RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485623.5

ATG16L1-216, Transcript of autophagy related 16 like 1, humanhuman

TSL 2

Gene ATG16L1, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1-216ENST00000485623 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.34■■■■□ 3.41
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ATG16L1-216ENST00000485623 SYNJ1O43426 1573 aa25.95■■□□□ 1.75
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ATG16L1-216ENST00000485623 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.85■■□□□ 1.73
ATG16L1-216ENST00000485623 FBLN2P98095 1184 aa25.84■■□□□ 1.73
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ATG16L1-216ENST00000485623 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.81■■□□□ 1.72
ATG16L1-216ENST00000485623 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
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ATG16L1-216ENST00000485623 ARHGEF11O15085 1522 aa25.61■■□□□ 1.69
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ATG16L1-216ENST00000485623 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.59■■□□□ 1.69
ATG16L1-216ENST00000485623 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.59■■□□□ 1.69
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ATG16L1-216ENST00000485623 KIF27Q86VH2 1401 aa25.51■■□□□ 1.67
ATG16L1-216ENST00000485623 NUP160Q12769 1436 aa25.48■■□□□ 1.67
ATG16L1-216ENST00000485623 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.45■■□□□ 1.66
ATG16L1-216ENST00000485623 CEP170Q5SW79 1584 aa25.41■■□□□ 1.66
ATG16L1-216ENST00000485623 ARAP1Q96P48 1450 aa25.4■■□□□ 1.66
ATG16L1-216ENST00000485623 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.31■■□□□ 1.64
ATG16L1-216ENST00000485623 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.27■■□□□ 1.64
ATG16L1-216ENST00000485623 CUL7Q14999 1698 aa25.27■■□□□ 1.64
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ATG16L1-216ENST00000485623 SHROOM2Q13796 1616 aa25.25■■□□□ 1.63
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