa45.86■■■■■ 4.93
NBPF3-211ENST00000485941 HMGXB3Q12766 1538 aa45.84■■■■■ 4.93
NBPF3-211ENST00000485941 CUX2O14529 1486 aa45.71■■■■■ 4.91
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NBPF3-211ENST00000485941 ERCC6Q03468 1493 aa45.63■■■■■ 4.9
NBPF3-211ENST00000485941 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.59■■■■■ 4.89
NBPF3-211ENST00000485941 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.52■■■■■ 4.88
NBPF3-211ENST00000485941 NESP48681 1621 aa45.51■■■■■ 4.88
NBPF3-211ENST00000485941 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.4■■■■■ 4.86
NBPF3-211ENST00000485941 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.14■■■■■ 4.82
NBPF3-211ENST00000485941 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.07■■■■■ 4.8
NBPF3-211ENST00000485941 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.86■■■■■ 4.77
NBPF3-211ENST00000485941 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.85■■■■■ 4.77
NBPF3-211ENST00000485941 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.8■■■■■ 4.76
NBPF3-211ENST00000485941 WIZO95785 1651 aa44.79■■■■■ 4.76
NBPF3-211ENST00000485941 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.5■■■■■ 4.71
NBPF3-211ENST00000485941 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.44■■■■■ 4.7
NBPF3-211ENST00000485941 WDR62O43379 1518 aa44.44■■■■■ 4.7
NBPF3-211ENST00000485941 CFTRP13569 1480 aa44.29■■■■■ 4.68
NBPF3-211ENST00000485941 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.27■■■■■ 4.68
NBPF3-211ENST00000485941 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.24■■■■■ 4.67
NBPF3-211ENST00000485941 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.23■■■■■ 4.67
NBPF3-211ENST00000485941 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.94■■■■■ 4.63
NBPF3-211ENST00000485941 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.77■■■■■ 4.6
NBPF3-211ENST00000485941 PRDM2Q13029 1718 aa43.7■■■■■ 4.59
NBPF3-211ENST00000485941 TRIM41Q8WV44 630 aa43.63■■■■■ 4.57
NBPF3-211ENST00000485941 OSCARQ8IYS5 282 aa43.58■■■■■ 4.57
NBPF3-211ENST00000485941 IFT140Q96RY7 1462 aa43.43■■■■■ 4.54
NBPF3-211ENST00000485941 TOPBP1Q92547 1522 aa43.42■■■■■ 4.54
NBPF3-211ENST00000485941 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.41■■■■■ 4.54
NBPF3-211ENST00000485941 ABCC8Q09428 1581 aa43.29■■■■■ 4.52
NBPF3-211ENST00000485941 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.22■■■■■ 4.51
NBPF3-211ENST00000485941 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.1■■■■■ 4.49
NBPF3-211ENST00000485941 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.08■■■■■ 4.49
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NBPF3-211ENST00000485941 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.03■■■■■ 4.48
NBPF3-211ENST00000485941 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.03■■■■■ 4.48
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NBPF3-211ENST00000485941 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.81■■■■■ 4.44
NBPF3-211ENST00000485941 CHD1O14646 1710 aa42.76■■■■■ 4.44
NBPF3-211ENST00000485941 SOGA1O94964 1423 aa42.74■■■■■ 4.43
NBPF3-211ENST00000485941 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.68■■■■■ 4.42
NBPF3-211ENST00000485941 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.66■■■■■ 4.42
NBPF3-211ENST00000485941 CUX1P39880 1505 aa42.65■■■■■ 4.42
NBPF3-211ENST00000485941 WDR97A6NE52 1622 aa42.58■■■■■ 4.41
NBPF3-211ENST00000485941 FBLN2P98095 1184 aa42.56■■■■■ 4.4
NBPF3-211ENST00000485941 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.54■■■■■ 4.4
NBPF3-211ENST00000485941 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.5■■■■■ 4.39
NBPF3-211ENST00000485941 ARAP1Q96P48 1450 aa42.5■■■■■ 4.39
NBPF3-211ENST00000485941 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.41■■■■■ 4.38
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NBPF3-211ENST00000485941 GRIN2BQ13224 1484 aa42.38■■■■■ 4.38
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NBPF3-211ENST00000485941 SYNJ2O15056 1496 aa42.27■■■■■ 4.36
NBPF3-211ENST00000485941 SYNJ1O43426 1573 aa42.23■■■■■ 4.35
NBPF3-211ENST00000485941 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.22■■■■■ 4.35
NBPF3-211ENST00000485941 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.21■■■■■ 4.35
NBPF3-211ENST00000485941 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.2■■■■■ 4.35
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NBPF3-211ENST00000485941 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.14■■■■■ 4.34
NBPF3-211ENST00000485941 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42■■■■■ 4.31
NBPF3-211ENST00000485941 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.95■■■■■ 4.31
NBPF3-211ENST00000485941 TOP2BQ02880 1626 aa41.91■■■■■ 4.3
NBPF3-211ENST00000485941 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.91■■■■■ 4.3
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NBPF3-211ENST00000485941 ADAMTS12P58397 1594 aa41.8■■■■■ 4.28
NBPF3-211ENST00000485941 NUP160Q12769 1436 aa41.78■■■■■ 4.28
NBPF3-211ENST00000485941 CEP170Q5SW79 1584 aa41.72■■■■■ 4.27
NBPF3-211ENST00000485941 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.71■■■■■ 4.27
NBPF3-211ENST00000485941 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.69■■■■■ 4.27
NBPF3-211ENST00000485941 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.65■■■■■ 4.26
NBPF3-211ENST00000485941 SHROOM2Q13796 1616 aa41.59■■■■■ 4.25
NBPF3-211ENST00000485941 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.3■■■■■ 4.2
NBPF3-211ENST00000485941 JPH4Q96JJ6 628 aa41.3■■■■■ 4.2
NBPF3-211ENST00000485941 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.22■■■■■ 4.19
NBPF3-211ENST00000485941 IGF1RP08069 1367 aa41.16■■■■■ 4.18
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